MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_005296	AGGT	2	8	600835	600842	25 %	25 %	50 %	0 %	39933615
15502	NC_005296	CGAAC	2	10	601014	601023	40 %	0 %	20 %	40 %	39933615
15503	NC_005296	CAC	2	6	601064	601069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933615
15504	NC_005296	TGCCGG	2	12	601097	601108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933615
15505	NC_005296	GTT	2	6	601113	601118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933615
15506	NC_005296	GGTA	2	8	601166	601173	25 %	25 %	50 %	0 %	39933615
15507	NC_005296	GTT	2	6	601185	601190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933615
15508	NC_005296	CGC	2	6	601220	601225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933615
15509	NC_005296	GTA	2	6	601377	601382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933615
15510	NC_005296	CGA	2	6	601454	601459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933615
15511	NC_005296	ACG	2	6	601550	601555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933615
15512	NC_005296	CGAG	2	8	601565	601572	25 %	0 %	50 %	25 %	39933615
15513	NC_005296	CGT	3	9	601634	601642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933615
15514	NC_005296	CCG	2	6	601645	601650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933615
15515	NC_005296	GTT	2	6	601665	601670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933615
15516	NC_005296	GTA	2	6	601749	601754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933615
15517	NC_005296	GGT	2	6	601791	601796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933615
15518	NC_005296	TTC	2	6	601909	601914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933615
15519	NC_005296	GCC	2	6	601950	601955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933615
15520	NC_005296	GC	3	6	601978	601983	0 %	0 %	50 %	50 %	39933615
15521	NC_005296	GCC	2	6	601989	601994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933615
15522	NC_005296	GTA	2	6	602025	602030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933615
15523	NC_005296	CCG	2	6	602126	602131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933615
15524	NC_005296	ATG	2	6	602158	602163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933615
15525	NC_005296	CAA	2	6	602185	602190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_005296	TGGA	2	8	602193	602200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_005296	GAG	2	6	602224	602229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_005296	GAC	2	6	602282	602287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_005296	GCG	2	6	602310	602315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_005296	TCA	2	6	602330	602335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_005296	CAA	2	6	602396	602401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_005296	AGGTCG	2	12	602457	602468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15533	NC_005296	GCC	3	9	602520	602528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15534	NC_005296	GCA	2	6	602557	602562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_005296	GCA	2	6	602591	602596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_005296	TCT	2	6	602598	602603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_005296	GC	3	6	602623	602628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15538	NC_005296	CG	4	8	602641	602648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15539	NC_005296	GAA	2	6	602675	602680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_005296	CGA	2	6	602708	602713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_005296	AGC	2	6	602724	602729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_005296	CG	3	6	602785	602790	0 %	0 %	50 %	50 %	39933616
15543	NC_005296	CGA	2	6	602801	602806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933616
15544	NC_005296	CGA	2	6	602865	602870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933616
15545	NC_005296	CGT	2	6	603002	603007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933616
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15550	NC_005296	CGA	2	6	603138	603143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933616
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15553	NC_005296	GCT	2	6	603394	603399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933617
15554	NC_005296	CAG	2	6	603418	603423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933617
15555	NC_005296	CAG	2	6	603454	603459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933617
15556	NC_005296	GGCG	2	8	603462	603469	0 %	0 %	75 %	25 %	39933617
15557	NC_005296	CTCG	2	8	603487	603494	0 %	25 %	25 %	50 %	39933617
15558	NC_005296	CAG	2	6	603496	603501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933617
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15562	NC_005296	CCAC	2	8	603591	603598	25 %	0 %	0 %	75 %	39933617
15563	NC_005296	GCC	2	6	603610	603615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933617
15564	NC_005296	GCG	3	9	603626	603634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933617
15565	NC_005296	CGA	2	6	603670	603675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933617
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15567	NC_005296	GC	3	6	603773	603778	0 %	0 %	50 %	50 %	39933617
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15572	NC_005296	GCAG	2	8	604023	604030	25 %	0 %	50 %	25 %	39933617
15573	NC_005296	AGT	2	6	604098	604103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933617
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15581	NC_005296	TCG	2	6	604322	604327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_005296	CGAC	2	8	604408	604415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15583	NC_005296	TGC	2	6	604498	604503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15584	NC_005296	CTG	2	6	604514	604519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15585	NC_005296	CG	3	6	604685	604690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15586	NC_005296	GC	3	6	604713	604718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15587	NC_005296	CGG	2	6	604752	604757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15588	NC_005296	CCGTCG	2	12	604936	604947	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933618
15589	NC_005296	GGC	2	6	604955	604960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933618
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15592	NC_005296	GCT	2	6	605060	605065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933618
15593	NC_005296	CG	3	6	605088	605093	0 %	0 %	50 %	50 %	39933618
15594	NC_005296	CTG	2	6	605103	605108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933618
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15602	NC_005296	CGC	2	6	605357	605362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933618
15603	NC_005296	GCG	2	6	605393	605398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933618
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15605	NC_005296	CGT	2	6	605416	605421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933619
15606	NC_005296	GC	3	6	605494	605499	0 %	0 %	50 %	50 %	39933619
15607	NC_005296	CAGCGC	2	12	605528	605539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933619
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15609	NC_005296	CCA	3	9	605572	605580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933619
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15622	NC_005296	ACG	2	6	606021	606026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933619
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15986	NC_005296	GCT	2	6	619821	619826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933635
15987	NC_005296	CCGGC	2	10	619846	619855	0 %	0 %	40 %	60 %	39933635
15988	NC_005296	GTAT	2	8	619858	619865	25 %	50 %	25 %	0 %	39933635
15989	NC_005296	GCC	2	6	619868	619873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933635
15990	NC_005296	TCA	2	6	619896	619901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933635
15991	NC_005296	TCG	2	6	619904	619909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933635
15992	NC_005296	GAT	2	6	619915	619920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933635
15993	NC_005296	CGAACT	2	12	619941	619952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	39933635
15994	NC_005296	GAT	3	9	619963	619971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933635
15995	NC_005296	CG	4	8	620011	620018	0 %	0 %	50 %	50 %	39933635
15996	NC_005296	GGC	2	6	620038	620043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933635
15997	NC_005296	TCG	2	6	620045	620050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933635
15998	NC_005296	CGA	2	6	620052	620057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933635
15999	NC_005296	CG	3	6	620069	620074	0 %	0 %	50 %	50 %	39933635
16000	NC_005296	TCG	2	6	620087	620092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933635

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