MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

< Previous12...3435363738394041424344...283284Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19123	NC_005296	GGC	2	6	739765	739770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933747
19124	NC_005296	GCA	2	6	739792	739797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933747
19125	NC_005296	GGC	2	6	739855	739860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933747
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19127	NC_005296	GGGC	2	8	740068	740075	0 %	0 %	75 %	25 %	39933748
19128	NC_005296	CCG	2	6	740084	740089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19129	NC_005296	TGC	2	6	740240	740245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
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19131	NC_005296	ACGGC	2	10	740335	740344	20 %	0 %	40 %	40 %	39933748
19132	NC_005296	TAC	2	6	740389	740394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933748
19133	NC_005296	GCC	2	6	740404	740409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19134	NC_005296	GCT	2	6	740427	740432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19135	NC_005296	ACA	2	6	740438	740443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933748
19136	NC_005296	CGAG	2	8	740457	740464	25 %	0 %	50 %	25 %	39933748
19137	NC_005296	GCC	2	6	740506	740511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19138	NC_005296	CAT	2	6	740533	740538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933748
19139	NC_005296	GCCT	2	8	740575	740582	0 %	25 %	25 %	50 %	39933748
19140	NC_005296	GGC	2	6	740606	740611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933748
19141	NC_005296	TAT	2	6	740641	740646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933748
19142	NC_005296	GC	3	6	740662	740667	0 %	0 %	50 %	50 %	39933748
19143	NC_005296	GATC	2	8	740676	740683	25 %	25 %	25 %	25 %	39933748
19144	NC_005296	CGGGTG	2	12	740689	740700	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	39933748
19145	NC_005296	TCG	2	6	740711	740716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
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19147	NC_005296	CGC	2	6	740763	740768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19148	NC_005296	TCA	2	6	740828	740833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933748
19149	NC_005296	GTG	2	6	740917	740922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933748
19150	NC_005296	GCG	3	9	740927	740935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933748
19151	NC_005296	GC	3	6	740975	740980	0 %	0 %	50 %	50 %	39933748
19152	NC_005296	TGC	2	6	740981	740986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19153	NC_005296	CCG	2	6	741005	741010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19154	NC_005296	ACG	2	6	741017	741022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19155	NC_005296	GCG	2	6	741053	741058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933748
19156	NC_005296	GC	3	6	741121	741126	0 %	0 %	50 %	50 %	39933748
19157	NC_005296	GCGCC	2	10	741153	741162	0 %	0 %	40 %	60 %	39933748
19158	NC_005296	CTG	2	6	741166	741171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19159	NC_005296	GC	3	6	741246	741251	0 %	0 %	50 %	50 %	39933748
19160	NC_005296	GCC	2	6	741282	741287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19161	NC_005296	GTG	2	6	741370	741375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933748
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19164	NC_005296	TCG	2	6	741442	741447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19165	NC_005296	TGG	2	6	741452	741457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933748
19166	NC_005296	CCGGGT	2	12	741495	741506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933748
19167	NC_005296	TCG	2	6	741553	741558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
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19169	NC_005296	GCG	2	6	741595	741600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933748
19170	NC_005296	CGG	2	6	741626	741631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933748
19171	NC_005296	CTT	2	6	741684	741689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933748
19172	NC_005296	GGT	2	6	741729	741734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933748
19173	NC_005296	CGA	2	6	741750	741755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19174	NC_005296	CCG	2	6	741790	741795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
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19177	NC_005296	CGA	2	6	741882	741887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933748
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19181	NC_005296	CGA	2	6	742076	742081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933748
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19183	NC_005296	TCG	2	6	742112	742117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19184	NC_005296	AGG	2	6	742151	742156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933748
19185	NC_005296	CCG	2	6	742183	742188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933748
19186	NC_005296	GAT	2	6	742231	742236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933748
19187	NC_005296	GTC	2	6	742258	742263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933748
19188	NC_005296	CGG	3	9	742276	742284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933748
19189	NC_005296	GCGG	2	8	742296	742303	0 %	0 %	75 %	25 %	39933748
19190	NC_005296	CGC	2	6	742379	742384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933749
19191	NC_005296	CTG	2	6	742386	742391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933749
19192	NC_005296	GCT	2	6	742409	742414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933749
19193	NC_005296	CGG	3	9	742415	742423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933749
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19200	NC_005296	GC	3	6	742587	742592	0 %	0 %	50 %	50 %	39933749
19201	NC_005296	CGG	2	6	742658	742663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933749
19202	NC_005296	CTA	2	6	742691	742696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933749
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19204	NC_005296	GC	3	6	742718	742723	0 %	0 %	50 %	50 %	39933749
19205	NC_005296	GAA	2	6	742739	742744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933749
19206	NC_005296	GCT	2	6	742820	742825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933749
19207	NC_005296	TCGCG	2	10	742972	742981	0 %	20 %	40 %	40 %	39933749
19208	NC_005296	GCGCG	2	10	743000	743009	0 %	0 %	60 %	40 %	39933749
19209	NC_005296	TGGCGC	2	12	743038	743049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933749
19210	NC_005296	GCT	2	6	743159	743164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933749
19211	NC_005296	GATC	2	8	743171	743178	25 %	25 %	25 %	25 %	39933749
19212	NC_005296	GAC	2	6	743210	743215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933749
19213	NC_005296	CGT	2	6	743240	743245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933749
19214	NC_005296	GTA	2	6	743303	743308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933749
19215	NC_005296	GATC	2	8	743311	743318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19216	NC_005296	CTGCG	2	10	743360	743369	0 %	20 %	40 %	40 %	39933750
19217	NC_005296	TGC	2	6	743444	743449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933750
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19220	NC_005296	GCGAG	2	10	743564	743573	20 %	0 %	60 %	20 %	39933750
19221	NC_005296	GCT	2	6	743612	743617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933750
19222	NC_005296	GAT	2	6	743633	743638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933750
19223	NC_005296	ATC	2	6	743662	743667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933750
19224	NC_005296	CG	3	6	743725	743730	0 %	0 %	50 %	50 %	39933750
19225	NC_005296	GCC	2	6	743805	743810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933750
19226	NC_005296	CGCC	2	8	743840	743847	0 %	0 %	25 %	75 %	39933750
19227	NC_005296	GCC	2	6	743874	743879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933750
19228	NC_005296	GAC	2	6	743880	743885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933750
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19230	NC_005296	CG	3	6	743930	743935	0 %	0 %	50 %	50 %	39933750
19231	NC_005296	TGA	2	6	744017	744022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933750
19232	NC_005296	CAC	2	6	744032	744037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933750
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19234	NC_005296	TGT	2	6	744175	744180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19235	NC_005296	GCA	2	6	744181	744186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19236	NC_005296	GCT	2	6	744231	744236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19237	NC_005296	GGC	2	6	744259	744264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933751
19238	NC_005296	CCG	2	6	744317	744322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933751
19239	NC_005296	CCGA	2	8	744326	744333	25 %	0 %	25 %	50 %	39933751
19240	NC_005296	CGC	2	6	744349	744354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933751
19241	NC_005296	GCG	2	6	744390	744395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933751
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19243	NC_005296	GTG	2	6	744497	744502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933751
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