MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_005296	AT	3	6	1117558	1117563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29002	NC_005296	AGG	2	6	1117569	1117574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29003	NC_005296	ACA	2	6	1117593	1117598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39934090
29004	NC_005296	CGA	2	6	1117604	1117609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934090
29005	NC_005296	GCC	2	6	1117641	1117646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934090
29006	NC_005296	GCG	3	9	1117671	1117679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934090
29007	NC_005296	GAT	2	6	1117681	1117686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934090
29008	NC_005296	GC	3	6	1117687	1117692	0 %	0 %	50 %	50 %	39934090
29009	NC_005296	GAT	2	6	1117780	1117785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934090
29010	NC_005296	GAG	2	6	1117787	1117792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39934090
29011	NC_005296	CCG	2	6	1117797	1117802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934090
29012	NC_005296	GTG	2	6	1117826	1117831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934090
29013	NC_005296	CCTT	2	8	1117845	1117852	0 %	50 %	0 %	50 %	39934090
29014	NC_005296	AAG	2	6	1117892	1117897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39934090
29015	NC_005296	CGA	2	6	1117912	1117917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934090
29016	NC_005296	GCC	2	6	1117934	1117939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934090
29017	NC_005296	CG	3	6	1117943	1117948	0 %	0 %	50 %	50 %	39934090
29018	NC_005296	CGC	2	6	1117975	1117980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934090
29019	NC_005296	GAT	2	6	1117990	1117995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934090
29020	NC_005296	CCG	2	6	1118039	1118044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934090
29021	NC_005296	CTG	2	6	1118045	1118050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934090
29022	NC_005296	GCG	2	6	1118054	1118059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934090
29023	NC_005296	TTG	2	6	1118124	1118129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39934090
29024	NC_005296	CTCG	2	8	1118135	1118142	0 %	25 %	25 %	50 %	39934090
29025	NC_005296	CGC	2	6	1118143	1118148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934090
29026	NC_005296	GCG	2	6	1118173	1118178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29027	NC_005296	CAT	2	6	1118186	1118191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29028	NC_005296	GAC	2	6	1118194	1118199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29029	NC_005296	CGGCA	2	10	1118216	1118225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29030	NC_005296	GAC	2	6	1118252	1118257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29031	NC_005296	AAC	2	6	1118278	1118283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39934091
29032	NC_005296	GCC	2	6	1118287	1118292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934091
29033	NC_005296	CGGC	2	8	1118395	1118402	0 %	0 %	50 %	50 %	39934091
29034	NC_005296	TCA	2	6	1118479	1118484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934091
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29036	NC_005296	TGG	2	6	1118593	1118598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934091
29037	NC_005296	CACC	2	8	1118612	1118619	25 %	0 %	0 %	75 %	39934091
29038	NC_005296	CCGA	2	8	1118631	1118638	25 %	0 %	25 %	50 %	39934091
29039	NC_005296	ACG	2	6	1118653	1118658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934091
29040	NC_005296	CCG	2	6	1118695	1118700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934091
29041	NC_005296	GCG	2	6	1118795	1118800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29042	NC_005296	AGC	2	6	1118852	1118857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29043	NC_005296	ATCG	2	8	1118881	1118888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29044	NC_005296	CG	4	8	1118887	1118894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29045	NC_005296	GC	3	6	1118898	1118903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29046	NC_005296	TGC	2	6	1118970	1118975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29047	NC_005296	GC	3	6	1118974	1118979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29048	NC_005296	AGC	2	6	1118993	1118998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29049	NC_005296	TCC	2	6	1119011	1119016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29050	NC_005296	GCCA	2	8	1119057	1119064	25 %	0 %	25 %	50 %	39934092
29051	NC_005296	CGC	2	6	1119102	1119107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934092
29052	NC_005296	GCG	2	6	1119123	1119128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934092
29053	NC_005296	AGG	2	6	1119145	1119150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39934092
29054	NC_005296	CTCG	2	8	1119264	1119271	0 %	25 %	25 %	50 %	39934092
29055	NC_005296	GC	3	6	1119279	1119284	0 %	0 %	50 %	50 %	39934092
29056	NC_005296	CAC	2	6	1119299	1119304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39934092
29057	NC_005296	TCACGA	2	12	1119371	1119382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	39934092
29058	NC_005296	CGA	3	9	1119380	1119388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934092
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29062	NC_005296	GGC	2	6	1119425	1119430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934092
29063	NC_005296	GGC	2	6	1119445	1119450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29064	NC_005296	GAG	2	6	1119472	1119477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29065	NC_005296	CGA	2	6	1119483	1119488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29066	NC_005296	TTGCT	2	10	1119522	1119531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29067	NC_005296	CT	3	6	1119553	1119558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29068	NC_005296	ATG	2	6	1119588	1119593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29069	NC_005296	CG	3	6	1119606	1119611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29070	NC_005296	GCCG	2	8	1119628	1119635	0 %	0 %	50 %	50 %	39934093
29071	NC_005296	CGC	2	6	1119661	1119666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934093
29072	NC_005296	CAG	3	9	1119721	1119729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934093
29073	NC_005296	CCAG	2	8	1119744	1119751	25 %	0 %	25 %	50 %	39934093
29074	NC_005296	ACG	2	6	1119773	1119778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934093
