MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_006142	TAAG	2	8	550349	550356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_006142	TTG	2	6	550435	550440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_006142	CAG	2	6	550450	550455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_006142	A	7	7	550491	550497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_006142	AT	3	6	550513	550518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_006142	TAA	2	6	550547	550552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_006142	AG	3	6	550557	550562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_006142	TAG	2	6	550590	550595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_006142	ATA	2	6	550604	550609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_006142	AAG	2	6	550625	550630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_006142	ATTA	2	8	550643	550650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_006142	A	6	6	550652	550657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_006142	GAT	2	6	550673	550678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_006142	A	6	6	550716	550721	100 %	0 %	0 %	0 %	51473637
15016	NC_006142	A	8	8	550724	550731	100 %	0 %	0 %	0 %	51473637
15017	NC_006142	TGA	2	6	550732	550737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473637
15018	NC_006142	AAT	2	6	550771	550776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473637
15019	NC_006142	A	6	6	550783	550788	100 %	0 %	0 %	0 %	51473637
15020	NC_006142	TAG	2	6	550795	550800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473637
15021	NC_006142	GAA	2	6	550862	550867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473637
15022	NC_006142	TA	3	6	550868	550873	50 %	50 %	0 %	0 %	51473637
15023	NC_006142	ATT	2	6	550904	550909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473637
15024	NC_006142	TAG	2	6	550944	550949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473637
15025	NC_006142	GCA	2	6	550997	551002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473637
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15027	NC_006142	TAC	2	6	551055	551060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473637
15028	NC_006142	ATG	2	6	551067	551072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473637
15029	NC_006142	TGA	2	6	551083	551088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473637
15030	NC_006142	AGA	2	6	551107	551112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473637
15031	NC_006142	A	6	6	551150	551155	100 %	0 %	0 %	0 %	51473637
15032	NC_006142	ACA	2	6	551236	551241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473637
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15036	NC_006142	TGC	2	6	551389	551394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473637
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15041	NC_006142	ATT	2	6	551647	551652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473637
15042	NC_006142	AGA	2	6	551654	551659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473637
15043	NC_006142	ATAAAG	2	12	551797	551808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51473637
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15047	NC_006142	CTA	2	6	552007	552012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473637
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15049	NC_006142	AAG	2	6	552029	552034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473637
15050	NC_006142	AAT	2	6	552050	552055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_006142	TGG	2	6	552195	552200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473638
15052	NC_006142	ATC	2	6	552213	552218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473638
15053	NC_006142	GCC	2	6	552255	552260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51473638
15054	NC_006142	TAG	2	6	552273	552278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473638
15055	NC_006142	TTA	2	6	552311	552316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473638
15056	NC_006142	TAC	2	6	552332	552337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473638
15057	NC_006142	AT	3	6	552390	552395	50 %	50 %	0 %	0 %	51473638
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15060	NC_006142	T	7	7	552429	552435	0 %	100 %	0 %	0 %	51473638
15061	NC_006142	GT	3	6	552497	552502	0 %	50 %	50 %	0 %	51473638
15062	NC_006142	TA	4	8	552512	552519	50 %	50 %	0 %	0 %	51473638
15063	NC_006142	TTA	2	6	552520	552525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473638
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15065	NC_006142	CAT	2	6	552545	552550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473638
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15081	NC_006142	A	8	8	553053	553060	100 %	0 %	0 %	0 %	51473638
15082	NC_006142	TA	3	6	553116	553121	50 %	50 %	0 %	0 %	51473638
15083	NC_006142	TAT	2	6	553133	553138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473638
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15085	NC_006142	GTA	2	6	553166	553171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473638
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15087	NC_006142	TATAT	2	10	553222	553231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_006142	TA	3	6	553252	553257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_006142	TGA	2	6	553279	553284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473639
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15091	NC_006142	GA	3	6	553313	553318	50 %	0 %	50 %	0 %	51473639
15092	NC_006142	TTG	2	6	553354	553359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473639
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15094	NC_006142	CT	3	6	553383	553388	0 %	50 %	0 %	50 %	51473639
15095	NC_006142	TAC	2	6	553391	553396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473639
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15098	NC_006142	AT	3	6	553421	553426	50 %	50 %	0 %	0 %	51473639
15099	NC_006142	A	6	6	553443	553448	100 %	0 %	0 %	0 %	51473639
15100	NC_006142	GAA	2	6	553593	553598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473639
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15105	NC_006142	AATG	2	8	553703	553710	50 %	25 %	25 %	0 %	51473639
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15109	NC_006142	AT	3	6	553789	553794	50 %	50 %	0 %	0 %	51473639
15110	NC_006142	AAACA	2	10	553822	553831	80 %	0 %	0 %	20 %	51473639
15111	NC_006142	TTA	2	6	553836	553841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473639
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15115	NC_006142	GCAT	2	8	553919	553926	25 %	25 %	25 %	25 %	51473639
15116	NC_006142	GCA	2	6	553928	553933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473639
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15120	NC_006142	A	7	7	554046	554052	100 %	0 %	0 %	0 %	51473639
15121	NC_006142	AAG	2	6	554074	554079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473639
