MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007643	ACA	2	6	19882	19887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591358
502	NC_007643	CCG	2	6	19909	19914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
503	NC_007643	GCC	2	6	19918	19923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
504	NC_007643	GAA	2	6	19926	19931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591358
505	NC_007643	TCA	2	6	20071	20076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591358
506	NC_007643	CAT	2	6	20147	20152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591358
507	NC_007643	CGG	3	9	20153	20161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591358
508	NC_007643	CGG	2	6	20164	20169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591358
509	NC_007643	AGC	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591358
510	NC_007643	GC	3	6	20192	20197	0 %	0 %	50 %	50 %	83591358
511	NC_007643	CGG	2	6	20240	20245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591358
512	NC_007643	CTG	2	6	20247	20252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591358
513	NC_007643	CGT	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591358
514	NC_007643	CTG	2	6	20310	20315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591358
515	NC_007643	GC	3	6	20316	20321	0 %	0 %	50 %	50 %	83591358
516	NC_007643	CCT	2	6	20365	20370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591358
517	NC_007643	ACG	2	6	20392	20397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591358
518	NC_007643	GC	3	6	20427	20432	0 %	0 %	50 %	50 %	83591358
519	NC_007643	GCG	2	6	20461	20466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591358
520	NC_007643	GGT	3	9	20567	20575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591358
521	NC_007643	CGG	3	9	20579	20587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591358
522	NC_007643	GC	4	8	20629	20636	0 %	0 %	50 %	50 %	83591358
523	NC_007643	CGC	2	6	20655	20660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
524	NC_007643	GC	3	6	20780	20785	0 %	0 %	50 %	50 %	83591358
525	NC_007643	GCAT	2	8	20791	20798	25 %	25 %	25 %	25 %	83591358
526	NC_007643	GCC	2	6	20821	20826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
527	NC_007643	GATC	2	8	20966	20973	25 %	25 %	25 %	25 %	83591358
528	NC_007643	CGC	2	6	21008	21013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
529	NC_007643	GCG	2	6	21028	21033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591358
530	NC_007643	TGG	2	6	21040	21045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591358
531	NC_007643	CGC	2	6	21071	21076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
532	NC_007643	CCG	2	6	21086	21091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
533	NC_007643	GCC	3	9	21108	21116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
534	NC_007643	GCC	2	6	21129	21134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591358
535	NC_007643	C	6	6	21133	21138	0 %	0 %	0 %	100 %	83591358
536	NC_007643	GA	3	6	21151	21156	50 %	0 %	50 %	0 %	83591358
537	NC_007643	CCG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_007643	TCG	2	6	21231	21236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
539	NC_007643	CGC	2	6	21253	21258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
540	NC_007643	GCC	2	6	21269	21274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
541	NC_007643	CGG	2	6	21347	21352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
542	NC_007643	GGT	2	6	21355	21360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
543	NC_007643	TTC	2	6	21467	21472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591359
544	NC_007643	CCG	2	6	21484	21489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
545	NC_007643	CAC	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
546	NC_007643	CG	3	6	21504	21509	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
547	NC_007643	CCGG	2	8	21510	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
548	NC_007643	AGG	2	6	21564	21569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591359
549	NC_007643	TGGC	2	8	21622	21629	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
550	NC_007643	GCG	2	6	21720	21725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
551	NC_007643	CCG	2	6	21760	21765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
552	NC_007643	ATC	2	6	21836	21841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591359
553	NC_007643	CGA	2	6	21895	21900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
554	NC_007643	ACC	2	6	21927	21932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
555	NC_007643	TTC	2	6	22070	22075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591359
556	NC_007643	GGT	2	6	22102	22107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
557	NC_007643	CGG	2	6	22114	22119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
558	NC_007643	GCC	2	6	22130	22135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
559	NC_007643	GCT	2	6	22153	22158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
560	NC_007643	GCCGG	2	10	22161	22170	0 %	0 %	60 %	40 %	83591359
561	NC_007643	CCGG	3	12	22167	22178	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
562	NC_007643	CAC	2	6	22241	22246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
563	NC_007643	CGG	2	6	22296	22301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
564	NC_007643	CGC	2	6	22306	22311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
