MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_006569	ACCG	2	8	487006	487013	25 %	0 %	25 %	50 %	56709221
10502	NC_006569	CGC	2	6	487095	487100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
10503	NC_006569	CCA	2	6	487116	487121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709221
10504	NC_006569	GGC	2	6	487141	487146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709221
10505	NC_006569	CAC	2	6	487210	487215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709221
10506	NC_006569	GCC	4	12	487219	487230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
10507	NC_006569	GC	3	6	487265	487270	0 %	0 %	50 %	50 %	56709221
10508	NC_006569	CGA	2	6	487300	487305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709221
10509	NC_006569	GTCCA	2	10	487340	487349	20 %	20 %	20 %	40 %	56709221
10510	NC_006569	CTC	2	6	487351	487356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709221
10511	NC_006569	GCC	2	6	487357	487362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
10512	NC_006569	CAT	2	6	487390	487395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709221
10513	NC_006569	CGG	2	6	487404	487409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709221
10514	NC_006569	ATGCA	2	10	487418	487427	40 %	20 %	20 %	20 %	56709221
10515	NC_006569	GC	3	6	487578	487583	0 %	0 %	50 %	50 %	56709221
10516	NC_006569	GCC	2	6	487606	487611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709221
10517	NC_006569	CCA	2	6	487620	487625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709221
10518	NC_006569	GAC	2	6	487642	487647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709221
10519	NC_006569	CTCA	2	8	487654	487661	25 %	25 %	0 %	50 %	56709221
10520	NC_006569	CTG	2	6	487681	487686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709221
10521	NC_006569	GC	3	6	487733	487738	0 %	0 %	50 %	50 %	56709221
10522	NC_006569	CGA	2	6	487821	487826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709221
10523	NC_006569	GAAC	2	8	487924	487931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10524	NC_006569	TTG	2	6	487936	487941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_006569	TGGGC	2	10	487968	487977	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10526	NC_006569	GGC	2	6	487987	487992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_006569	TGG	2	6	488014	488019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_006569	GGGT	2	8	488025	488032	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_006569	GCC	2	6	488046	488051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10530	NC_006569	GCGCC	2	10	488115	488124	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10531	NC_006569	ATGAC	2	10	488133	488142	40 %	20 %	20 %	20 %	56709222
10532	NC_006569	GCT	2	6	488191	488196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709222
10533	NC_006569	CGGCG	2	10	488206	488215	0 %	0 %	60 %	40 %	56709222
10534	NC_006569	GCTG	2	8	488229	488236	0 %	25 %	50 %	25 %	56709222
10535	NC_006569	C	6	6	488274	488279	0 %	0 %	0 %	100 %	56709222
10536	NC_006569	CTT	2	6	488293	488298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709222
10537	NC_006569	GC	3	6	488351	488356	0 %	0 %	50 %	50 %	56709222
10538	NC_006569	GAT	2	6	488443	488448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709222
10539	NC_006569	GAC	2	6	488453	488458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709222
10540	NC_006569	TCCGG	2	10	488623	488632	0 %	20 %	40 %	40 %	56709222
10541	NC_006569	GGC	2	6	488697	488702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709222
10542	NC_006569	CTG	2	6	488723	488728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709222
10543	NC_006569	CGA	2	6	488824	488829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709222
10544	NC_006569	CGC	2	6	488875	488880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709222
10545	NC_006569	TCT	2	6	488953	488958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709222
10546	NC_006569	TGGC	2	8	489014	489021	0 %	25 %	50 %	25 %	56709222
10547	NC_006569	G	6	6	489032	489037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_006569	GCC	2	6	489074	489079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709223
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10551	NC_006569	GGC	2	6	489247	489252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709224
10552	NC_006569	CAAC	2	8	489268	489275	50 %	0 %	0 %	50 %	56709224
10553	NC_006569	GCG	2	6	489344	489349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709224
10554	NC_006569	CCG	2	6	489371	489376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709224
10555	NC_006569	GGC	2	6	489413	489418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709224
10556	NC_006569	CTT	2	6	489421	489426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709224
10557	NC_006569	CGA	2	6	489568	489573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709225
10558	NC_006569	GGC	2	6	489598	489603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709225
10559	NC_006569	CAGC	2	8	489713	489720	25 %	0 %	25 %	50 %	56709225
10560	NC_006569	CCAGAC	2	12	489763	489774	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56709225
10561	NC_006569	CAT	2	6	489905	489910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709225
10562	NC_006569	CGG	2	6	489917	489922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709225
10563	NC_006569	CAG	2	6	489974	489979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709225
10564	NC_006569	GCT	2	6	489995	490000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709225
10565	NC_006569	CCTG	2	8	490028	490035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10566	NC_006569	GTCT	2	8	490038	490045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10567	NC_006569	GGC	2	6	490091	490096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_006569	TA	4	8	490170	490177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_006569	AACGG	2	10	490189	490198	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10570	NC_006569	CCG	2	6	490325	490330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709226
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10572	NC_006569	GCA	2	6	490352	490357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709226
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10575	NC_006569	TGC	2	6	490421	490426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709226
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10580	NC_006569	ACAA	2	8	490634	490641	75 %	0 %	0 %	25 %	56709227
10581	NC_006569	GCC	2	6	490658	490663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
10582	NC_006569	CG	3	6	490664	490669	0 %	0 %	50 %	50 %	56709227
10583	NC_006569	CCG	2	6	490680	490685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
10584	NC_006569	GTGCC	2	10	490691	490700	0 %	20 %	40 %	40 %	56709227
10585	NC_006569	AGC	2	6	490751	490756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709227
10586	NC_006569	CAT	2	6	490764	490769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709227
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10588	NC_006569	GCG	2	6	490823	490828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
10589	NC_006569	GCA	2	6	490836	490841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709227
10590	NC_006569	GGC	2	6	490852	490857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
10591	NC_006569	CCA	2	6	490866	490871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709227
10592	NC_006569	CGG	3	9	490886	490894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
10593	NC_006569	GGTCGG	2	12	490968	490979	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56709227
10594	NC_006569	GAT	2	6	490995	491000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709227
10595	NC_006569	GCGCA	2	10	491173	491182	20 %	0 %	40 %	40 %	56709227
10596	NC_006569	GCC	2	6	491241	491246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
10597	NC_006569	CGGG	2	8	491251	491258	0 %	0 %	75 %	25 %	56709227
10598	NC_006569	ACA	2	6	491292	491297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56709227
10599	NC_006569	CGG	3	9	491304	491312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
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10601	NC_006569	CCG	2	6	491328	491333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709227
10602	NC_006569	GGCT	2	8	491375	491382	0 %	25 %	50 %	25 %	56709227
10603	NC_006569	GCG	4	12	491441	491452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709227
10604	NC_006569	CGAC	2	8	491471	491478	25 %	0 %	25 %	50 %	56709227
10605	NC_006569	TTAT	2	8	491525	491532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.