MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_006569	TCG	2	6	464254	464259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709198
10002	NC_006569	GCG	2	6	464269	464274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709198
10003	NC_006569	GC	3	6	464277	464282	0 %	0 %	50 %	50 %	56709198
10004	NC_006569	CCTCGA	2	12	464285	464296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56709198
10005	NC_006569	GAGC	2	8	464340	464347	25 %	0 %	50 %	25 %	56709198
10006	NC_006569	AGA	2	6	464351	464356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709198
10007	NC_006569	CCA	2	6	464393	464398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709198
10008	NC_006569	GC	3	6	464453	464458	0 %	0 %	50 %	50 %	56709198
10009	NC_006569	CCG	2	6	464495	464500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709198
10010	NC_006569	GCG	2	6	464505	464510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709198
10011	NC_006569	TGT	2	6	464643	464648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_006569	TG	3	6	464738	464743	0 %	50 %	50 %	0 %	56709199
10013	NC_006569	ACC	2	6	464749	464754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709199
10014	NC_006569	TGC	2	6	464774	464779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709199
10015	NC_006569	CGA	2	6	464814	464819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709199
10016	NC_006569	CAC	2	6	464964	464969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709199
10017	NC_006569	GCGG	2	8	465093	465100	0 %	0 %	75 %	25 %	56709199
10018	NC_006569	GCG	2	6	465133	465138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
10019	NC_006569	TGC	2	6	465180	465185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709199
10020	NC_006569	GGC	2	6	465258	465263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
10021	NC_006569	GGT	2	6	465307	465312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709199
10022	NC_006569	GAG	2	6	465337	465342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709199
10023	NC_006569	CGT	2	6	465435	465440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709199
10024	NC_006569	CGA	2	6	465459	465464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709199
10025	NC_006569	GAT	2	6	465474	465479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709199
10026	NC_006569	TGG	2	6	465494	465499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709199
10027	NC_006569	GCCGG	2	10	465512	465521	0 %	0 %	60 %	40 %	56709199
10028	NC_006569	ACC	3	9	465526	465534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709199
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10030	NC_006569	GGT	2	6	465627	465632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709199
10031	NC_006569	CTGGCC	2	12	465646	465657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56709199
10032	NC_006569	CG	3	6	465682	465687	0 %	0 %	50 %	50 %	56709199
10033	NC_006569	GGC	2	6	465706	465711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
10034	NC_006569	GCG	3	9	465712	465720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
10035	NC_006569	GAA	2	6	465729	465734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709199
10036	NC_006569	CG	3	6	465808	465813	0 %	0 %	50 %	50 %	56709199
10037	NC_006569	TGA	2	6	465815	465820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709199
10038	NC_006569	GTG	2	6	465844	465849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709199
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10040	NC_006569	TCA	2	6	465917	465922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709199
10041	NC_006569	CG	3	6	465928	465933	0 %	0 %	50 %	50 %	56709199
10042	NC_006569	GCG	2	6	465961	465966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
10043	NC_006569	GGC	2	6	465983	465988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
10044	NC_006569	GCCA	2	8	466123	466130	25 %	0 %	25 %	50 %	56709199
10045	NC_006569	CG	3	6	466146	466151	0 %	0 %	50 %	50 %	56709199
10046	NC_006569	GCG	2	6	466195	466200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709199
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10050	NC_006569	GCC	2	6	466387	466392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_006569	TGCGTG	2	12	466441	466452	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10052	NC_006569	GGCG	2	8	466465	466472	0 %	0 %	75 %	25 %	56709200
10053	NC_006569	GTG	2	6	466503	466508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709200
10054	NC_006569	AGC	2	6	466524	466529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709200
10055	NC_006569	GCC	2	6	466571	466576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709200
10056	NC_006569	GCG	4	12	466614	466625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709200
10057	NC_006569	TCC	2	6	466641	466646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709200
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10059	NC_006569	TGG	2	6	466717	466722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709200
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10062	NC_006569	GGGTC	2	10	466849	466858	0 %	20 %	60 %	20 %	56709200
10063	NC_006569	GCT	2	6	466922	466927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709200
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10070	NC_006569	GGC	2	6	467261	467266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709200
10071	NC_006569	TCC	2	6	467297	467302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_006569	CGG	2	6	467373	467378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709201
10073	NC_006569	GC	3	6	467389	467394	0 %	0 %	50 %	50 %	56709201
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10080	NC_006569	G	6	6	467725	467730	0 %	0 %	100 %	0 %	56709202
10081	NC_006569	TCCAG	2	10	467749	467758	20 %	20 %	20 %	40 %	56709202
10082	NC_006569	GAT	2	6	467771	467776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709202
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10085	NC_006569	GCA	2	6	467812	467817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709202