565	NC_007643	GGT	2	6	22327	22332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
566	NC_007643	TCACCA	2	12	22371	22382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	83591359
567	NC_007643	CTG	2	6	22391	22396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
568	NC_007643	TCG	2	6	22398	22403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
569	NC_007643	CGG	2	6	22468	22473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
570	NC_007643	GGC	2	6	22500	22505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
571	NC_007643	CGC	2	6	22537	22542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
572	NC_007643	GTGG	2	8	22561	22568	0 %	25 %	75 %	0 %	83591359
573	NC_007643	GTC	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
574	NC_007643	GGA	2	6	22675	22680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591359
575	NC_007643	GAC	2	6	22742	22747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
576	NC_007643	GTC	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591359
577	NC_007643	CAC	2	6	22787	22792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
578	NC_007643	TTC	2	6	22793	22798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591359
579	NC_007643	TCAG	2	8	22809	22816	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
580	NC_007643	CCG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
581	NC_007643	TGA	2	6	22857	22862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
582	NC_007643	CGA	2	6	22900	22905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
583	NC_007643	GCCA	2	8	22910	22917	25 %	0 %	25 %	50 %	83591359
584	NC_007643	ACC	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
585	NC_007643	GCA	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
586	NC_007643	GAG	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591359
587	NC_007643	GCG	2	6	23094	23099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
588	NC_007643	GAT	2	6	23158	23163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
589	NC_007643	GCC	2	6	23168	23173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
590	NC_007643	TGCGC	2	10	23232	23241	0 %	20 %	40 %	40 %	83591359
591	NC_007643	CCA	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
592	NC_007643	CTGG	2	8	23305	23312	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
593	NC_007643	CGA	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
594	NC_007643	GGC	2	6	23374	23379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
595	NC_007643	AAG	2	6	23393	23398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591359
596	NC_007643	CGG	2	6	23464	23469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
597	NC_007643	CGCT	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	83591359
598	NC_007643	CTGG	2	8	23555	23562	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
599	NC_007643	AGA	2	6	23568	23573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591359
600	NC_007643	CGGCG	2	10	23602	23611	0 %	0 %	60 %	40 %	83591359
601	NC_007643	GTG	2	6	23615	23620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
602	NC_007643	CGG	2	6	23629	23634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
603	NC_007643	GCG	2	6	23658	23663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
604	NC_007643	GCA	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591359
605	NC_007643	CGAC	2	8	23715	23722	25 %	0 %	25 %	50 %	83591359
606	NC_007643	CCG	2	6	23748	23753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
607	NC_007643	GCC	2	6	23767	23772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
608	NC_007643	CAC	2	6	23809	23814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
609	NC_007643	TCGA	2	8	23822	23829	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
610	NC_007643	CCG	3	9	23854	23862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
611	NC_007643	GCG	2	6	23958	23963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
612	NC_007643	GCG	2	6	23967	23972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
613	NC_007643	CGC	2	6	23995	24000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
614	NC_007643	CCG	2	6	24060	24065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
615	NC_007643	GGGC	2	8	24127	24134	0 %	0 %	75 %	25 %	83591359
616	NC_007643	GAT	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591359
617	NC_007643	CCG	2	6	24209	24214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
618	NC_007643	CAC	2	6	24218	24223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
619	NC_007643	TCGA	2	8	24233	24240	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
620	NC_007643	CG	3	6	24282	24287	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
621	NC_007643	CGC	2	6	24334	24339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
622	NC_007643	TGATCT	2	12	24366	24377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	83591359
623	NC_007643	GGC	2	6	24389	24394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
624	NC_007643	CGG	2	6	24517	24522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591359
625	NC_007643	GTG	2	6	24542	24547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
626	NC_007643	CGC	2	6	24550	24555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591359
627	NC_007643	CAC	2	6	24586	24591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591359
628	NC_007643	TGG	2	6	24597	24602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591359
629	NC_007643	CAT	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591359
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