MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 2339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007486	CAG	3	9	85970	85978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404564
2002	NC_007486	ACA	2	6	86075	86080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404564
2003	NC_007486	TCG	2	6	86120	86125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404564
2004	NC_007486	CAC	2	6	86163	86168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404564
2005	NC_007486	GAT	2	6	86305	86310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_007486	ACC	2	6	86324	86329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_007486	TCG	2	6	86354	86359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_007486	ACAG	2	8	86364	86371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2009	NC_007486	TTC	2	6	86391	86396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404565
2010	NC_007486	ACT	2	6	86426	86431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404565
2011	NC_007486	ACC	2	6	86448	86453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404565
2012	NC_007486	CGC	2	6	86489	86494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404565
2013	NC_007486	ACG	2	6	86614	86619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404565
2014	NC_007486	CGA	2	6	86672	86677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404565
2015	NC_007486	AAGG	2	8	86694	86701	50 %	0 %	50 %	0 %	77404565
2016	NC_007486	CGC	2	6	86820	86825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404566
2017	NC_007486	TTC	2	6	86831	86836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404566
2018	NC_007486	CAT	2	6	86952	86957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404566
2019	NC_007486	ACTC	2	8	87117	87124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2020	NC_007486	GACC	2	8	87153	87160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_007486	GCA	2	6	87161	87166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_007486	ACC	2	6	87172	87177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_007486	CAA	2	6	87181	87186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_007486	TGCC	2	8	87192	87199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_007486	CGA	2	6	87222	87227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_007486	CGC	2	6	87238	87243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2027	NC_007486	TCGCC	2	10	87309	87318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2028	NC_007486	GT	3	6	87330	87335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_007486	GTCC	2	8	87368	87375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2030	NC_007486	GCC	2	6	87383	87388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_007486	CGA	2	6	87447	87452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404567
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2034	NC_007486	CAG	2	6	87584	87589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404567
2035	NC_007486	G	6	6	87756	87761	0 %	0 %	100 %	0 %	77404567
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2038	NC_007486	CGG	2	6	88031	88036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_007486	CCGGA	2	10	88226	88235	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2040	NC_007486	TCGT	2	8	88311	88318	0 %	50 %	25 %	25 %	77404568
2041	NC_007486	GTCC	2	8	88356	88363	0 %	25 %	25 %	50 %	77404568
2042	NC_007486	GCC	2	6	88371	88376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404568
2043	NC_007486	GGT	2	6	88424	88429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404568
2044	NC_007486	GCT	2	6	88435	88440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404568
2045	NC_007486	GTG	2	6	88517	88522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404568
2046	NC_007486	CGCC	2	8	88718	88725	0 %	0 %	25 %	75 %	77404568
2047	NC_007486	GCG	2	6	88735	88740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404568
2048	NC_007486	CGT	2	6	88754	88759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404568
2049	NC_007486	ACC	2	6	89071	89076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404569
2050	NC_007486	CGGC	2	8	89114	89121	0 %	0 %	50 %	50 %	77404569
2051	NC_007486	GACC	2	8	89160	89167	25 %	0 %	25 %	50 %	77404569
2052	NC_007486	CGAC	2	8	89232	89239	25 %	0 %	25 %	50 %	77404569
2053	NC_007486	CGACA	2	10	89325	89334	40 %	0 %	20 %	40 %	77404569
2054	NC_007486	CGAA	2	8	89403	89410	50 %	0 %	25 %	25 %	77404569
2055	NC_007486	GGCC	2	8	89415	89422	0 %	0 %	50 %	50 %	77404569
2056	NC_007486	CCG	2	6	89426	89431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404569
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2059	NC_007486	GCG	2	6	89507	89512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404569
2060	NC_007486	AAAC	2	8	89594	89601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2061	NC_007486	CAT	2	6	89639	89644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404570
2062	NC_007486	GCC	2	6	89646	89651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404570
2063	NC_007486	T	6	6	89687	89692	0 %	100 %	0 %	0 %	77404570
2064	NC_007486	TGGTCA	2	12	89710	89721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404570
2065	NC_007486	TATCGC	2	12	89816	89827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404570
2066	NC_007486	CGA	2	6	89836	89841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404570
2067	NC_007486	GC	3	6	89869	89874	0 %	0 %	50 %	50 %	77404570
2068	NC_007486	GGTT	2	8	90116	90123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_007486	CGT	2	6	90138	90143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_007486	GT	3	6	90150	90155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_007486	AGG	2	6	90163	90168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2073	NC_007486	AGG	2	6	90298	90303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404571
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2093	NC_007486	CGA	2	6	91187	91192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404572
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2098	NC_007486	GAG	2	6	91293	91298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404572
2099	NC_007486	CAC	2	6	91318	91323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404572
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2102	NC_007486	GA	4	8	91392	91399	50 %	0 %	50 %	0 %	77404572
2103	NC_007486	GCTT	2	8	91437	91444	0 %	50 %	25 %	25 %	77404572
2104	NC_007486	TCC	2	6	91447	91452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404572
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2107	NC_007486	CGA	2	6	91636	91641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404573
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2118	NC_007486	GAGC	2	8	92121	92128	25 %	0 %	50 %	25 %	77404574
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2125	NC_007486	GTG	2	6	92322	92327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404574
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.