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10091	NC_006569	GGTC	2	8	468261	468268	0 %	25 %	50 %	25 %	56709203
10092	NC_006569	TCG	2	6	468380	468385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709203
10093	NC_006569	GTC	2	6	468550	468555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709203
10094	NC_006569	GTC	2	6	468595	468600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709203
10095	NC_006569	GGCG	2	8	468607	468614	0 %	0 %	75 %	25 %	56709203
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10098	NC_006569	G	6	6	468691	468696	0 %	0 %	100 %	0 %	56709203
10099	NC_006569	G	6	6	468701	468706	0 %	0 %	100 %	0 %	56709203
10100	NC_006569	GGC	2	6	468743	468748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_006569	GCG	2	6	468803	468808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_006569	T	7	7	468899	468905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_006569	AGA	2	6	468924	468929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_006569	GGT	2	6	468956	468961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_006569	CAA	2	6	469027	469032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56709204
10106	NC_006569	TGG	2	6	469107	469112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709204
10107	NC_006569	AGG	2	6	469161	469166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709204
10108	NC_006569	TCG	2	6	469173	469178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709204
10109	NC_006569	CGCC	2	8	469248	469255	0 %	0 %	25 %	75 %	56709204
10110	NC_006569	TCA	2	6	469326	469331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709204
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10112	NC_006569	CTG	3	9	469472	469480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709204
10113	NC_006569	AGG	2	6	469482	469487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709204
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10115	NC_006569	CTG	2	6	469559	469564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709204
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10118	NC_006569	GC	3	6	469768	469773	0 %	0 %	50 %	50 %	56709205
10119	NC_006569	GCA	2	6	469816	469821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10120	NC_006569	TCC	2	6	469827	469832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709205
10121	NC_006569	CCT	2	6	469906	469911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709205
10122	NC_006569	GGC	2	6	469919	469924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709205
10123	NC_006569	GTCATA	2	12	469955	469966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56709205
10124	NC_006569	GGC	2	6	469993	469998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709205
10125	NC_006569	GCTG	2	8	470002	470009	0 %	25 %	50 %	25 %	56709205
10126	NC_006569	ATC	2	6	470010	470015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709205
10127	NC_006569	GCGG	2	8	470030	470037	0 %	0 %	75 %	25 %	56709205
10128	NC_006569	AGC	2	6	470127	470132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10129	NC_006569	CCA	2	6	470203	470208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709205
10130	NC_006569	GAT	2	6	470222	470227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709205
10131	NC_006569	GAT	2	6	470276	470281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709205
10132	NC_006569	GC	4	8	470316	470323	0 %	0 %	50 %	50 %	56709205
10133	NC_006569	TCT	2	6	470341	470346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709205
10134	NC_006569	GAT	2	6	470354	470359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709205
10135	NC_006569	GAA	2	6	470390	470395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709205
10136	NC_006569	CGA	2	6	470404	470409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10137	NC_006569	AGC	2	6	470493	470498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10138	NC_006569	GAT	2	6	470555	470560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709205
10139	NC_006569	GTC	2	6	470579	470584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10140	NC_006569	GTCG	2	8	470591	470598	0 %	25 %	50 %	25 %	56709205
10141	NC_006569	CTC	2	6	470627	470632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709205
10142	NC_006569	GCC	2	6	470700	470705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10143	NC_006569	CAC	2	6	470726	470731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709205
10144	NC_006569	CAT	2	6	470774	470779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709205
10145	NC_006569	GCC	2	6	470843	470848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10146	NC_006569	CGG	2	6	470925	470930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709205
10147	NC_006569	ATG	2	6	470982	470987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709205
10148	NC_006569	TCT	2	6	471025	471030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709205
10149	NC_006569	GCG	3	9	471042	471050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709205
10150	NC_006569	CCG	2	6	471090	471095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10151	NC_006569	CCG	3	9	471133	471141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10152	NC_006569	CAC	2	6	471200	471205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709205
10153	NC_006569	GCC	2	6	471314	471319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10154	NC_006569	CCG	2	6	471321	471326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10155	NC_006569	GCA	2	6	471328	471333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10156	NC_006569	CGG	2	6	471379	471384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709205
10157	NC_006569	GGT	2	6	471391	471396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709205
10158	NC_006569	CAGA	2	8	471404	471411	50 %	0 %	25 %	25 %	56709205
10159	NC_006569	GCG	2	6	471432	471437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709205
10160	NC_006569	GCT	2	6	471466	471471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709205
