MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 38199

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_007109	ATT	2	6	1477246	1477251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459785
38002	NC_007109	GCA	2	6	1477280	1477285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459785
38003	NC_007109	TCT	2	6	1477328	1477333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459785
38004	NC_007109	AC	3	6	1477354	1477359	50 %	0 %	0 %	50 %	67459785
38005	NC_007109	TTC	2	6	1477485	1477490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459786
38006	NC_007109	TTA	2	6	1477504	1477509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38007	NC_007109	CAT	2	6	1477517	1477522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459786
38008	NC_007109	TGCT	2	8	1477566	1477573	0 %	50 %	25 %	25 %	67459786
38009	NC_007109	ATT	2	6	1477626	1477631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38010	NC_007109	TTA	2	6	1477651	1477656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38011	NC_007109	T	7	7	1477680	1477686	0 %	100 %	0 %	0 %	67459786
38012	NC_007109	TTA	2	6	1477708	1477713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38013	NC_007109	T	7	7	1477761	1477767	0 %	100 %	0 %	0 %	67459786
38014	NC_007109	TAATT	2	10	1477821	1477830	40 %	60 %	0 %	0 %	67459786
38015	NC_007109	AT	4	8	1477856	1477863	50 %	50 %	0 %	0 %	67459786
38016	NC_007109	TAT	2	6	1477892	1477897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38017	NC_007109	ATTTT	2	10	1477919	1477928	20 %	80 %	0 %	0 %	67459786
38018	NC_007109	TTA	2	6	1477936	1477941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38019	NC_007109	TTA	2	6	1477993	1477998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38020	NC_007109	AAT	2	6	1478012	1478017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459786
38021	NC_007109	TAT	2	6	1478039	1478044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38022	NC_007109	TAATT	2	10	1478046	1478055	40 %	60 %	0 %	0 %	67459786
38023	NC_007109	TTA	2	6	1478095	1478100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38024	NC_007109	T	7	7	1478158	1478164	0 %	100 %	0 %	0 %	67459786
38025	NC_007109	TAT	2	6	1478183	1478188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459786
38026	NC_007109	ATA	3	9	1478223	1478231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38027	NC_007109	A	7	7	1478231	1478237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38028	NC_007109	ATG	2	6	1478287	1478292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38029	NC_007109	TAA	2	6	1478304	1478309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38030	NC_007109	T	7	7	1478359	1478365	0 %	100 %	0 %	0 %	67459787
38031	NC_007109	T	6	6	1478419	1478424	0 %	100 %	0 %	0 %	67459787
38032	NC_007109	ATT	2	6	1478430	1478435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459787
38033	NC_007109	T	8	8	1478443	1478450	0 %	100 %	0 %	0 %	67459787
38034	NC_007109	AGG	2	6	1478525	1478530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459787
38035	NC_007109	TAT	2	6	1478533	1478538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459787
38036	NC_007109	GATA	2	8	1478553	1478560	50 %	25 %	25 %	0 %	67459787
38037	NC_007109	TAA	2	6	1478578	1478583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459787
38038	NC_007109	TAT	2	6	1478615	1478620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459787
38039	NC_007109	TAT	2	6	1478831	1478836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459787
38040	NC_007109	TTTC	2	8	1478878	1478885	0 %	75 %	0 %	25 %	67459787
38041	NC_007109	TA	3	6	1479087	1479092	50 %	50 %	0 %	0 %	67459787
38042	NC_007109	TAT	2	6	1479102	1479107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459787
38043	NC_007109	CGG	2	6	1479191	1479196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67459787
38044	NC_007109	TTG	2	6	1479235	1479240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459787
38045	NC_007109	CAG	2	6	1479286	1479291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459787
38046	NC_007109	CAA	2	6	1479303	1479308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459787
38047	NC_007109	TA	3	6	1479363	1479368	50 %	50 %	0 %	0 %	67459787
38048	NC_007109	CGG	2	6	1479446	1479451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67459787
38049	NC_007109	TAT	2	6	1479461	1479466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459787
