MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006569	GGC	2	6	116163	116168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708899
2502	NC_006569	TGC	2	6	116216	116221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708899
2503	NC_006569	AAC	2	6	116281	116286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708899
2504	NC_006569	TGT	2	6	116300	116305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708899
2505	NC_006569	CCA	2	6	116363	116368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708899
2506	NC_006569	GGT	2	6	116538	116543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708899
2507	NC_006569	CCG	2	6	116552	116557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708899
2508	NC_006569	CGC	2	6	116564	116569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708899
2509	NC_006569	TCGCT	2	10	116575	116584	0 %	40 %	20 %	40 %	56708899
2510	NC_006569	GCC	2	6	116613	116618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708899
2511	NC_006569	CGT	2	6	116631	116636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708899
2512	NC_006569	CAA	2	6	116688	116693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708899
2513	NC_006569	ATC	2	6	116728	116733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708899
2514	NC_006569	CGA	2	6	116805	116810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708899
2515	NC_006569	GGC	2	6	116835	116840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708899
2516	NC_006569	CTG	2	6	116874	116879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708899
2517	NC_006569	TGG	2	6	116945	116950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708899
2518	NC_006569	GC	3	6	116951	116956	0 %	0 %	50 %	50 %	56708899
2519	NC_006569	TGTC	2	8	116957	116964	0 %	50 %	25 %	25 %	56708899
2520	NC_006569	CTGC	2	8	117032	117039	0 %	25 %	25 %	50 %	56708899
2521	NC_006569	GCG	2	6	117047	117052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708899
2522	NC_006569	TGA	2	6	117201	117206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708899
2523	NC_006569	GAC	2	6	117267	117272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708899
2524	NC_006569	TGG	2	6	117366	117371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708899
2525	NC_006569	CGCGC	2	10	117406	117415	0 %	0 %	40 %	60 %	56708899
2526	NC_006569	TCTG	2	8	117439	117446	0 %	50 %	25 %	25 %	56708899
2527	NC_006569	CG	3	6	117496	117501	0 %	0 %	50 %	50 %	56708900
2528	NC_006569	TTC	2	6	117508	117513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708900
2529	NC_006569	AAC	2	6	117519	117524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708900
2530	NC_006569	TCA	2	6	117530	117535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2531	NC_006569	ACCC	2	8	117549	117556	25 %	0 %	0 %	75 %	56708900
2532	NC_006569	ATC	2	6	117561	117566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2533	NC_006569	CCGC	2	8	117572	117579	0 %	0 %	25 %	75 %	56708900
2534	NC_006569	CAT	2	6	117584	117589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2535	NC_006569	GGC	2	6	117698	117703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708900
2536	NC_006569	GGC	2	6	117960	117965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708900
2537	NC_006569	CTT	2	6	118011	118016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708900
2538	NC_006569	TCA	2	6	118096	118101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2539	NC_006569	CAT	2	6	118184	118189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2540	NC_006569	TCC	2	6	118193	118198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708900
2541	NC_006569	CTG	2	6	118248	118253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708900
2542	NC_006569	GC	4	8	118303	118310	0 %	0 %	50 %	50 %	56708900
2543	NC_006569	GGGTG	2	10	118311	118320	0 %	20 %	80 %	0 %	56708900
2544	NC_006569	CAT	2	6	118331	118336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2545	NC_006569	TCA	2	6	118441	118446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2546	NC_006569	GCC	3	9	118485	118493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708900
2547	NC_006569	GTC	2	6	118592	118597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708900
2548	NC_006569	AGGTG	2	10	118604	118613	20 %	20 %	60 %	0 %	56708900
2549	NC_006569	TGG	2	6	118645	118650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708900
2550	NC_006569	TGG	2	6	118702	118707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708900
2551	NC_006569	CCG	2	6	118744	118749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708900
2552	NC_006569	TCA	3	9	118756	118764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708900
2553	NC_006569	CGC	2	6	118768	118773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708900
2554	NC_006569	TCG	2	6	118807	118812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708900
2555	NC_006569	GAG	3	9	118842	118850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708900
2556	NC_006569	CCG	3	9	118890	118898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708901
2557	NC_006569	CA	3	6	118929	118934	50 %	0 %	0 %	50 %	56708901
2558	NC_006569	GGC	2	6	118969	118974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708901
2559	NC_006569	GAAC	2	8	119173	119180	50 %	0 %	25 %	25 %	56708901
2560	NC_006569	ACA	2	6	119208	119213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708901
2561	NC_006569	GGGC	2	8	119350	119357	0 %	0 %	75 %	25 %	56708901
2562	NC_006569	GCG	2	6	119364	119369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708901
2563	NC_006569	GCT	2	6	119398	119403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708901
2564	NC_006569	CCG	2	6	119456	119461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708901
2565	NC_006569	GCA	2	6	119493	119498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708901
2566	NC_006569	ATC	2	6	119561	119566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708901
2567	NC_006569	TGC	2	6	119604	119609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708901
2568	NC_006569	CGA	3	9	119677	119685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708901
2569	NC_006569	GATC	2	8	119704	119711	25 %	25 %	25 %	25 %	56708901
