MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

< Previous12...3031323334353637383940...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_006142	A	7	7	621115	621121	100 %	0 %	0 %	0 %	51473682
17003	NC_006142	TTCTTG	2	12	621122	621133	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	51473682
17004	NC_006142	TGT	3	9	621141	621149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473682
17005	NC_006142	A	6	6	621238	621243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_006142	A	7	7	621292	621298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_006142	CTTAA	2	10	621318	621327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17008	NC_006142	A	6	6	621346	621351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_006142	TAA	2	6	621372	621377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_006142	A	7	7	621449	621455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_006142	ATT	2	6	621461	621466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473683
17012	NC_006142	TTTA	2	8	621498	621505	25 %	75 %	0 %	0 %	51473683
17013	NC_006142	TAG	2	6	621512	621517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473683
17014	NC_006142	AGA	2	6	621585	621590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473683
17015	NC_006142	TAAAA	2	10	621810	621819	80 %	20 %	0 %	0 %	51473683
17016	NC_006142	TAT	2	6	621825	621830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473683
17017	NC_006142	ATT	2	6	621852	621857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473683
17018	NC_006142	A	6	6	621864	621869	100 %	0 %	0 %	0 %	51473683
17019	NC_006142	TAA	2	6	621881	621886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473683
17020	NC_006142	TTC	2	6	621929	621934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473683
17021	NC_006142	TGC	3	9	622044	622052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473683
17022	NC_006142	CTA	2	6	622067	622072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473683
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17024	NC_006142	TGA	2	6	622128	622133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473683
17025	NC_006142	ATC	2	6	622138	622143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473683
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17027	NC_006142	T	6	6	622174	622179	0 %	100 %	0 %	0 %	51473683
17028	NC_006142	TAGT	2	8	622277	622284	25 %	50 %	25 %	0 %	51473683
17029	NC_006142	GT	3	6	622301	622306	0 %	50 %	50 %	0 %	51473683
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17033	NC_006142	TTC	2	6	622437	622442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473683
17034	NC_006142	GTA	2	6	622447	622452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473683
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17039	NC_006142	A	7	7	622669	622675	100 %	0 %	0 %	0 %	51473683
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17041	NC_006142	ACAT	2	8	622729	622736	50 %	25 %	0 %	25 %	51473683
17042	NC_006142	TTA	2	6	622742	622747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473683
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17044	NC_006142	TAG	2	6	622808	622813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473683
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17048	NC_006142	TA	3	6	623034	623039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_006142	TAA	2	6	623105	623110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_006142	ATT	2	6	623217	623222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473684
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17053	NC_006142	A	6	6	623476	623481	100 %	0 %	0 %	0 %	51473684
17054	NC_006142	TA	3	6	623483	623488	50 %	50 %	0 %	0 %	51473684
17055	NC_006142	AAG	2	6	623496	623501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473684
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17059	NC_006142	TA	3	6	623723	623728	50 %	50 %	0 %	0 %	51473684
17060	NC_006142	AGA	2	6	623740	623745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473684
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17067	NC_006142	GTT	2	6	624051	624056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473684
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17069	NC_006142	TTAAG	2	10	624092	624101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_006142	TAC	2	6	624122	624127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473685
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17081	NC_006142	TA	3	6	624448	624453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_006142	TGA	2	6	624478	624483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17105	NC_006142	AAAG	2	8	625257	625264	75 %	0 %	25 %	0 %	51473686
17106	NC_006142	ATT	2	6	625275	625280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473686
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17111	NC_006142	TAA	2	6	625455	625460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473686
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17115	NC_006142	TAGT	2	8	625589	625596	25 %	50 %	25 %	0 %	51473686
17116	NC_006142	TA	3	6	625675	625680	50 %	50 %	0 %	0 %	51473686
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