MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_005296	CGG	2	6	1192725	1192730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934159
31003	NC_005296	GCA	2	6	1192809	1192814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934159
31004	NC_005296	GC	3	6	1192832	1192837	0 %	0 %	50 %	50 %	39934159
31005	NC_005296	TGC	2	6	1192991	1192996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934159
31006	NC_005296	ACA	2	6	1192997	1193002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39934159
31007	NC_005296	ACA	3	9	1193015	1193023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39934159
31008	NC_005296	CAG	2	6	1193061	1193066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934159
31009	NC_005296	GCA	2	6	1193078	1193083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934159
31010	NC_005296	CAA	2	6	1193112	1193117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39934159
31011	NC_005296	CGC	2	6	1193174	1193179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934160
31012	NC_005296	CGG	2	6	1193252	1193257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934160
31013	NC_005296	GCA	2	6	1193285	1193290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934160
31014	NC_005296	CG	3	6	1193316	1193321	0 %	0 %	50 %	50 %	39934160
31015	NC_005296	CCA	2	6	1193326	1193331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934160
31016	NC_005296	GCA	2	6	1193339	1193344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934160
31017	NC_005296	CAG	2	6	1193370	1193375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934160
31018	NC_005296	CTCG	2	8	1193396	1193403	0 %	25 %	25 %	50 %	39934160
31019	NC_005296	CAG	2	6	1193442	1193447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934160
31020	NC_005296	ACG	2	6	1193521	1193526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934160
31021	NC_005296	TG	3	6	1193604	1193609	0 %	50 %	50 %	0 %	39934161
31022	NC_005296	GATC	2	8	1193638	1193645	25 %	25 %	25 %	25 %	39934161
31023	NC_005296	CGC	2	6	1193654	1193659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934161
31024	NC_005296	GGC	2	6	1193663	1193668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934161
31025	NC_005296	GCT	2	6	1193680	1193685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934161
31026	NC_005296	TTC	2	6	1193709	1193714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39934161
31027	NC_005296	GAG	2	6	1193715	1193720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39934161
31028	NC_005296	CCG	2	6	1193721	1193726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934161
31029	NC_005296	GTG	2	6	1193727	1193732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934161
31030	NC_005296	CGC	2	6	1193734	1193739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934161
31031	NC_005296	GCC	3	9	1193771	1193779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934161
31032	NC_005296	AGA	2	6	1193785	1193790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39934161
31033	NC_005296	CG	3	6	1193863	1193868	0 %	0 %	50 %	50 %	39934161
31034	NC_005296	GCG	2	6	1193881	1193886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934161
31035	NC_005296	CGAT	2	8	1193896	1193903	25 %	25 %	25 %	25 %	39934161
31036	NC_005296	GGT	2	6	1193919	1193924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934161
31037	NC_005296	CGT	2	6	1193939	1193944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934161
31038	NC_005296	CTG	2	6	1193967	1193972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934161
31039	NC_005296	GCC	2	6	1194035	1194040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934161
31040	NC_005296	TCG	2	6	1194076	1194081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934161
31041	NC_005296	CGG	2	6	1194104	1194109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934161
31042	NC_005296	CCG	2	6	1194152	1194157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934161
31043	NC_005296	CAC	3	9	1194221	1194229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934161
31044	NC_005296	GCT	2	6	1194290	1194295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934161
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31048	NC_005296	GATC	2	8	1194527	1194534	25 %	25 %	25 %	25 %	39934161
31049	NC_005296	GGC	2	6	1194568	1194573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934162
31050	NC_005296	GC	5	10	1194572	1194581	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31051	NC_005296	CTGG	2	8	1194589	1194596	0 %	25 %	50 %	25 %	39934162
31052	NC_005296	TGC	2	6	1194610	1194615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934162
31053	NC_005296	CGGC	2	8	1194621	1194628	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31054	NC_005296	GCG	2	6	1194636	1194641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934162
31055	NC_005296	GCA	2	6	1194652	1194657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934162
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31057	NC_005296	TGG	2	6	1194681	1194686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934162
31058	NC_005296	CG	4	8	1194691	1194698	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31059	NC_005296	CGC	2	6	1194724	1194729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934162
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31061	NC_005296	GCT	2	6	1194805	1194810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934162
31062	NC_005296	GCC	2	6	1194890	1194895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934162
31063	NC_005296	GC	3	6	1194896	1194901	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31064	NC_005296	CGA	2	6	1194907	1194912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934162
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31066	NC_005296	GC	3	6	1194947	1194952	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31067	NC_005296	GCC	2	6	1194969	1194974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934162
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31070	NC_005296	GCCG	2	8	1195060	1195067	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31071	NC_005296	TGC	2	6	1195083	1195088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934162
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31074	NC_005296	CGC	2	6	1195192	1195197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934162
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31077	NC_005296	CG	3	6	1195268	1195273	0 %	0 %	50 %	50 %	39934162
31078	NC_005296	GAA	2	6	1195279	1195284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39934162
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31082	NC_005296	TGC	2	6	1195433	1195438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934163
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31085	NC_005296	GGC	2	6	1195492	1195497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934163
31086	NC_005296	CG	3	6	1195584	1195589	0 %	0 %	50 %	50 %	39934163
