MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_006142	GTAC	2	8	278832	278839	25 %	25 %	25 %	25 %	51473423
7503	NC_006142	GCT	2	6	278907	278912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473423
7504	NC_006142	AGGGC	2	10	278916	278925	20 %	0 %	60 %	20 %	51473423
7505	NC_006142	GCA	3	9	278928	278936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473423
7506	NC_006142	GCT	2	6	278952	278957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473423
7507	NC_006142	A	6	6	278976	278981	100 %	0 %	0 %	0 %	51473423
7508	NC_006142	TTA	2	6	278989	278994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473423
7509	NC_006142	GCT	2	6	279081	279086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473423
7510	NC_006142	ATT	2	6	279164	279169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473423
7511	NC_006142	AAGT	2	8	279175	279182	50 %	25 %	25 %	0 %	51473423
7512	NC_006142	GCT	2	6	279188	279193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473423
7513	NC_006142	TAC	3	9	279257	279265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473423
7514	NC_006142	AGG	2	6	279296	279301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473423
7515	NC_006142	GTT	2	6	279393	279398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473423
7516	NC_006142	TGC	2	6	279440	279445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473423
7517	NC_006142	ATT	2	6	279617	279622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473423
7518	NC_006142	GAA	2	6	279678	279683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473423
7519	NC_006142	AGA	2	6	279765	279770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473424
7520	NC_006142	AAT	2	6	279792	279797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473424
7521	NC_006142	AT	3	6	279845	279850	50 %	50 %	0 %	0 %	51473424
7522	NC_006142	GAA	3	9	279880	279888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473424
7523	NC_006142	ATA	2	6	279971	279976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473424
7524	NC_006142	GAA	2	6	280000	280005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473424
7525	NC_006142	TAG	2	6	280079	280084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473424
7526	NC_006142	AG	3	6	280118	280123	50 %	0 %	50 %	0 %	51473424
7527	NC_006142	GTA	2	6	280127	280132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473424
7528	NC_006142	CAT	2	6	280141	280146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_006142	AT	3	6	280154	280159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_006142	AGC	2	6	280177	280182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_006142	AAC	2	6	280195	280200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_006142	ATT	3	9	280254	280262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_006142	TAAA	2	8	280277	280284	75 %	25 %	0 %	0 %	51473425
7534	NC_006142	ATT	2	6	280296	280301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473425
7535	NC_006142	TAT	2	6	280313	280318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473425
7536	NC_006142	TTG	2	6	280373	280378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473425
7537	NC_006142	T	7	7	280434	280440	0 %	100 %	0 %	0 %	51473425
7538	NC_006142	T	6	6	280456	280461	0 %	100 %	0 %	0 %	51473425
7539	NC_006142	A	7	7	280469	280475	100 %	0 %	0 %	0 %	51473425
7540	NC_006142	AT	3	6	280481	280486	50 %	50 %	0 %	0 %	51473425
7541	NC_006142	GATC	2	8	280539	280546	25 %	25 %	25 %	25 %	51473425
7542	NC_006142	AG	3	6	280549	280554	50 %	0 %	50 %	0 %	51473425
7543	NC_006142	AATGAA	2	12	280558	280569	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51473425
7544	NC_006142	ACA	2	6	280698	280703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473425
7545	NC_006142	CAA	2	6	280769	280774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473425
7546	NC_006142	ATG	2	6	280888	280893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473425
7547	NC_006142	GTA	2	6	280897	280902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473425
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7550	NC_006142	CTA	2	6	280934	280939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473425
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7552	NC_006142	A	7	7	280994	281000	100 %	0 %	0 %	0 %	51473425
7553	NC_006142	ACT	2	6	281026	281031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473425
7554	NC_006142	ACA	2	6	281059	281064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473425
7555	NC_006142	ACT	2	6	281080	281085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473425
7556	NC_006142	CTA	2	6	281102	281107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473425
7557	NC_006142	CTA	2	6	281111	281116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473425
