MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREL1

Total Repeats: 6067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007491	GCG	2	6	267952	267957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_007491	GTG	2	6	268054	268059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_007491	GTCG	2	8	268092	268099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_007491	GGT	3	9	268142	268150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454863
6005	NC_007491	GTT	3	9	268238	268246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454863
6006	NC_007491	CGA	2	6	268289	268294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454863
6007	NC_007491	CGG	2	6	268307	268312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454863
6008	NC_007491	GCG	2	6	268317	268322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454863
6009	NC_007491	GTC	2	6	268537	268542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6010	NC_007491	GTAC	2	8	268559	268566	25 %	25 %	25 %	25 %	77454864
6011	NC_007491	TCG	2	6	268574	268579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6012	NC_007491	GGC	2	6	268658	268663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454864
6013	NC_007491	GGT	2	6	268744	268749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454864
6014	NC_007491	TCT	2	6	268800	268805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77454864
6015	NC_007491	CGAGTA	2	12	268830	268841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77454864
6016	NC_007491	GATC	2	8	268842	268849	25 %	25 %	25 %	25 %	77454864
6017	NC_007491	TCCG	2	8	268861	268868	0 %	25 %	25 %	50 %	77454864
6018	NC_007491	ACT	2	6	268874	268879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77454864
6019	NC_007491	GTA	2	6	268954	268959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454864
6020	NC_007491	CGAA	2	8	269054	269061	50 %	0 %	25 %	25 %	77454864
6021	NC_007491	CGC	2	6	269080	269085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454864
6022	NC_007491	GAT	2	6	269095	269100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454864
6023	NC_007491	AC	3	6	269160	269165	50 %	0 %	0 %	50 %	77454864
6024	NC_007491	GTTC	2	8	269168	269175	0 %	50 %	25 %	25 %	77454864
6025	NC_007491	CT	3	6	269207	269212	0 %	50 %	0 %	50 %	77454864
6026	NC_007491	CGA	2	6	269226	269231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6027	NC_007491	CGT	2	6	269259	269264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6028	NC_007491	TGC	2	6	269268	269273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6029	NC_007491	GATC	2	8	269295	269302	25 %	25 %	25 %	25 %	77454864
6030	NC_007491	CTG	2	6	269356	269361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6031	NC_007491	CGG	2	6	269373	269378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454864
6032	NC_007491	CGGC	2	8	269429	269436	0 %	0 %	50 %	50 %	77454864
6033	NC_007491	GT	3	6	269511	269516	0 %	50 %	50 %	0 %	77454864
6034	NC_007491	GGA	2	6	269572	269577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77454864
6035	NC_007491	CAG	2	6	269631	269636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454864
6036	NC_007491	GCC	2	6	269827	269832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454864
6037	NC_007491	TCGA	2	8	269998	270005	25 %	25 %	25 %	25 %	77454865
6038	NC_007491	CCAC	2	8	270010	270017	25 %	0 %	0 %	75 %	77454865
6039	NC_007491	CGG	2	6	270041	270046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454865
6040	NC_007491	CTG	2	6	270063	270068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454865
6041	NC_007491	GGGC	2	8	270119	270126	0 %	0 %	75 %	25 %	77454865
6042	NC_007491	GT	3	6	270134	270139	0 %	50 %	50 %	0 %	77454865
6043	NC_007491	TGCG	2	8	270156	270163	0 %	25 %	50 %	25 %	77454865
6044	NC_007491	AGC	2	6	270164	270169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454865
6045	NC_007491	GC	3	6	270233	270238	0 %	0 %	50 %	50 %	77454865
6046	NC_007491	GAT	2	6	270292	270297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454865
6047	NC_007491	CTGT	2	8	270455	270462	0 %	50 %	25 %	25 %	77454865
6048	NC_007491	GCG	2	6	270540	270545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454865
6049	NC_007491	GTG	2	6	270549	270554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454865
6050	NC_007491	TCT	2	6	270699	270704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_007491	TTG	2	6	270757	270762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_007491	GT	3	6	270808	270813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_007491	CCA	2	6	270836	270841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_007491	CCG	2	6	270849	270854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_007491	CGCC	2	8	270883	270890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6056	NC_007491	CGG	2	6	271031	271036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_007491	CGC	2	6	271042	271047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_007491	TGG	2	6	271103	271108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_007491	GTG	2	6	271240	271245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_007491	TGT	2	6	271271	271276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_007491	TGGGG	2	10	271286	271295	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_007491	ATG	2	6	271314	271319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_007491	TCCC	2	8	271366	271373	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6064	NC_007491	GC	3	6	271455	271460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_007491	TCGA	2	8	271467	271474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_007491	GTCT	2	8	271480	271487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_007491	AGCGA	2	10	271526	271535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.