31087	NC_005296	CTGCGC	2	12	1195605	1195616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39934163
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31089	NC_005296	AGC	2	6	1195627	1195632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934163
31090	NC_005296	ACG	2	6	1195633	1195638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934163
31091	NC_005296	ACC	2	6	1195699	1195704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934163
31092	NC_005296	CCT	2	6	1195793	1195798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31093	NC_005296	CCA	2	6	1195830	1195835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31094	NC_005296	CAT	2	6	1195852	1195857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31096	NC_005296	CATTGA	2	12	1195906	1195917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31097	NC_005296	AGG	2	6	1195927	1195932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31098	NC_005296	TC	3	6	1195963	1195968	0 %	50 %	0 %	50 %	39934164
31099	NC_005296	ATG	2	6	1195975	1195980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934164
31100	NC_005296	TCGGCA	2	12	1195997	1196008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39934164
31101	NC_005296	CATGG	2	10	1196049	1196058	20 %	20 %	40 %	20 %	39934164
31102	NC_005296	TGG	3	9	1196069	1196077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934164
31103	NC_005296	TGC	2	6	1196091	1196096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934164
31104	NC_005296	GCGCC	2	10	1196116	1196125	0 %	0 %	40 %	60 %	39934164
31105	NC_005296	GC	3	6	1196127	1196132	0 %	0 %	50 %	50 %	39934164
31106	NC_005296	CGACCG	2	12	1196177	1196188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39934164
31107	NC_005296	GTC	2	6	1196239	1196244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31108	NC_005296	TGCG	2	8	1196247	1196254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31109	NC_005296	CGG	2	6	1196255	1196260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31110	NC_005296	CGC	3	9	1196263	1196271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31111	NC_005296	GATCAA	2	12	1196280	1196291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31112	NC_005296	GCG	2	6	1196301	1196306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31113	NC_005296	TGG	2	6	1196345	1196350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934165
31114	NC_005296	CTG	2	6	1196360	1196365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934165
31115	NC_005296	GGCG	2	8	1196427	1196434	0 %	0 %	75 %	25 %	39934165
31116	NC_005296	GT	3	6	1196528	1196533	0 %	50 %	50 %	0 %	39934165
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31118	NC_005296	GCA	2	6	1196585	1196590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934165
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31236	NC_005296	AGC	2	6	1201390	1201395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934170
31237	NC_005296	GCC	2	6	1201428	1201433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934171
31238	NC_005296	CGCACC	2	12	1201447	1201458	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	39934171
31239	NC_005296	CAT	2	6	1201476	1201481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934171
31240	NC_005296	GCC	3	9	1201491	1201499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934171
31241	NC_005296	CCGG	2	8	1201558	1201565	0 %	0 %	50 %	50 %	39934171
31242	NC_005296	CGG	2	6	1201579	1201584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934171
31243	NC_005296	TTG	2	6	1201645	1201650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39934171
31244	NC_005296	ATC	2	6	1201678	1201683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934171
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31247	NC_005296	TGCG	2	8	1201765	1201772	0 %	25 %	50 %	25 %	39934171
31248	NC_005296	TCG	2	6	1201813	1201818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934171
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31250	NC_005296	CG	3	6	1201896	1201901	0 %	0 %	50 %	50 %	39934171
31251	NC_005296	TCG	2	6	1201921	1201926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934171
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31255	NC_005296	GTC	2	6	1202074	1202079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934171
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31258	NC_005296	CGT	2	6	1202203	1202208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934171
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31262	NC_005296	CCGA	2	8	1202359	1202366	25 %	0 %	25 %	50 %	39934171
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31288	NC_005296	AGA	2	6	1203174	1203179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31289	NC_005296	GCT	2	6	1203183	1203188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31290	NC_005296	TTTC	2	8	1203223	1203230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31312	NC_005296	TGT	2	6	1204159	1204164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39934173
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31323	NC_005296	ACG	2	6	1204573	1204578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31332	NC_005296	CTG	2	6	1204964	1204969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934174
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31338	NC_005296	TCGCCA	2	12	1205106	1205117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	39934174
31339	NC_005296	CAC	2	6	1205129	1205134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934174
31340	NC_005296	ATG	3	9	1205170	1205178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934174
31341	NC_005296	GC	3	6	1205207	1205212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31342	NC_005296	ACCCCC	2	12	1205273	1205284	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31343	NC_005296	CAT	2	6	1205378	1205383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934175
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31345	NC_005296	TCGA	2	8	1205499	1205506	25 %	25 %	25 %	25 %	39934175
31346	NC_005296	GCT	2	6	1205576	1205581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934175
31347	NC_005296	GCC	2	6	1205636	1205641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934175
31348	NC_005296	GGC	2	6	1205678	1205683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934175
31349	NC_005296	GC	3	6	1205688	1205693	0 %	0 %	50 %	50 %	39934175
31350	NC_005296	CGG	2	6	1205776	1205781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934175
31351	NC_005296	CGA	2	6	1205804	1205809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934175
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31353	NC_005296	GGC	3	9	1205879	1205887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934175
31354	NC_005296	CG	3	6	1205993	1205998	0 %	0 %	50 %	50 %	39934176
31355	NC_005296	CGC	2	6	1206007	1206012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934176
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