10161	NC_006569	CCG	2	6	471479	471484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709205
10162	NC_006569	GCTCCG	2	12	471616	471627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56709205
10163	NC_006569	GCC	2	6	471803	471808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709206
10164	NC_006569	ATC	2	6	471825	471830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709206
10165	NC_006569	TCG	2	6	471858	471863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709206
10166	NC_006569	ATGGCG	2	12	471912	471923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56709206
10167	NC_006569	CCG	2	6	471924	471929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709206
10168	NC_006569	AGCGC	2	10	471973	471982	20 %	0 %	40 %	40 %	56709206
10169	NC_006569	GATGTC	2	12	472013	472024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56709206
10170	NC_006569	GCC	2	6	472062	472067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709206
10171	NC_006569	GC	5	10	472127	472136	0 %	0 %	50 %	50 %	56709206
10172	NC_006569	CGG	2	6	472183	472188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709206
10173	NC_006569	TCA	2	6	472275	472280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709206
10174	NC_006569	GC	3	6	472318	472323	0 %	0 %	50 %	50 %	56709206
10175	NC_006569	TGTCGG	2	12	472336	472347	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56709206
10176	NC_006569	TGA	2	6	472351	472356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709206
10177	NC_006569	CAC	2	6	472403	472408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709206
10178	NC_006569	GCGCG	2	10	472441	472450	0 %	0 %	60 %	40 %	56709206
10179	NC_006569	TGG	2	6	472504	472509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709206
10180	NC_006569	TCGAT	2	10	472615	472624	20 %	40 %	20 %	20 %	56709206
10181	NC_006569	CCGC	2	8	472626	472633	0 %	0 %	25 %	75 %	56709206
10182	NC_006569	ACC	2	6	472635	472640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709206
10183	NC_006569	CTC	2	6	472643	472648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709206
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10186	NC_006569	CG	3	6	472828	472833	0 %	0 %	50 %	50 %	56709206
10187	NC_006569	GC	3	6	472850	472855	0 %	0 %	50 %	50 %	56709206
10188	NC_006569	GCA	2	6	472867	472872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709206
10189	NC_006569	CGG	2	6	472876	472881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709206
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10191	NC_006569	CG	3	6	472927	472932	0 %	0 %	50 %	50 %	56709206
10192	NC_006569	CGT	2	6	472951	472956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709206
10193	NC_006569	TCC	2	6	472985	472990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10194	NC_006569	CGA	2	6	473095	473100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709207
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10198	NC_006569	CCGC	2	8	473270	473277	0 %	0 %	25 %	75 %	56709207
10199	NC_006569	GCC	2	6	473304	473309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709207
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10202	NC_006569	GCG	2	6	473466	473471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709207
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10211	NC_006569	CG	4	8	473828	473835	0 %	0 %	50 %	50 %	56709207
10212	NC_006569	GCG	3	9	473861	473869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709207
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10215	NC_006569	CG	3	6	474043	474048	0 %	0 %	50 %	50 %	56709207
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10220	NC_006569	GTC	2	6	474431	474436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10221	NC_006569	C	6	6	474478	474483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10222	NC_006569	GCC	2	6	474500	474505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709209
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10224	NC_006569	GC	5	10	474583	474592	0 %	0 %	50 %	50 %	56709209
10225	NC_006569	TCG	2	6	474600	474605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709209
10226	NC_006569	GGGA	2	8	474632	474639	25 %	0 %	75 %	0 %	56709209
10227	NC_006569	TGC	2	6	474664	474669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709209
10228	NC_006569	CAG	3	9	474710	474718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709209
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10230	NC_006569	GGC	2	6	474752	474757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709209
10231	NC_006569	GCG	2	6	474784	474789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709209
10232	NC_006569	GCG	2	6	474819	474824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709209
10233	NC_006569	GCC	2	6	474845	474850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709209
10234	NC_006569	CG	3	6	474851	474856	0 %	0 %	50 %	50 %	56709209
10235	NC_006569	CGCA	2	8	474890	474897	25 %	0 %	25 %	50 %	56709209
10236	NC_006569	TGG	2	6	474919	474924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709209
10237	NC_006569	CG	3	6	474970	474975	0 %	0 %	50 %	50 %	56709209
10238	NC_006569	G	6	6	474995	475000	0 %	0 %	100 %	0 %	56709209
10239	NC_006569	GCG	2	6	475021	475026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709209
10240	NC_006569	CAG	2	6	475094	475099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709209
10241	NC_006569	CGAC	2	8	475144	475151	25 %	0 %	25 %	50 %	56709209
10242	NC_006569	GCCC	2	8	475180	475187	0 %	0 %	25 %	75 %	56709209
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10472	NC_006569	GC	4	8	485851	485858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10491	NC_006569	GGC	2	6	486526	486531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709220
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10493	NC_006569	TCA	2	6	486756	486761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709221
10494	NC_006569	TGA	2	6	486852	486857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709221
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