MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 2282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	CGG	2	6	12	17	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007489	CCG	2	6	49	54	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007489	CCGTC	2	10	73	82	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007489	GCG	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007489	CGT	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007489	CCG	2	6	131	136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007489	GCCG	2	8	163	170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007489	CG	3	6	181	186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007489	CTC	2	6	207	212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007489	TGC	3	9	270	278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007489	CGTC	2	8	333	340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007489	CG	3	6	379	384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007489	TCC	2	6	396	401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007489	CCG	2	6	410	415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007489	GCCGGT	2	12	509	520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007489	CCGG	2	8	524	531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007489	GTC	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007489	GAG	2	6	690	695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007489	CG	3	6	765	770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007489	TGCCG	2	10	826	835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007489	TCG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007489	CGT	2	6	919	924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007489	AGC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007489	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007489	CGC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007489	GGT	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007489	GCC	2	6	1260	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007489	GCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007489	CAG	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007489	CGT	3	9	1340	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007489	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007489	CGCT	2	8	1398	1405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007489	CCCAT	2	10	1414	1423	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_007489	GCC	2	6	1424	1429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007489	TCC	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007489	GAG	2	6	1581	1586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007489	GTC	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007489	GAG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007489	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007489	CCG	2	6	1760	1765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007489	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007489	CCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007489	TTCT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007489	AGG	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007489	CCGTCC	2	12	1933	1944	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007489	CAG	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007489	AGC	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007489	CAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007489	GGC	2	6	2144	2149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007489	ATG	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007489	ACC	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007489	CCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007489	GCA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007489	TG	3	6	2285	2290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007489	TAA	2	6	2337	2342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007489	ATA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007489	TTC	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404694
58	NC_007489	TC	3	6	2520	2525	0 %	50 %	0 %	50 %	77404694
59	NC_007489	CAGA	2	8	2542	2549	50 %	0 %	25 %	25 %	77404694
60	NC_007489	ACG	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404694
61	NC_007489	AAGG	2	8	2659	2666	50 %	0 %	50 %	0 %	77404694
62	NC_007489	ACTGT	2	10	2668	2677	20 %	40 %	20 %	20 %	77404694
63	NC_007489	GAC	2	6	2772	2777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404694
64	NC_007489	GTC	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404694
65	NC_007489	ATA	2	6	3013	3018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007489	CAG	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404695
67	NC_007489	CGC	2	6	3124	3129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404695
68	NC_007489	TCCG	2	8	3198	3205	0 %	25 %	25 %	50 %	77404695
69	NC_007489	CGCA	2	8	3217	3224	25 %	0 %	25 %	50 %	77404695
70	NC_007489	CTC	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404695
71	NC_007489	CGG	2	6	3357	3362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404695
72	NC_007489	GCCG	2	8	3406	3413	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
73	NC_007489	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	77404695
74	NC_007489	CAG	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404695
75	NC_007489	GCC	2	6	3514	3519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404695
76	NC_007489	CCG	2	6	3604	3609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404695
77	NC_007489	ACC	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404695
78	NC_007489	ATCCCC	2	12	3748	3759	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	77404695
79	NC_007489	GTCG	2	8	3760	3767	0 %	25 %	50 %	25 %	77404695
80	NC_007489	GC	3	6	3815	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
81	NC_007489	CCA	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404695
82	NC_007489	CCG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404695
83	NC_007489	AGC	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404695
84	NC_007489	GACT	2	8	3930	3937	25 %	25 %	25 %	25 %	77404695
85	NC_007489	TCGCA	2	10	4029	4038	20 %	20 %	20 %	40 %	77404695
86	NC_007489	CGG	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404695
87	NC_007489	GGC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404695
88	NC_007489	GGC	2	6	4096	4101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404695
89	NC_007489	CGC	2	6	4122	4127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404695
90	NC_007489	CGG	2	6	4158	4163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404695
91	NC_007489	CG	5	10	4189	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
92	NC_007489	GCCAGC	2	12	4214	4225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404695
93	NC_007489	GCC	2	6	4277	4282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404695
94	NC_007489	CCA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404695
95	NC_007489	GGGC	2	8	4302	4309	0 %	0 %	75 %	25 %	77404695
96	NC_007489	GAG	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404695
97	NC_007489	GTC	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404696
98	NC_007489	CG	3	6	4587	4592	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
99	NC_007489	ATCG	2	8	4643	4650	25 %	25 %	25 %	25 %	77404696
