MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_005296	TGG	2	6	620109	620114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933635
16002	NC_005296	CGG	2	6	620128	620133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933635
16003	NC_005296	CGCT	2	8	620141	620148	0 %	25 %	25 %	50 %	39933635
16004	NC_005296	CGCC	2	8	620175	620182	0 %	0 %	25 %	75 %	39933635
16005	NC_005296	GGC	2	6	620194	620199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933635
16006	NC_005296	TTCC	2	8	620203	620210	0 %	50 %	0 %	50 %	39933635
16007	NC_005296	GGT	2	6	620260	620265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933635
16008	NC_005296	CGGC	2	8	620285	620292	0 %	0 %	50 %	50 %	39933635
16009	NC_005296	CG	3	6	620299	620304	0 %	0 %	50 %	50 %	39933635
16010	NC_005296	GAT	2	6	620332	620337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933635
16011	NC_005296	TCG	2	6	620339	620344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933635
16012	NC_005296	CAC	2	6	620371	620376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933635
16013	NC_005296	GCC	2	6	620377	620382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933635
16014	NC_005296	CAC	2	6	620452	620457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933635
16015	NC_005296	CGGT	2	8	620474	620481	0 %	25 %	50 %	25 %	39933635
16016	NC_005296	AGC	3	9	620489	620497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933635
16017	NC_005296	GTC	3	9	620500	620508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933635
16018	NC_005296	GGC	2	6	620603	620608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_005296	CGGC	2	8	620617	620624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_005296	GCG	2	6	620694	620699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933636
16021	NC_005296	GACGA	2	10	620751	620760	40 %	0 %	40 %	20 %	39933636
16022	NC_005296	CCA	2	6	620765	620770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933636
16023	NC_005296	CGC	2	6	620797	620802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933636
16024	NC_005296	CAT	2	6	620810	620815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933636
16025	NC_005296	CAG	2	6	620867	620872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933636
16026	NC_005296	CG	3	6	620930	620935	0 %	0 %	50 %	50 %	39933636
16027	NC_005296	CTC	2	6	620936	620941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933636
16028	NC_005296	CGC	2	6	621095	621100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933636
16029	NC_005296	CGG	2	6	621133	621138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933636
16030	NC_005296	ACGCT	2	10	621186	621195	20 %	20 %	20 %	40 %	39933636
16031	NC_005296	TCA	2	6	621241	621246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933636
16032	NC_005296	ATGCGG	2	12	621344	621355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	39933636
16033	NC_005296	GAA	2	6	621407	621412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933636
16034	NC_005296	CG	3	6	621484	621489	0 %	0 %	50 %	50 %	39933636
16035	NC_005296	GAT	2	6	621500	621505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933636
16036	NC_005296	GGT	2	6	621524	621529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933636
16037	NC_005296	TGG	2	6	621553	621558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933636
16038	NC_005296	AGC	2	6	621604	621609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_005296	GCG	2	6	621613	621618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_005296	CGC	2	6	621660	621665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16041	NC_005296	TCA	2	6	621688	621693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_005296	GTC	2	6	621697	621702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16043	NC_005296	GGC	3	9	621803	621811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933637
16044	NC_005296	CG	3	6	621948	621953	0 %	0 %	50 %	50 %	39933637
16045	NC_005296	CGGC	2	8	621989	621996	0 %	0 %	50 %	50 %	39933637
16046	NC_005296	GCG	3	9	622026	622034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933637
16047	NC_005296	GCA	2	6	622039	622044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16048	NC_005296	CGG	2	6	622063	622068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933637
16049	NC_005296	TCG	2	6	622077	622082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16050	NC_005296	GC	3	6	622118	622123	0 %	0 %	50 %	50 %	39933637
16051	NC_005296	AGC	2	6	622134	622139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16052	NC_005296	TCC	2	6	622242	622247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933637
16053	NC_005296	ACC	2	6	622248	622253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933637
16054	NC_005296	CTG	2	6	622295	622300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16055	NC_005296	GGC	2	6	622343	622348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933637
16056	NC_005296	AGC	2	6	622371	622376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16057	NC_005296	CGA	2	6	622417	622422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16058	NC_005296	TCG	2	6	622434	622439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933637
16059	NC_005296	GAA	2	6	622454	622459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933637
16060	NC_005296	CGG	2	6	622478	622483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933637
16061	NC_005296	CG	4	8	622491	622498	0 %	0 %	50 %	50 %	39933637
16062	NC_005296	GT	3	6	622521	622526	0 %	50 %	50 %	0 %	39933637
16063	NC_005296	GAT	2	6	622541	622546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933637
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16065	NC_005296	GCA	2	6	622588	622593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933637
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16070	NC_005296	CGG	2	6	622768	622773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933637
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16072	NC_005296	TCG	2	6	622902	622907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933637
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16080	NC_005296	GCA	2	6	623338	623343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933638
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16088	NC_005296	CG	4	8	623594	623601	0 %	0 %	50 %	50 %	39933638
16089	NC_005296	CGT	2	6	623608	623613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933638
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16099	NC_005296	TGTTC	2	10	623875	623884	0 %	60 %	20 %	20 %	39933638
16100	NC_005296	CCG	2	6	623913	623918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16101	NC_005296	CAGCA	2	10	624029	624038	40 %	0 %	20 %	40 %	39933639
16102	NC_005296	CGGA	2	8	624136	624143	25 %	0 %	50 %	25 %	39933639
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16105	NC_005296	CAC	2	6	624236	624241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933639
16106	NC_005296	GTC	2	6	624293	624298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933639
16107	NC_005296	GAA	2	6	624338	624343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933639
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16109	NC_005296	CG	3	6	624439	624444	0 %	0 %	50 %	50 %	39933639
16110	NC_005296	GCGT	2	8	624504	624511	0 %	25 %	50 %	25 %	39933639
16111	NC_005296	GCG	2	6	624595	624600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933639
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16113	NC_005296	TTC	2	6	624666	624671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933639
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16117	NC_005296	GCG	3	9	624840	624848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933639
16118	NC_005296	CGG	2	6	624859	624864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933639
16119	NC_005296	GGTCG	2	10	624899	624908	0 %	20 %	60 %	20 %	39933639
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16121	NC_005296	CGA	2	6	624946	624951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933639
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