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29076	NC_005296	CGGCC	2	10	1119838	1119847	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29077	NC_005296	AT	3	6	1119867	1119872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29078	NC_005296	TAA	2	6	1119875	1119880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29079	NC_005296	TA	3	6	1119884	1119889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29080	NC_005296	TGG	2	6	1119919	1119924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934094
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29084	NC_005296	TGG	2	6	1119997	1120002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934094
29085	NC_005296	TCGG	2	8	1120014	1120021	0 %	25 %	50 %	25 %	39934094
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29088	NC_005296	CGGCG	2	10	1120102	1120111	0 %	0 %	60 %	40 %	39934094
29089	NC_005296	TCT	2	6	1120126	1120131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39934094
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29091	NC_005296	GAC	2	6	1120166	1120171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934094
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29101	NC_005296	CGA	2	6	1120482	1120487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934095
29102	NC_005296	CTCG	2	8	1120509	1120516	0 %	25 %	25 %	50 %	39934095
29103	NC_005296	CGA	2	6	1120620	1120625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934095
29104	NC_005296	GC	3	6	1120662	1120667	0 %	0 %	50 %	50 %	39934095
29105	NC_005296	GTG	2	6	1120687	1120692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934095
29106	NC_005296	CAG	3	9	1120693	1120701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934095
29107	NC_005296	AAGG	2	8	1120705	1120712	50 %	0 %	50 %	0 %	39934095
29108	NC_005296	GAC	2	6	1120729	1120734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934095
29109	NC_005296	GAA	2	6	1120746	1120751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39934095
29110	NC_005296	GAT	2	6	1120752	1120757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934095
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29112	NC_005296	GTG	2	6	1120771	1120776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934095
29113	NC_005296	CGATC	2	10	1120785	1120794	20 %	20 %	20 %	40 %	39934095
29114	NC_005296	GCA	3	9	1120806	1120814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934095
29115	NC_005296	GCTGCG	2	12	1120821	1120832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39934095
29116	NC_005296	CGAT	2	8	1120925	1120932	25 %	25 %	25 %	25 %	39934095
29117	NC_005296	CGT	2	6	1120962	1120967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934095
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29119	NC_005296	CGG	2	6	1121034	1121039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934095
29120	NC_005296	TCA	2	6	1121072	1121077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934095
29121	NC_005296	CGGTGC	2	12	1121132	1121143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39934095
29122	NC_005296	GCC	2	6	1121251	1121256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934096
29123	NC_005296	CGC	2	6	1121278	1121283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934096
29124	NC_005296	CTG	2	6	1121298	1121303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934096
29125	NC_005296	CGC	2	6	1121333	1121338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934096
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29127	NC_005296	GC	4	8	1121408	1121415	0 %	0 %	50 %	50 %	39934096
29128	NC_005296	GAC	2	6	1121502	1121507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934096
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29130	NC_005296	CGC	2	6	1121594	1121599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934096
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29133	NC_005296	TGA	2	6	1121752	1121757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934096
29134	NC_005296	GC	3	6	1121797	1121802	0 %	0 %	50 %	50 %	39934096
29135	NC_005296	TCG	2	6	1121866	1121871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934096
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29156	NC_005296	CGGC	2	8	1122812	1122819	0 %	0 %	50 %	50 %	39934096
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29190	NC_005296	GAT	2	6	1124126	1124131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934096
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29193	NC_005296	CGG	2	6	1124201	1124206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934096
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29212	NC_005296	GAC	2	6	1124919	1124924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934097
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29216	NC_005296	TCG	2	6	1125071	1125076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934097
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29219	NC_005296	GCGA	2	8	1125203	1125210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29220	NC_005296	CGG	2	6	1125275	1125280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29221	NC_005296	GTCGCG	2	12	1125331	1125342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29222	NC_005296	GCG	2	6	1125350	1125355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29223	NC_005296	TCGCA	2	10	1125356	1125365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29224	NC_005296	GGC	2	6	1125397	1125402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39934098
29225	NC_005296	TGC	2	6	1125406	1125411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39934098
29226	NC_005296	TGA	2	6	1125414	1125419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39934098
29227	NC_005296	CGCGGC	2	12	1125454	1125465	0 %	0 %	50 %	50 %	39934098
29228	NC_005296	GC	3	6	1125472	1125477	0 %	0 %	50 %	50 %	39934098
29229	NC_005296	CGA	2	6	1125478	1125483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39934098
29230	NC_005296	CGC	2	6	1125513	1125518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39934098
29231	NC_005296	CTGC	2	8	1125567	1125574	0 %	25 %	25 %	50 %	39934098
29232	NC_005296	GC	3	6	1125617	1125622	0 %	0 %	50 %	50 %	39934098
29233	NC_005296	ATC	2	6	1125666	1125671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39934098
29234	NC_005296	CGGG	2	8	1125679	1125686	0 %	0 %	75 %	25 %	39934098
29235	NC_005296	GGT	2	6	1125695	1125700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39934099
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29475	NC_005296	CGG	2	6	1134047	1134052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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