MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006569	TCG	2	6	257742	257747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5502	NC_006569	TCG	2	6	257784	257789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5503	NC_006569	CGGAAC	2	12	257806	257817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709019
5504	NC_006569	CGG	2	6	257827	257832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709019
5505	NC_006569	GGT	2	6	257857	257862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709019
5506	NC_006569	CGC	2	6	257913	257918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709019
5507	NC_006569	CTGG	2	8	257944	257951	0 %	25 %	50 %	25 %	56709019
5508	NC_006569	GC	5	10	258002	258011	0 %	0 %	50 %	50 %	56709019
5509	NC_006569	GC	3	6	258066	258071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_006569	CGA	2	6	258259	258264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709020
5511	NC_006569	GTC	2	6	258276	258281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709020
5512	NC_006569	GC	3	6	258339	258344	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5513	NC_006569	GTG	2	6	258429	258434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709020
5514	NC_006569	GC	3	6	258456	258461	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5515	NC_006569	CGC	2	6	258548	258553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709020
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5518	NC_006569	GCTG	2	8	258769	258776	0 %	25 %	50 %	25 %	56709020
5519	NC_006569	CGC	2	6	258862	258867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709020
5520	NC_006569	CG	3	6	258899	258904	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5521	NC_006569	CGG	2	6	258957	258962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709020
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5523	NC_006569	GAT	2	6	259044	259049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709020
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5525	NC_006569	GTC	2	6	259086	259091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709020
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5530	NC_006569	GC	3	6	259167	259172	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
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5538	NC_006569	GC	3	6	259387	259392	0 %	0 %	50 %	50 %	56709020
5539	NC_006569	GGC	2	6	259403	259408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709020
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5541	NC_006569	TCT	2	6	259643	259648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709020
5542	NC_006569	GAT	2	6	259688	259693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709020
5543	NC_006569	ACAG	2	8	259710	259717	50 %	0 %	25 %	25 %	56709020
5544	NC_006569	ACC	2	6	259800	259805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709020
5545	NC_006569	ATG	2	6	259867	259872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709020
5546	NC_006569	GCGACA	2	12	259888	259899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709020
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5549	NC_006569	GAA	2	6	259964	259969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709021
5550	NC_006569	CGA	2	6	259996	260001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709021
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5553	NC_006569	TGG	2	6	260082	260087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709021
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5558	NC_006569	CGC	3	9	260190	260198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709021
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5581	NC_006569	GCCCT	2	10	261304	261313	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5582	NC_006569	GGTT	2	8	261331	261338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_006569	GAG	2	6	261418	261423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_006569	GAATG	2	10	261500	261509	40 %	20 %	40 %	0 %	56709022
5585	NC_006569	CGT	2	6	261527	261532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709022
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5593	NC_006569	CG	3	6	261888	261893	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
5594	NC_006569	GC	3	6	261925	261930	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
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5601	NC_006569	CTG	2	6	262238	262243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709022
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5605	NC_006569	GGCC	2	8	262330	262337	0 %	0 %	50 %	50 %	56709022
5606	NC_006569	GCT	2	6	262393	262398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709022
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5609	NC_006569	GTC	2	6	262465	262470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_006569	GCAT	2	8	262524	262531	25 %	25 %	25 %	25 %	56709023
5611	NC_006569	GC	3	6	262550	262555	0 %	0 %	50 %	50 %	56709023
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5620	NC_006569	TCGA	2	8	262939	262946	25 %	25 %	25 %	25 %	56709023
5621	NC_006569	GGGC	2	8	263038	263045	0 %	0 %	75 %	25 %	56709023
5622	NC_006569	GCC	2	6	263098	263103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709023
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5624	NC_006569	CGG	2	6	263176	263181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709024
5625	NC_006569	TTCTGG	2	12	263184	263195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56709024
5626	NC_006569	GCC	2	6	263222	263227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709024
5627	NC_006569	TGG	2	6	263241	263246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709024
5628	NC_006569	TCT	2	6	263259	263264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709024
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5632	NC_006569	CGG	2	6	263544	263549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709024
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5641	NC_006569	ATC	3	9	263879	263887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709024
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5661	NC_006569	GGCT	2	8	264583	264590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5663	NC_006569	GGTC	2	8	264658	264665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5664	NC_006569	GGCG	2	8	264724	264731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5682	NC_006569	T	8	8	265813	265820	0 %	100 %	0 %	0 %	56709026
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5703	NC_006569	TTC	2	6	266870	266875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5994	NC_006569	CCGGC	2	10	283166	283175	0 %	0 %	40 %	60 %	56709042
5995	NC_006569	CGA	2	6	283259	283264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709042
5996	NC_006569	GTG	2	6	283288	283293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709042
5997	NC_006569	GCA	2	6	283331	283336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709042
5998	NC_006569	ATC	2	6	283390	283395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709042
5999	NC_006569	TGC	2	6	283405	283410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709042
6000	NC_006569	CCG	2	6	283451	283456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709042

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