38050	NC_007109	TGC	2	6	1479530	1479535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459787
38051	NC_007109	ATG	2	6	1479558	1479563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459787
38052	NC_007109	TAA	2	6	1479587	1479592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459787
38053	NC_007109	A	6	6	1479668	1479673	100 %	0 %	0 %	0 %	67459788
38054	NC_007109	GAA	3	9	1479676	1479684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459788
38055	NC_007109	GTAC	2	8	1479721	1479728	25 %	25 %	25 %	25 %	67459788
38056	NC_007109	CGG	2	6	1479744	1479749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67459788
38057	NC_007109	GGC	2	6	1479751	1479756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67459788
38058	NC_007109	TAT	2	6	1479759	1479764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459788
38059	NC_007109	TC	3	6	1479766	1479771	0 %	50 %	0 %	50 %	67459788
38060	NC_007109	AT	3	6	1479806	1479811	50 %	50 %	0 %	0 %	67459788
38061	NC_007109	TA	3	6	1479955	1479960	50 %	50 %	0 %	0 %	67459788
38062	NC_007109	GGC	2	6	1479982	1479987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67459788
38063	NC_007109	GAAA	2	8	1480014	1480021	75 %	0 %	25 %	0 %	67459788
38064	NC_007109	AAG	2	6	1480052	1480057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459788
38065	NC_007109	TAT	2	6	1480081	1480086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459788
38066	NC_007109	GAG	2	6	1480145	1480150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459788
38067	NC_007109	GTAG	2	8	1480219	1480226	25 %	25 %	50 %	0 %	67459788
38068	NC_007109	AAGT	2	8	1480260	1480267	50 %	25 %	25 %	0 %	67459788
38069	NC_007109	AGAA	2	8	1480292	1480299	75 %	0 %	25 %	0 %	67459788
38070	NC_007109	AATTT	2	10	1480331	1480340	40 %	60 %	0 %	0 %	67459788
38071	NC_007109	ACC	2	6	1480410	1480415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459788
38072	NC_007109	T	6	6	1480508	1480513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38073	NC_007109	ATT	2	6	1480544	1480549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38074	NC_007109	ATT	2	6	1480614	1480619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38075	NC_007109	TAT	2	6	1480630	1480635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38076	NC_007109	T	7	7	1480721	1480727	0 %	100 %	0 %	0 %	67459789
38077	NC_007109	AAT	2	6	1480749	1480754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459789
38078	NC_007109	CCT	3	9	1480820	1480828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459789
38079	NC_007109	ATTTT	2	10	1480841	1480850	20 %	80 %	0 %	0 %	67459789
38080	NC_007109	ATT	2	6	1480867	1480872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459789
38081	NC_007109	AATT	2	8	1480918	1480925	50 %	50 %	0 %	0 %	67459789
38082	NC_007109	T	6	6	1480958	1480963	0 %	100 %	0 %	0 %	67459789
38083	NC_007109	TGA	2	6	1481012	1481017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459789
38084	NC_007109	ATA	2	6	1481018	1481023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459789
38085	NC_007109	CT	3	6	1481045	1481050	0 %	50 %	0 %	50 %	67459789
38086	NC_007109	ATTT	2	8	1481085	1481092	25 %	75 %	0 %	0 %	67459789
38087	NC_007109	CAT	2	6	1481107	1481112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459789
38088	NC_007109	TA	3	6	1481311	1481316	50 %	50 %	0 %	0 %	67459789
38089	NC_007109	T	6	6	1481317	1481322	0 %	100 %	0 %	0 %	67459789
38090	NC_007109	T	6	6	1481373	1481378	0 %	100 %	0 %	0 %	67459789
38091	NC_007109	TAC	2	6	1481424	1481429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459789
38092	NC_007109	CTA	2	6	1481445	1481450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459789
38093	NC_007109	CTA	2	6	1481454	1481459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459789
38094	NC_007109	ACC	2	6	1481466	1481471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459789
38095	NC_007109	GTT	2	6	1481476	1481481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459789
38096	NC_007109	TTC	2	6	1481490	1481495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459789
38097	NC_007109	TTA	2	6	1481525	1481530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459789
38098	NC_007109	TAT	2	6	1481541	1481546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459789
