MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_006142	GAAG	2	8	241065	241072	50 %	0 %	50 %	0 %	51473398
6502	NC_006142	TCCA	2	8	241085	241092	25 %	25 %	0 %	50 %	51473398
6503	NC_006142	TTC	2	6	241094	241099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473398
6504	NC_006142	AAT	2	6	241106	241111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473398
6505	NC_006142	T	7	7	241184	241190	0 %	100 %	0 %	0 %	51473398
6506	NC_006142	TGT	2	6	241195	241200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473398
6507	NC_006142	TTC	3	9	241205	241213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473398
6508	NC_006142	CAAG	2	8	241236	241243	50 %	0 %	25 %	25 %	51473398
6509	NC_006142	T	6	6	241327	241332	0 %	100 %	0 %	0 %	51473398
6510	NC_006142	CTT	2	6	241333	241338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473398
6511	NC_006142	CAT	2	6	241339	241344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473398
6512	NC_006142	TAA	2	6	241348	241353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473398
6513	NC_006142	TA	3	6	241411	241416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_006142	ATT	2	6	241426	241431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_006142	ATTAAT	2	12	241458	241469	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6516	NC_006142	AT	3	6	241484	241489	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6517	NC_006142	T	6	6	241489	241494	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
6518	NC_006142	TTAA	2	8	241525	241532	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6519	NC_006142	TAT	2	6	241565	241570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6520	NC_006142	ATTA	2	8	241581	241588	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6521	NC_006142	GTT	2	6	241615	241620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473399
6522	NC_006142	TAT	2	6	241626	241631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6523	NC_006142	ATT	2	6	241669	241674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6524	NC_006142	TCT	2	6	241675	241680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473399
6525	NC_006142	TAA	2	6	241683	241688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473399
6526	NC_006142	TAG	2	6	241691	241696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473399
6527	NC_006142	AATCTC	2	12	241737	241748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
6528	NC_006142	AT	3	6	241793	241798	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6529	NC_006142	T	6	6	241805	241810	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
6530	NC_006142	ATA	2	6	241826	241831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473399
6531	NC_006142	GGT	2	6	241888	241893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473399
6532	NC_006142	AT	3	6	241958	241963	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6533	NC_006142	TTA	2	6	242009	242014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6534	NC_006142	T	6	6	242048	242053	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
6535	NC_006142	TAC	2	6	242094	242099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
6536	NC_006142	ATCA	2	8	242100	242107	50 %	25 %	0 %	25 %	51473399
6537	NC_006142	ATTT	2	8	242199	242206	25 %	75 %	0 %	0 %	51473399
6538	NC_006142	TA	3	6	242216	242221	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
6539	NC_006142	GTC	2	6	242248	242253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473399
6540	NC_006142	CTA	2	6	242258	242263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
6541	NC_006142	GT	3	6	242326	242331	0 %	50 %	50 %	0 %	51473399
6542	NC_006142	GTT	2	6	242351	242356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473399
6543	NC_006142	TTA	2	6	242368	242373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6544	NC_006142	ATA	2	6	242380	242385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473399
6545	NC_006142	ATT	2	6	242388	242393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6546	NC_006142	CT	3	6	242398	242403	0 %	50 %	0 %	50 %	51473399
6547	NC_006142	T	7	7	242427	242433	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
6548	NC_006142	TTA	2	6	242473	242478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6549	NC_006142	TAC	2	6	242496	242501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
6550	NC_006142	TCG	2	6	242509	242514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473399
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6553	NC_006142	ACC	2	6	242595	242600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473399
6554	NC_006142	ATT	2	6	242722	242727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6555	NC_006142	ATT	2	6	242784	242789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6556	NC_006142	T	6	6	242788	242793	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
6557	NC_006142	T	6	6	242812	242817	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
6558	NC_006142	TAAA	2	8	242821	242828	75 %	25 %	0 %	0 %	51473399
6559	NC_006142	CTG	2	6	242834	242839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473399