7558	NC_006142	CAT	2	6	281138	281143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473425
7559	NC_006142	ATG	2	6	281149	281154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473425
7560	NC_006142	AAT	2	6	281161	281166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473425
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7564	NC_006142	AATA	2	8	281256	281263	75 %	25 %	0 %	0 %	51473425
7565	NC_006142	AAGA	2	8	281270	281277	75 %	0 %	25 %	0 %	51473425
7566	NC_006142	A	7	7	281301	281307	100 %	0 %	0 %	0 %	51473425
7567	NC_006142	CTTTAG	2	12	281372	281383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51473425
7568	NC_006142	A	7	7	281386	281392	100 %	0 %	0 %	0 %	51473425
7569	NC_006142	AAT	2	6	281413	281418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473425
7570	NC_006142	TTC	2	6	281442	281447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473425
7571	NC_006142	A	6	6	281517	281522	100 %	0 %	0 %	0 %	51473425
7572	NC_006142	TGA	3	9	281547	281555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473425
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7576	NC_006142	AG	3	6	281676	281681	50 %	0 %	50 %	0 %	51473425
7577	NC_006142	TTA	2	6	281684	281689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473425
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7580	NC_006142	ATCT	2	8	281732	281739	25 %	50 %	0 %	25 %	51473425
7581	NC_006142	TAT	2	6	281740	281745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473425
7582	NC_006142	AAC	2	6	281782	281787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473425
7583	NC_006142	CTG	2	6	281864	281869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473425
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7586	NC_006142	TGT	2	6	282100	282105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_006142	AAT	2	6	282127	282132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_006142	TAA	2	6	282135	282140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_006142	TAGTT	2	10	282175	282184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_006142	TTAA	3	12	282193	282204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_006142	AT	3	6	282211	282216	50 %	50 %	0 %	0 %	51473426
7592	NC_006142	TAA	3	9	282235	282243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473426
7593	NC_006142	AGAAA	2	10	282244	282253	80 %	0 %	20 %	0 %	51473426
7594	NC_006142	GTAT	2	8	282333	282340	25 %	50 %	25 %	0 %	51473426
7595	NC_006142	CAT	2	6	282368	282373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473426
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7597	NC_006142	ATC	2	6	282504	282509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473426
7598	NC_006142	TAA	2	6	282520	282525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473426
7599	NC_006142	ACT	2	6	282548	282553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473426
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7601	NC_006142	GTA	2	6	282564	282569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473426
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7603	NC_006142	GTA	2	6	282626	282631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473426
7604	NC_006142	CAA	2	6	282668	282673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473426
7605	NC_006142	TA	3	6	282681	282686	50 %	50 %	0 %	0 %	51473426
7606	NC_006142	ACATT	2	10	282800	282809	40 %	40 %	0 %	20 %	51473426
7607	NC_006142	TTAT	2	8	282850	282857	25 %	75 %	0 %	0 %	51473426
7608	NC_006142	GTG	2	6	282861	282866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473426
7609	NC_006142	A	6	6	282914	282919	100 %	0 %	0 %	0 %	51473426
7610	NC_006142	TAA	2	6	282924	282929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473426
7611	NC_006142	ATT	2	6	282951	282956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473426
7612	NC_006142	T	6	6	282999	283004	0 %	100 %	0 %	0 %	51473426
7613	NC_006142	TTG	2	6	283054	283059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473426
7614	NC_006142	AAT	2	6	283064	283069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473426
7615	NC_006142	CTC	2	6	283113	283118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473426
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7618	NC_006142	TAA	2	6	283192	283197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473426
7619	NC_006142	A	6	6	283196	283201	100 %	0 %	0 %	0 %	51473426
7620	NC_006142	GTT	2	6	283244	283249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473426
7621	NC_006142	GTAA	2	8	283316	283323	50 %	25 %	25 %	0 %	51473426
7622	NC_006142	TTG	2	6	283326	283331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473426
7623	NC_006142	ATA	2	6	283337	283342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473426
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