38099	NC_007109	ATT	2	6	1481561	1481566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38100	NC_007109	T	6	6	1481565	1481570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38101	NC_007109	TAAA	2	8	1481588	1481595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38102	NC_007109	A	6	6	1481618	1481623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38103	NC_007109	AAAC	2	8	1481634	1481641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38104	NC_007109	ATG	2	6	1481771	1481776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38105	NC_007109	TAT	2	6	1481854	1481859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38106	NC_007109	ACC	2	6	1481891	1481896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38107	NC_007109	GGT	2	6	1481915	1481920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38108	NC_007109	AATC	2	8	1481944	1481951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38109	NC_007109	CCAA	2	8	1481968	1481975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38110	NC_007109	AG	3	6	1482079	1482084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38111	NC_007109	ATC	2	6	1482150	1482155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38112	NC_007109	CTA	2	6	1482189	1482194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38113	NC_007109	ACAGA	2	10	1482243	1482252	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38114	NC_007109	ATT	2	6	1482285	1482290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459790
38115	NC_007109	CAA	2	6	1482460	1482465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459790
38116	NC_007109	TTA	2	6	1482484	1482489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459790
38117	NC_007109	TAT	2	6	1482565	1482570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459790
38118	NC_007109	TGGTA	2	10	1482595	1482604	20 %	40 %	40 %	0 %	67459790
38119	NC_007109	AT	3	6	1482608	1482613	50 %	50 %	0 %	0 %	67459790
38120	NC_007109	GTAA	2	8	1482619	1482626	50 %	25 %	25 %	0 %	67459790
38121	NC_007109	GACT	2	8	1482665	1482672	25 %	25 %	25 %	25 %	67459790
38122	NC_007109	ATAG	2	8	1482679	1482686	50 %	25 %	25 %	0 %	67459790
38123	NC_007109	TTA	2	6	1482797	1482802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459791
38124	NC_007109	GCA	2	6	1482810	1482815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459791
38125	NC_007109	AT	3	6	1482816	1482821	50 %	50 %	0 %	0 %	67459791
38126	NC_007109	TAA	2	6	1482834	1482839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459791
38127	NC_007109	CTA	2	6	1482924	1482929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459791
38128	NC_007109	T	7	7	1482979	1482985	0 %	100 %	0 %	0 %	67459791
38129	NC_007109	CTACT	2	10	1483044	1483053	20 %	40 %	0 %	40 %	67459791
38130	NC_007109	TAT	2	6	1483153	1483158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459791
38131	NC_007109	T	6	6	1483158	1483163	0 %	100 %	0 %	0 %	67459791
38132	NC_007109	ATA	2	6	1483185	1483190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459791
38133	NC_007109	ATC	3	9	1483204	1483212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459791
38134	NC_007109	TCT	3	9	1483256	1483264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459791
38135	NC_007109	AAC	2	6	1483272	1483277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459791
38136	NC_007109	ATATCA	2	12	1483295	1483306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459791
38137	NC_007109	A	6	6	1483316	1483321	100 %	0 %	0 %	0 %	67459791
38138	NC_007109	GTA	2	6	1483343	1483348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459791
38139	NC_007109	AAT	2	6	1483373	1483378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459791
38140	NC_007109	ATT	2	6	1483379	1483384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459791
38141	NC_007109	T	7	7	1483399	1483405	0 %	100 %	0 %	0 %	67459791
38142	NC_007109	CTT	2	6	1483419	1483424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459791
38143	NC_007109	TCT	2	6	1483469	1483474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459791
38144	NC_007109	GCT	2	6	1483482	1483487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459791
38145	NC_007109	CTC	2	6	1483516	1483521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459791
38146	NC_007109	AGA	2	6	1483537	1483542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459791
38147	NC_007109	T	6	6	1483566	1483571	0 %	100 %	0 %	0 %	67459791
38148	NC_007109	TC	4	8	1483579	1483586	0 %	50 %	0 %	50 %	67459791
38149	NC_007109	TAG	3	9	1483587	1483595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459791
38150	NC_007109	ATT	2	6	1483598	1483603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459791