6560	NC_006142	TTA	2	6	242863	242868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
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6563	NC_006142	TAAC	2	8	242915	242922	50 %	25 %	0 %	25 %	51473399
6564	NC_006142	TAT	2	6	242996	243001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6565	NC_006142	TAT	2	6	243006	243011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
6566	NC_006142	TAG	2	6	243035	243040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473399
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6568	NC_006142	TAG	2	6	243092	243097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473399
6569	NC_006142	TAG	2	6	243116	243121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473399
6570	NC_006142	CTG	2	6	243156	243161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473399
6571	NC_006142	TAT	2	6	243192	243197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
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6573	NC_006142	T	6	6	243211	243216	0 %	100 %	0 %	0 %	51473400
6574	NC_006142	AT	3	6	243243	243248	50 %	50 %	0 %	0 %	51473400
6575	NC_006142	TG	3	6	243260	243265	0 %	50 %	50 %	0 %	51473400
6576	NC_006142	TGT	2	6	243324	243329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473400
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6578	NC_006142	TAAA	2	8	243370	243377	75 %	25 %	0 %	0 %	51473400
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6582	NC_006142	TTTA	2	8	243530	243537	25 %	75 %	0 %	0 %	51473400
6583	NC_006142	AAT	2	6	243548	243553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473400
6584	NC_006142	GAT	2	6	243595	243600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473400
6585	NC_006142	TAA	2	6	243671	243676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473400
6586	NC_006142	AAT	2	6	243682	243687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473400
6587	NC_006142	TAT	2	6	243707	243712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_006142	TTA	2	6	243721	243726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_006142	TGCAA	2	10	243744	243753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6590	NC_006142	ACT	2	6	243836	243841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_006142	ATT	2	6	243863	243868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_006142	AG	3	6	244071	244076	50 %	0 %	50 %	0 %	51473401
6593	NC_006142	TAT	2	6	244123	244128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473401
6594	NC_006142	TGA	2	6	244144	244149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473401
6595	NC_006142	AT	3	6	244155	244160	50 %	50 %	0 %	0 %	51473401
6596	NC_006142	A	6	6	244172	244177	100 %	0 %	0 %	0 %	51473401
6597	NC_006142	TTA	2	6	244263	244268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473401
6598	NC_006142	TAAT	2	8	244272	244279	50 %	50 %	0 %	0 %	51473401
6599	NC_006142	TGC	2	6	244303	244308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473401
6600	NC_006142	TAT	2	6	244315	244320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473401
6601	NC_006142	ATC	2	6	244444	244449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473401
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6603	NC_006142	ATT	2	6	244683	244688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473402
6604	NC_006142	GTTT	2	8	244702	244709	0 %	75 %	25 %	0 %	51473402
6605	NC_006142	T	6	6	244707	244712	0 %	100 %	0 %	0 %	51473402
6606	NC_006142	TAT	2	6	244721	244726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473402
6607	NC_006142	TTC	2	6	244734	244739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
6608	NC_006142	T	6	6	244794	244799	0 %	100 %	0 %	0 %	51473402
6609	NC_006142	TCT	2	6	244821	244826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
6610	NC_006142	CTA	2	6	244897	244902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473402
6611	NC_006142	TTGT	2	8	244922	244929	0 %	75 %	25 %	0 %	51473402
6612	NC_006142	CT	3	6	245013	245018	0 %	50 %	0 %	50 %	51473402
6613	NC_006142	CTA	2	6	245033	245038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473402
6614	NC_006142	GTAT	2	8	245092	245099	25 %	50 %	25 %	0 %	51473402
6615	NC_006142	ATA	2	6	245112	245117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473402
6616	NC_006142	T	8	8	245165	245172	0 %	100 %	0 %	0 %	51473402
6617	NC_006142	GTT	2	6	245212	245217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473402
6618	NC_006142	TAG	2	6	245249	245254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473402
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6620	NC_006142	CTA	2	6	245309	245314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473402
6621	NC_006142	TCT	2	6	245329	245334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
6622	NC_006142	TTC	2	6	245394	245399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
6623	NC_006142	CTT	2	6	245459	245464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
6624	NC_006142	TCA	2	6	245521	245526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473402
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