MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_005296	CGG	2	6	639622	639627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933653
16502	NC_005296	GGC	2	6	639646	639651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933653
16503	NC_005296	GT	3	6	639756	639761	0 %	50 %	50 %	0 %	39933653
16504	NC_005296	AGA	2	6	639969	639974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_005296	CGG	3	9	639990	639998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_005296	GCG	2	6	640009	640014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_005296	GA	3	6	640034	640039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_005296	GGGGT	2	10	640040	640049	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_005296	GCT	2	6	640076	640081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_005296	ACG	2	6	640098	640103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_005296	CCAT	2	8	640133	640140	25 %	25 %	0 %	50 %	39933654
16512	NC_005296	CGG	2	6	640181	640186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933654
16513	NC_005296	GCG	2	6	640210	640215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933654
16514	NC_005296	CGC	2	6	640237	640242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16515	NC_005296	GCC	3	9	640265	640273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16516	NC_005296	CCG	2	6	640296	640301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16517	NC_005296	TGC	2	6	640315	640320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16518	NC_005296	GCC	2	6	640331	640336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16519	NC_005296	CCG	3	9	640419	640427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16520	NC_005296	CTT	2	6	640433	640438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933654
16521	NC_005296	GTC	2	6	640451	640456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16522	NC_005296	CTGG	2	8	640523	640530	0 %	25 %	50 %	25 %	39933654
16523	NC_005296	GCCG	2	8	640541	640548	0 %	0 %	50 %	50 %	39933654
16524	NC_005296	CAT	2	6	640604	640609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933654
16525	NC_005296	TCA	2	6	640615	640620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933654
16526	NC_005296	CG	4	8	640628	640635	0 %	0 %	50 %	50 %	39933654
16527	NC_005296	ACC	2	6	640641	640646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933654
16528	NC_005296	TCG	2	6	640659	640664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16529	NC_005296	TTG	2	6	640683	640688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933654
16530	NC_005296	CAC	2	6	640712	640717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933654
16531	NC_005296	TTC	2	6	640866	640871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933654
16532	NC_005296	CGAGCC	2	12	640882	640893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933654
16533	NC_005296	GCG	2	6	640996	641001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933654
16534	NC_005296	ATC	2	6	641139	641144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933654
16535	NC_005296	CCA	2	6	641173	641178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933654
16536	NC_005296	GCC	2	6	641214	641219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16537	NC_005296	TCG	2	6	641223	641228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16538	NC_005296	CGAC	2	8	641245	641252	25 %	0 %	25 %	50 %	39933654
16539	NC_005296	GATC	2	8	641263	641270	25 %	25 %	25 %	25 %	39933654
16540	NC_005296	CGA	2	6	641278	641283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16541	NC_005296	GGCCTG	2	12	641402	641413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933654
16542	NC_005296	GC	3	6	641463	641468	0 %	0 %	50 %	50 %	39933654
16543	NC_005296	CGC	2	6	641537	641542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16544	NC_005296	CCT	2	6	641698	641703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933654
16545	NC_005296	GCT	2	6	641755	641760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16546	NC_005296	GCC	2	6	641774	641779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16547	NC_005296	GCA	2	6	641797	641802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16548	NC_005296	CGCGG	2	10	641813	641822	0 %	0 %	60 %	40 %	39933654
16549	NC_005296	CCG	2	6	641861	641866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16550	NC_005296	CGG	2	6	641900	641905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933654
16551	NC_005296	CGC	2	6	641941	641946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933654
16552	NC_005296	CGT	2	6	641965	641970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933654
16553	NC_005296	CGG	2	6	641990	641995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933654
16554	NC_005296	CGG	2	6	642023	642028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933654
16555	NC_005296	GC	3	6	642034	642039	0 %	0 %	50 %	50 %	39933654
16556	NC_005296	ACC	2	6	642060	642065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16557	NC_005296	GCTTGC	2	12	642154	642165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16558	NC_005296	GC	3	6	642167	642172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16559	NC_005296	CCG	3	9	642174	642182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16560	NC_005296	TCT	2	6	642199	642204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_005296	GTC	2	6	642212	642217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16562	NC_005296	GCG	2	6	642238	642243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_005296	GCGA	2	8	642258	642265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16564	NC_005296	T	6	6	642305	642310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_005296	CATCG	2	10	642323	642332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16566	NC_005296	CGAT	2	8	642466	642473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16567	NC_005296	GCG	2	6	642474	642479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16568	NC_005296	ATG	2	6	642505	642510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933655
16569	NC_005296	GGA	2	6	642531	642536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933655
16570	NC_005296	CTG	3	9	642547	642555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933655
16571	NC_005296	GATCCG	2	12	642597	642608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933655
16572	NC_005296	CGA	2	6	642624	642629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933655
16573	NC_005296	AGCC	2	8	642675	642682	25 %	0 %	25 %	50 %	39933655
16574	NC_005296	TGA	2	6	642704	642709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933655
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16576	NC_005296	GCG	2	6	642867	642872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933656
16577	NC_005296	CAGC	2	8	642900	642907	25 %	0 %	25 %	50 %	39933656
16578	NC_005296	AGC	2	6	642949	642954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933656
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16581	NC_005296	GCCG	2	8	642969	642976	0 %	0 %	50 %	50 %	39933656
16582	NC_005296	GCC	2	6	642985	642990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933656
16583	NC_005296	CTC	2	6	643014	643019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933656
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16586	NC_005296	CTGT	2	8	643152	643159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16587	NC_005296	GAGC	2	8	643250	643257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16588	NC_005296	CGGTTG	2	12	643267	643278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16589	NC_005296	GCG	2	6	643352	643357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16590	NC_005296	CGC	2	6	643365	643370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933657
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16593	NC_005296	GCT	2	6	643433	643438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16594	NC_005296	AGTC	2	8	643451	643458	25 %	25 %	25 %	25 %	39933657
16595	NC_005296	CGA	2	6	643499	643504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16596	NC_005296	TTC	2	6	643507	643512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933657
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16598	NC_005296	CAG	2	6	643581	643586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933657
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16600	NC_005296	TCG	2	6	643681	643686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16601	NC_005296	TGA	2	6	643730	643735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933657
16602	NC_005296	GGCC	2	8	643754	643761	0 %	0 %	50 %	50 %	39933657
16603	NC_005296	CTT	2	6	643836	643841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933657
16604	NC_005296	GCG	2	6	643852	643857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933657
16605	NC_005296	CAG	2	6	643881	643886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16606	NC_005296	CGG	2	6	643895	643900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933657
16607	NC_005296	GGTCG	2	10	643929	643938	0 %	20 %	60 %	20 %	39933657
16608	NC_005296	AGG	2	6	643949	643954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933657
16609	NC_005296	CGA	2	6	643961	643966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16610	NC_005296	GCGCG	2	10	643991	644000	0 %	0 %	60 %	40 %	39933657
16611	NC_005296	GTC	2	6	644028	644033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16612	NC_005296	TGC	2	6	644071	644076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933657
16613	NC_005296	CAG	2	6	644184	644189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933657
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16867	NC_005296	ACGAT	2	10	653252	653261	40 %	20 %	20 %	20 %	39933664
16868	NC_005296	GCCG	2	8	653265	653272	0 %	0 %	50 %	50 %	39933664
16869	NC_005296	CCAG	2	8	653279	653286	25 %	0 %	25 %	50 %	39933664
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