100	NC_007489	GC	3	6	4717	4722	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
101	NC_007489	TGGA	2	8	4727	4734	25 %	25 %	50 %	0 %	77404696
102	NC_007489	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404696
103	NC_007489	GCG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404696
104	NC_007489	CG	3	6	4827	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
105	NC_007489	CCT	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404696
106	NC_007489	GC	4	8	4873	4880	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
107	NC_007489	GAT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404696
108	NC_007489	CGCA	2	8	4970	4977	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
109	NC_007489	CCG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404696
110	NC_007489	GCC	2	6	5069	5074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404696
111	NC_007489	CGAC	2	8	5104	5111	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
112	NC_007489	TCGA	2	8	5142	5149	25 %	25 %	25 %	25 %	77404696
113	NC_007489	TCGGC	2	10	5152	5161	0 %	20 %	40 %	40 %	77404696
114	NC_007489	AAG	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404696
115	NC_007489	AAAG	2	8	5314	5321	75 %	0 %	25 %	0 %	77404696
116	NC_007489	CGA	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404696
117	NC_007489	CCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404696
118	NC_007489	GCG	2	6	5391	5396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404696
119	NC_007489	CCAG	2	8	5419	5426	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
120	NC_007489	CG	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
121	NC_007489	CG	3	6	5480	5485	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
122	NC_007489	GCC	2	6	5511	5516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404696
123	NC_007489	GCCG	2	8	5582	5589	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
124	NC_007489	GGCTCG	2	12	5634	5645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404696
125	NC_007489	GCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404696
126	NC_007489	CAC	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404696
127	NC_007489	CCGA	2	8	5732	5739	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
128	NC_007489	GCC	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404696
129	NC_007489	ATG	3	9	5883	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404696
130	NC_007489	CTGC	2	8	5931	5938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007489	CCCG	2	8	5988	5995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_007489	CCG	2	6	6009	6014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007489	CTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007489	CGG	2	6	6102	6107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007489	G	6	6	6111	6116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007489	GA	3	6	6120	6125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007489	GCC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007489	GC	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007489	GAA	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007489	GAT	2	6	6259	6264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007489	CG	3	6	6304	6309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007489	CGG	2	6	6327	6332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007489	C	6	6	6358	6363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_007489	CCA	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404697
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281	NC_007489	GAC	2	6	13020	13025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404703
282	NC_007489	CGGA	2	8	13128	13135	25 %	0 %	50 %	25 %	77404703
283	NC_007489	TCC	2	6	13139	13144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404703
284	NC_007489	GC	4	8	13220	13227	0 %	0 %	50 %	50 %	77404703
285	NC_007489	TCGATG	2	12	13241	13252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404703
286	NC_007489	GCT	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404703
287	NC_007489	GCC	2	6	13290	13295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404703
288	NC_007489	CAG	2	6	13321	13326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404703
289	NC_007489	GC	3	6	13399	13404	0 %	0 %	50 %	50 %	77404703
290	NC_007489	GAA	2	6	13441	13446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404703
291	NC_007489	TAC	2	6	13453	13458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404703
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295	NC_007489	CAG	2	6	13601	13606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_007489	CTGC	2	8	13608	13615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
297	NC_007489	CT	3	6	13669	13674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
298	NC_007489	GCC	2	6	13690	13695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
299	NC_007489	CGA	2	6	13699	13704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_007489	TGG	2	6	14134	14139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404704
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312	NC_007489	GCT	2	6	14433	14438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_007489	CGG	2	6	14481	14486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_007489	GTG	2	6	14489	14494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
315	NC_007489	CTG	2	6	14497	14502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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332	NC_007489	CG	3	6	15680	15685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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397	NC_007489	GTCG	2	8	18849	18856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
398	NC_007489	GCG	2	6	18880	18885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_007489	CCGGC	2	10	18886	18895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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401	NC_007489	GAG	2	6	18925	18930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_007489	GAG	2	6	18966	18971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
403	NC_007489	CGC	2	6	18980	18985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
404	NC_007489	GCC	2	6	19019	19024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
405	NC_007489	GC	3	6	19074	19079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
406	NC_007489	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
407	NC_007489	TCC	2	6	19120	19125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
408	NC_007489	GGCC	2	8	19150	19157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
409	NC_007489	CGC	2	6	19172	19177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_007489	GAA	2	6	19211	19216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
411	NC_007489	TCG	2	6	19234	19239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_007489	CGT	2	6	19265	19270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_007489	CGC	2	6	19278	19283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_007489	AGG	2	6	19288	19293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_007489	GCC	2	6	21863	21868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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481	NC_007489	CGC	2	6	23109	23114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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