38151	NC_007109	AAT	2	6	1483609	1483614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459791
38152	NC_007109	ATTA	2	8	1483636	1483643	50 %	50 %	0 %	0 %	67459791
38153	NC_007109	TAAAT	2	10	1483660	1483669	60 %	40 %	0 %	0 %	67459791
38154	NC_007109	A	6	6	1483670	1483675	100 %	0 %	0 %	0 %	67459791
38155	NC_007109	T	6	6	1483694	1483699	0 %	100 %	0 %	0 %	67459791
38156	NC_007109	CCT	2	6	1483703	1483708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459791
38157	NC_007109	TTCTT	2	10	1483731	1483740	0 %	80 %	0 %	20 %	67459791
38158	NC_007109	CTTTC	2	10	1483829	1483838	0 %	60 %	0 %	40 %	67459792
38159	NC_007109	GAA	2	6	1483846	1483851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459792
38160	NC_007109	TAA	2	6	1483889	1483894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459792
38161	NC_007109	CACTC	2	10	1483933	1483942	20 %	20 %	0 %	60 %	67459792
38162	NC_007109	T	6	6	1483948	1483953	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38163	NC_007109	CTT	2	6	1483996	1484001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459792
38164	NC_007109	AAT	2	6	1484019	1484024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459792
38165	NC_007109	TCT	2	6	1484067	1484072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459792
38166	NC_007109	T	8	8	1484089	1484096	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38167	NC_007109	CTC	2	6	1484123	1484128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459792
38168	NC_007109	GAT	2	6	1484200	1484205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459792
38169	NC_007109	T	6	6	1484212	1484217	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38170	NC_007109	TAA	2	6	1484221	1484226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459792
38171	NC_007109	TAA	2	6	1484231	1484236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459792
38172	NC_007109	TATTT	2	10	1484249	1484258	20 %	80 %	0 %	0 %	67459792
38173	NC_007109	AT	3	6	1484261	1484266	50 %	50 %	0 %	0 %	67459792
38174	NC_007109	T	6	6	1484270	1484275	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38175	NC_007109	TTTTCC	2	12	1484294	1484305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459792
38176	NC_007109	TCA	2	6	1484320	1484325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459792
38177	NC_007109	GTG	2	6	1484361	1484366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459792
38178	NC_007109	TTC	2	6	1484375	1484380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459792
38179	NC_007109	T	7	7	1484387	1484393	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38180	NC_007109	ATT	2	6	1484394	1484399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459792
38181	NC_007109	TAT	2	6	1484419	1484424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459792
38182	NC_007109	TCT	2	6	1484451	1484456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459792
38183	NC_007109	AT	3	6	1484536	1484541	50 %	50 %	0 %	0 %	67459792
38184	NC_007109	A	6	6	1484545	1484550	100 %	0 %	0 %	0 %	67459792
38185	NC_007109	CAT	2	6	1484614	1484619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459792
38186	NC_007109	T	6	6	1484637	1484642	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38187	NC_007109	T	6	6	1484644	1484649	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38188	NC_007109	T	6	6	1484657	1484662	0 %	100 %	0 %	0 %	67459792
38189	NC_007109	TTA	2	6	1484712	1484717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459792
38190	NC_007109	ATTAA	2	10	1484768	1484777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38191	NC_007109	AT	3	6	1484781	1484786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38192	NC_007109	TTA	2	6	1484787	1484792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38193	NC_007109	CAA	2	6	1484847	1484852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38194	NC_007109	T	6	6	1484975	1484980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38195	NC_007109	TATT	2	8	1485022	1485029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38196	NC_007109	TAA	2	6	1485060	1485065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38197	NC_007109	ATA	2	6	1485104	1485109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38198	NC_007109	TTA	2	6	1485112	1485117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38199	NC_007109	A	6	6	1485117	1485122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.