15122	NC_006142	CTGAAT	2	12	554092	554103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51473639
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15124	NC_006142	TAT	2	6	554332	554337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473639
15125	NC_006142	CCA	2	6	554349	554354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473639
15126	NC_006142	GAA	2	6	554401	554406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473639
15127	NC_006142	TGG	2	6	554426	554431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473639
15128	NC_006142	CTT	2	6	554541	554546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473639
15129	NC_006142	CTGCAT	2	12	554587	554598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	51473639
15130	NC_006142	TGT	2	6	554675	554680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473639
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15132	NC_006142	GAA	2	6	554766	554771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473639
15133	NC_006142	A	6	6	554786	554791	100 %	0 %	0 %	0 %	51473639
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15139	NC_006142	A	7	7	555023	555029	100 %	0 %	0 %	0 %	51473639
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15141	NC_006142	GTA	2	6	555067	555072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473639
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15145	NC_006142	GCT	2	6	555198	555203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473639
15146	NC_006142	GTT	2	6	555208	555213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473639
15147	NC_006142	CTG	2	6	555316	555321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473639
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15154	NC_006142	TAAT	2	8	555645	555652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15155	NC_006142	GCAAAA	2	12	555653	555664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15156	NC_006142	TA	3	6	555715	555720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15157	NC_006142	ACC	2	6	555748	555753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15158	NC_006142	TAA	2	6	555754	555759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_006142	TACT	2	8	555810	555817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15160	NC_006142	TAC	3	9	555863	555871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15162	NC_006142	CTA	2	6	555917	555922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15163	NC_006142	ATT	2	6	555925	555930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15164	NC_006142	ATT	2	6	555960	555965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15165	NC_006142	AT	3	6	556013	556018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15166	NC_006142	AATT	2	8	556085	556092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15167	NC_006142	A	6	6	556120	556125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15168	NC_006142	ATT	2	6	556136	556141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15172	NC_006142	A	6	6	556237	556242	100 %	0 %	0 %	0 %	51473640
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15235	NC_006142	AT	3	6	558962	558967	50 %	50 %	0 %	0 %	51473640
15236	NC_006142	ATA	2	6	558974	558979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
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15240	NC_006142	TAA	2	6	559077	559082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15241	NC_006142	TAT	2	6	559101	559106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15242	NC_006142	TGA	2	6	559158	559163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
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15244	NC_006142	TAA	3	9	559233	559241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15245	NC_006142	AGTA	2	8	559254	559261	50 %	25 %	25 %	0 %	51473640
15246	NC_006142	TAG	2	6	559269	559274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15247	NC_006142	TAA	2	6	559344	559349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15248	NC_006142	GGT	2	6	559366	559371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473640
15249	NC_006142	GGTAAT	2	12	559387	559398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15250	NC_006142	TAA	2	6	559416	559421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15251	NC_006142	GTA	2	6	559436	559441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15252	NC_006142	TCA	2	6	559515	559520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
15253	NC_006142	GAA	2	6	559597	559602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473640
15254	NC_006142	TGGTA	2	10	559662	559671	20 %	40 %	40 %	0 %	51473640
15255	NC_006142	TAA	2	6	559787	559792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15256	NC_006142	ATA	2	6	559817	559822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
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15259	NC_006142	TGA	2	6	560073	560078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
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15261	NC_006142	TGC	2	6	560183	560188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15262	NC_006142	ATT	2	6	560228	560233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15263	NC_006142	TAA	3	9	560259	560267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15264	NC_006142	TGC	2	6	560277	560282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
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15268	NC_006142	TGT	2	6	560451	560456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473640
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15270	NC_006142	ATAA	2	8	560524	560531	75 %	25 %	0 %	0 %	51473640
15271	NC_006142	AAT	2	6	560548	560553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15272	NC_006142	TAT	3	9	560562	560570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15273	NC_006142	ATA	2	6	560588	560593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15274	NC_006142	ATG	2	6	560624	560629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15275	NC_006142	TGC	2	6	560676	560681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15276	NC_006142	ACC	2	6	560689	560694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473640
15277	NC_006142	GCA	2	6	560707	560712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15278	NC_006142	ATA	2	6	560744	560749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15279	NC_006142	ACG	2	6	560786	560791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15280	NC_006142	ATA	2	6	560810	560815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15281	NC_006142	TAC	2	6	560886	560891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
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15283	NC_006142	ATA	2	6	561074	561079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15284	NC_006142	A	6	6	561090	561095	100 %	0 %	0 %	0 %	51473640
15285	NC_006142	CTCACT	2	12	561141	561152	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	51473640
