MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_005296	CGA	2	6	1154024	1154029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
30003	NC_005296	GCG	2	6	1154050	1154055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934124
30004	NC_005296	TGA	3	9	1154114	1154122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934124
30005	NC_005296	GCC	2	6	1154176	1154181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934124
30006	NC_005296	GC	4	8	1154185	1154192	0 %	0 %	50 %	50 %	39934124
30007	NC_005296	CAC	2	6	1154217	1154222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934124
30008	NC_005296	ATG	2	6	1154239	1154244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934124
30009	NC_005296	CGG	2	6	1154297	1154302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934124
30010	NC_005296	GAC	2	6	1154316	1154321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
30011	NC_005296	GGT	2	6	1154322	1154327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934124
30012	NC_005296	GCCC	2	8	1154345	1154352	0 %	0 %	25 %	75 %	39934124
30013	NC_005296	GGCC	2	8	1154354	1154361	0 %	0 %	50 %	50 %	39934124
30014	NC_005296	GGC	2	6	1154376	1154381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934124
30015	NC_005296	GCCA	2	8	1154443	1154450	25 %	0 %	25 %	50 %	39934124
30016	NC_005296	CGGC	2	8	1154492	1154499	0 %	0 %	50 %	50 %	39934124
30017	NC_005296	AGC	2	6	1154500	1154505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
30018	NC_005296	ACACC	2	10	1154510	1154519	40 %	0 %	0 %	60 %	39934124
30019	NC_005296	GGT	2	6	1154544	1154549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934124
30020	NC_005296	CG	3	6	1154555	1154560	0 %	0 %	50 %	50 %	39934124
30021	NC_005296	CAG	2	6	1154604	1154609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
30022	NC_005296	CAGCGC	2	12	1154652	1154663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39934124
30023	NC_005296	AGC	3	9	1154695	1154703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
30024	NC_005296	ACG	2	6	1154704	1154709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
30025	NC_005296	GTC	2	6	1154733	1154738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934124
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30029	NC_005296	GGGTC	2	10	1154819	1154828	0 %	20 %	60 %	20 %	39934124
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30031	NC_005296	GA	3	6	1154853	1154858	50 %	0 %	50 %	0 %	39934124
30032	NC_005296	CGC	2	6	1154879	1154884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934124
30033	NC_005296	GCT	2	6	1154903	1154908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934124
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30035	NC_005296	GAAA	2	8	1154936	1154943	75 %	0 %	25 %	0 %	39934124
30036	NC_005296	CAG	2	6	1154946	1154951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934124
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30038	NC_005296	ACGG	2	8	1154974	1154981	25 %	0 %	50 %	25 %	39934124
30039	NC_005296	ATC	2	6	1154989	1154994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934124
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30041	NC_005296	GAA	2	6	1155035	1155040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39934124
30042	NC_005296	GAGCC	2	10	1155060	1155069	20 %	0 %	40 %	40 %	39934124
30043	NC_005296	GAGG	2	8	1155121	1155128	25 %	0 %	75 %	0 %	39934124
30044	NC_005296	CGG	2	6	1155151	1155156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934124
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30047	NC_005296	CCG	2	6	1155296	1155301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30048	NC_005296	GCG	2	6	1155373	1155378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30049	NC_005296	TCA	2	6	1155379	1155384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30050	NC_005296	GCC	2	6	1155385	1155390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30051	NC_005296	CAC	2	6	1155481	1155486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934125
30052	NC_005296	TCG	2	6	1155504	1155509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934125
30053	NC_005296	GCT	2	6	1155511	1155516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934125
30054	NC_005296	CTG	2	6	1155548	1155553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934125
30055	NC_005296	ATCT	2	8	1155569	1155576	25 %	50 %	0 %	25 %	39934125
30056	NC_005296	TGCGT	2	10	1155604	1155613	0 %	40 %	40 %	20 %	39934125
30057	NC_005296	GCTT	2	8	1155647	1155654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30058	NC_005296	GAA	3	9	1155737	1155745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30059	NC_005296	GC	3	6	1155807	1155812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30060	NC_005296	CCG	2	6	1155831	1155836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30062	NC_005296	GCCG	2	8	1155863	1155870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30063	NC_005296	CGC	2	6	1155890	1155895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30119	NC_005296	GCG	2	6	1158598	1158603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934126
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30339	NC_005296	TTG	2	6	1167308	1167313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30340	NC_005296	ATT	2	6	1167324	1167329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30342	NC_005296	TGATC	2	10	1167424	1167433	20 %	40 %	20 %	20 %	39934133
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30471	NC_005296	CGG	2	6	1172741	1172746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934137
30472	NC_005296	GCCA	2	8	1172762	1172769	25 %	0 %	25 %	50 %	39934137
30473	NC_005296	CAG	2	6	1172800	1172805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934137
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30477	NC_005296	CAGCGC	2	12	1172959	1172970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39934137
30478	NC_005296	AGCC	2	8	1172978	1172985	25 %	0 %	25 %	50 %	39934137
30479	NC_005296	CAGCGC	3	18	1173004	1173021	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39934137
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30481	NC_005296	GC	3	6	1173172	1173177	0 %	0 %	50 %	50 %	39934137
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30483	NC_005296	GCG	2	6	1173201	1173206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934137
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30491	NC_005296	GC	3	6	1173476	1173481	0 %	0 %	50 %	50 %	39934137
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30499	NC_005296	ACC	2	6	1173656	1173661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934137
30500	NC_005296	AGC	2	6	1173662	1173667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934137

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