MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_006142	ATTT	2	8	532943	532950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_006142	TTA	2	6	532951	532956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_006142	A	6	6	532956	532961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_006142	ATT	2	6	532995	533000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_006142	ATT	2	6	533041	533046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_006142	TTA	2	6	533060	533065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_006142	TTTGT	2	10	533161	533170	0 %	80 %	20 %	0 %	51473624
14508	NC_006142	CGTAAT	2	12	533225	533236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51473624
14509	NC_006142	TTTAT	2	10	533266	533275	20 %	80 %	0 %	0 %	51473624
14510	NC_006142	TAA	2	6	533279	533284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473624
14511	NC_006142	ATT	2	6	533307	533312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473624
14512	NC_006142	GAAA	2	8	533357	533364	75 %	0 %	25 %	0 %	51473624
14513	NC_006142	CTG	2	6	533387	533392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473624
14514	NC_006142	TCT	2	6	533433	533438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473624
14515	NC_006142	TGCT	2	8	533489	533496	0 %	50 %	25 %	25 %	51473624
14516	NC_006142	TGT	2	6	533503	533508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473624
14517	NC_006142	T	6	6	533532	533537	0 %	100 %	0 %	0 %	51473624
14518	NC_006142	AT	3	6	533549	533554	50 %	50 %	0 %	0 %	51473625
14519	NC_006142	ATA	2	6	533568	533573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473625
14520	NC_006142	AAC	2	6	533588	533593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473625
14521	NC_006142	A	7	7	533625	533631	100 %	0 %	0 %	0 %	51473625
14522	NC_006142	CAA	2	6	533645	533650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473625
14523	NC_006142	AAAT	2	8	533668	533675	75 %	25 %	0 %	0 %	51473625
14524	NC_006142	TATAA	2	10	533702	533711	60 %	40 %	0 %	0 %	51473625
14525	NC_006142	A	6	6	533762	533767	100 %	0 %	0 %	0 %	51473625
14526	NC_006142	TTC	2	6	533780	533785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473625
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14530	NC_006142	TTA	2	6	533843	533848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473625
14531	NC_006142	TAT	2	6	533852	533857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473625
14532	NC_006142	ATA	2	6	533908	533913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473625
14533	NC_006142	AAT	2	6	533938	533943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473625
14534	NC_006142	TAA	2	6	533975	533980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_006142	T	6	6	533981	533986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_006142	ATT	2	6	533995	534000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_006142	A	7	7	534007	534013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_006142	TAA	2	6	534027	534032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_006142	AATTT	2	10	534063	534072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_006142	TA	3	6	534091	534096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_006142	CAA	3	9	534130	534138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473626
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14543	NC_006142	CG	3	6	534170	534175	0 %	0 %	50 %	50 %	51473626
14544	NC_006142	T	6	6	534178	534183	0 %	100 %	0 %	0 %	51473626
14545	NC_006142	T	7	7	534242	534248	0 %	100 %	0 %	0 %	51473626
14546	NC_006142	TAT	2	6	534253	534258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473626
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14552	NC_006142	TAC	2	6	534407	534412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473626
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14554	NC_006142	TAT	2	6	534453	534458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473626
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14556	NC_006142	T	8	8	534583	534590	0 %	100 %	0 %	0 %	51473626
14557	NC_006142	T	6	6	534595	534600	0 %	100 %	0 %	0 %	51473626
14558	NC_006142	A	6	6	534606	534611	100 %	0 %	0 %	0 %	51473626
14559	NC_006142	GATAG	2	10	534624	534633	40 %	20 %	40 %	0 %	51473626
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14561	NC_006142	A	7	7	534673	534679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_006142	ATT	2	6	534688	534693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_006142	TGT	2	6	534722	534727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_006142	CTT	2	6	534771	534776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_006142	AAT	3	9	534800	534808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473627
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14574	NC_006142	CTG	2	6	535372	535377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473627
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14576	NC_006142	AGG	2	6	535477	535482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_006142	TAT	2	6	535486	535491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473628
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14593	NC_006142	ATT	2	6	536247	536252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473628
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14600	NC_006142	TGG	2	6	536446	536451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473628
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14604	NC_006142	T	6	6	536645	536650	0 %	100 %	0 %	0 %	51473628
14605	NC_006142	T	7	7	536684	536690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_006142	ATA	2	6	536704	536709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_006142	TTA	2	6	536713	536718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_006142	CGTGA	2	10	536719	536728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14609	NC_006142	A	6	6	536745	536750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_006142	TATT	2	8	536763	536770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_006142	GGTCA	2	10	536777	536786	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14612	NC_006142	TAA	2	6	536792	536797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_006142	TCTT	2	8	536804	536811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14614	NC_006142	AAC	2	6	536821	536826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14616	NC_006142	TAA	2	6	536935	536940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_006142	AAT	2	6	536949	536954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_006142	TTG	2	6	536991	536996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_006142	AT	3	6	537000	537005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_006142	TAT	2	6	537008	537013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_006142	TATT	2	8	537024	537031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_006142	AAC	2	6	537078	537083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_006142	ATT	2	6	537114	537119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_006142	AATG	2	8	537122	537129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_006142	TC	3	6	537132	537137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14626	NC_006142	GCT	2	6	537191	537196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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