2570	NC_006569	GCC	2	6	119828	119833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708901
2571	NC_006569	ACGAAC	2	12	119847	119858	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56708901
2572	NC_006569	AGG	2	6	119899	119904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_006569	ACCG	2	8	119917	119924	25 %	0 %	25 %	50 %	56708902
2574	NC_006569	ACG	2	6	119994	119999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708902
2575	NC_006569	GC	3	6	120021	120026	0 %	0 %	50 %	50 %	56708902
2576	NC_006569	GC	3	6	120121	120126	0 %	0 %	50 %	50 %	56708902
2577	NC_006569	GCC	2	6	120156	120161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708902
2578	NC_006569	GGT	2	6	120163	120168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708902
2579	NC_006569	TGC	2	6	120202	120207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708902
2580	NC_006569	TGGC	2	8	120211	120218	0 %	25 %	50 %	25 %	56708902
2581	NC_006569	GC	3	6	120261	120266	0 %	0 %	50 %	50 %	56708902
2582	NC_006569	TCA	2	6	120294	120299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708902
2583	NC_006569	ACC	2	6	120506	120511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708902
2584	NC_006569	GGC	2	6	120545	120550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708902
2585	NC_006569	GCT	2	6	120556	120561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708902
2586	NC_006569	CGC	2	6	120594	120599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708902
2587	NC_006569	CGG	2	6	120709	120714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708902
2588	NC_006569	TGC	2	6	120750	120755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708902
2589	NC_006569	CGG	2	6	120838	120843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708902
2590	NC_006569	TCT	2	6	120873	120878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708902
2591	NC_006569	CGA	2	6	120925	120930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708902
2592	NC_006569	TGCC	2	8	120931	120938	0 %	25 %	25 %	50 %	56708902
2593	NC_006569	TCA	2	6	121015	121020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708902
2594	NC_006569	TCG	2	6	121023	121028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708902
2595	NC_006569	GCC	2	6	121081	121086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2596	NC_006569	CGT	3	9	121104	121112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708903
2597	NC_006569	TGTCGA	2	12	121125	121136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56708903
2598	NC_006569	CGC	2	6	121245	121250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2599	NC_006569	GC	3	6	121249	121254	0 %	0 %	50 %	50 %	56708903
2600	NC_006569	CCG	2	6	121256	121261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2601	NC_006569	GAG	2	6	121276	121281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708903
2602	NC_006569	GCT	2	6	121290	121295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708903
2603	NC_006569	GGT	2	6	121410	121415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708903
2604	NC_006569	GCC	2	6	121425	121430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2605	NC_006569	GTG	2	6	121448	121453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708903
2606	NC_006569	CGC	2	6	121470	121475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2607	NC_006569	CAA	2	6	121483	121488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708903
2608	NC_006569	ATC	2	6	121516	121521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708903
2609	NC_006569	GC	3	6	121527	121532	0 %	0 %	50 %	50 %	56708903
2610	NC_006569	TCA	2	6	121583	121588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708903
2611	NC_006569	GC	3	6	121600	121605	0 %	0 %	50 %	50 %	56708903
2612	NC_006569	CCG	2	6	121611	121616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2613	NC_006569	TCT	2	6	121631	121636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708903
2614	NC_006569	ATC	2	6	121675	121680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708903
2615	NC_006569	CCG	2	6	121682	121687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708903
2616	NC_006569	AGC	2	6	121745	121750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708903
2617	NC_006569	TCG	2	6	121804	121809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708903
2618	NC_006569	ATC	2	6	121834	121839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708903
2619	NC_006569	GCG	2	6	121916	121921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708903
2620	NC_006569	TGC	2	6	121937	121942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708903
2621	NC_006569	ACA	2	6	121989	121994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708904
2622	NC_006569	ATG	2	6	122066	122071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708904
2623	NC_006569	TTCCA	2	10	122108	122117	20 %	40 %	0 %	40 %	56708904
2624	NC_006569	CGGATG	2	12	122120	122131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56708904
2625	NC_006569	AAG	2	6	122132	122137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708904
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2628	NC_006569	GCCT	2	8	122228	122235	0 %	25 %	25 %	50 %	56708904
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2639	NC_006569	TCG	2	6	123115	123120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708905
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2862	NC_006569	GA	3	6	134257	134262	50 %	0 %	50 %	0 %	56708911
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2993	NC_006569	CAGC	2	8	140748	140755	25 %	0 %	25 %	50 %	56708917
2994	NC_006569	CTC	2	6	140769	140774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708917
2995	NC_006569	GC	3	6	140833	140838	0 %	0 %	50 %	50 %	56708917
2996	NC_006569	CAG	2	6	140844	140849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708917
2997	NC_006569	ACA	2	6	140893	140898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708917
2998	NC_006569	GGCC	2	8	140920	140927	0 %	0 %	50 %	50 %	56708917
2999	NC_006569	TTC	2	6	140955	140960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708917
3000	NC_006569	CAGGCC	2	12	140998	141009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56708917

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