15286	NC_006142	TGT	2	6	561231	561236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473640
15287	NC_006142	TGG	2	6	561258	561263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473640
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15290	NC_006142	TAA	2	6	561336	561341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
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15294	NC_006142	ACT	2	6	561510	561515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
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15297	NC_006142	TAA	2	6	561611	561616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15298	NC_006142	AGT	2	6	561672	561677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15299	NC_006142	AT	3	6	561697	561702	50 %	50 %	0 %	0 %	51473640
15300	NC_006142	ATT	2	6	561727	561732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
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15302	NC_006142	TAA	3	9	561873	561881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15303	NC_006142	TAG	2	6	561882	561887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15304	NC_006142	AGT	2	6	561894	561899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15305	NC_006142	TAAAGA	2	12	561909	561920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51473640
15306	NC_006142	TTA	2	6	562016	562021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15307	NC_006142	TAC	2	6	562044	562049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
15308	NC_006142	ATT	2	6	562062	562067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15309	NC_006142	TAGA	2	8	562112	562119	50 %	25 %	25 %	0 %	51473640
15310	NC_006142	T	6	6	562191	562196	0 %	100 %	0 %	0 %	51473640
15311	NC_006142	AATA	2	8	562209	562216	75 %	25 %	0 %	0 %	51473640
15312	NC_006142	CTG	2	6	562229	562234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15313	NC_006142	AGA	2	6	562254	562259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473640
15314	NC_006142	AAT	3	9	562315	562323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15315	NC_006142	AAG	2	6	562332	562337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473640
15316	NC_006142	TGC	2	6	562341	562346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
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15318	NC_006142	TGC	2	6	562365	562370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15319	NC_006142	TGA	2	6	562374	562379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473640
15320	NC_006142	ATA	2	6	562382	562387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15321	NC_006142	TAAAA	2	10	562422	562431	80 %	20 %	0 %	0 %	51473640
15322	NC_006142	TGC	2	6	562527	562532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473640
15323	NC_006142	GTG	2	6	562577	562582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473640
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15325	NC_006142	TAA	3	9	562638	562646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
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15327	NC_006142	GT	3	6	562667	562672	0 %	50 %	50 %	0 %	51473640
15328	NC_006142	TTA	2	6	562745	562750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15329	NC_006142	TAC	2	6	562806	562811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
15330	NC_006142	TAC	2	6	562839	562844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
15331	NC_006142	ATA	2	6	562853	562858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15332	NC_006142	ATA	2	6	562871	562876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15333	NC_006142	ATT	2	6	562955	562960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473640
15334	NC_006142	ATA	3	9	562972	562980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15335	NC_006142	ACA	2	6	563071	563076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473640
15336	NC_006142	GGT	3	9	563113	563121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473640
15337	NC_006142	CTA	2	6	563126	563131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473640
15338	NC_006142	ATA	2	6	563135	563140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473640
15339	NC_006142	A	6	6	563179	563184	100 %	0 %	0 %	0 %	51473640
15340	NC_006142	AT	3	6	563229	563234	50 %	50 %	0 %	0 %	51473640
15341	NC_006142	TA	3	6	563236	563241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15342	NC_006142	TAA	2	6	563288	563293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15343	NC_006142	CTA	2	6	563358	563363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15344	NC_006142	TAA	2	6	563364	563369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15345	NC_006142	TTA	2	6	563388	563393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15346	NC_006142	TTA	2	6	563456	563461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15347	NC_006142	TAA	2	6	563486	563491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15348	NC_006142	ATA	2	6	563494	563499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15349	NC_006142	GAAT	2	8	563516	563523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15350	NC_006142	TAGA	2	8	563552	563559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15351	NC_006142	T	7	7	563592	563598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15352	NC_006142	AAC	2	6	563649	563654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15353	NC_006142	ATTA	2	8	563667	563674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_006142	TTA	2	6	563730	563735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_006142	ATTT	2	8	563740	563747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_006142	ATTA	2	8	563792	563799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15357	NC_006142	TAT	2	6	563813	563818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_006142	ATT	2	6	563840	563845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15359	NC_006142	T	6	6	563884	563889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15360	NC_006142	AT	3	6	563942	563947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15361	NC_006142	ATT	2	6	563950	563955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473641
15362	NC_006142	ACA	2	6	563956	563961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473641
15363	NC_006142	CATAG	2	10	564006	564015	40 %	20 %	20 %	20 %	51473641
15364	NC_006142	GCT	2	6	564025	564030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473641
15365	NC_006142	TAA	2	6	564086	564091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473641
15366	NC_006142	CAC	2	6	564163	564168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473641
15367	NC_006142	TAA	2	6	564241	564246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473641
15368	NC_006142	CTA	2	6	564249	564254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473641
15369	NC_006142	CCG	2	6	564315	564320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51473641
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