MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_005296	CG	3	6	582022	582027	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15002	NC_005296	GGCT	2	8	582086	582093	0 %	25 %	50 %	25 %	39933598
15003	NC_005296	GCC	2	6	582101	582106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933598
15004	NC_005296	AGCG	2	8	582113	582120	25 %	0 %	50 %	25 %	39933598
15005	NC_005296	TCG	2	6	582135	582140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15006	NC_005296	GC	3	6	582152	582157	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15007	NC_005296	CTG	2	6	582215	582220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15008	NC_005296	GCCG	2	8	582226	582233	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15009	NC_005296	CTCG	2	8	582295	582302	0 %	25 %	25 %	50 %	39933598
15010	NC_005296	GCT	2	6	582322	582327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15011	NC_005296	TGG	2	6	582333	582338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933598
15012	NC_005296	TGA	2	6	582394	582399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933598
15013	NC_005296	TGC	2	6	582436	582441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15014	NC_005296	CTG	2	6	582470	582475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15015	NC_005296	GCCG	2	8	582477	582484	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15016	NC_005296	TCG	2	6	582522	582527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15017	NC_005296	CGA	3	9	582544	582552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15018	NC_005296	TCGACG	2	12	582555	582566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15019	NC_005296	GAA	2	6	582574	582579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933598
15020	NC_005296	GCG	2	6	582667	582672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933598
15021	NC_005296	CG	3	6	582695	582700	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15022	NC_005296	GCC	2	6	582753	582758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933598
15023	NC_005296	GCT	2	6	582778	582783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15024	NC_005296	ATC	2	6	582854	582859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933598
15025	NC_005296	TGC	2	6	582879	582884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15026	NC_005296	TGC	2	6	582901	582906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15027	NC_005296	GTC	2	6	582983	582988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15028	NC_005296	CGG	2	6	583019	583024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933598
15029	NC_005296	TGC	2	6	583083	583088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15030	NC_005296	GAT	2	6	583124	583129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933598
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15032	NC_005296	CAAGAT	2	12	583180	583191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	39933598
15033	NC_005296	TCGT	2	8	583199	583206	0 %	50 %	25 %	25 %	39933598
15034	NC_005296	CGA	2	6	583219	583224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933598
15035	NC_005296	CG	3	6	583235	583240	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15036	NC_005296	CTCG	2	8	583258	583265	0 %	25 %	25 %	50 %	39933598
15037	NC_005296	GCCG	2	8	583371	583378	0 %	0 %	50 %	50 %	39933598
15038	NC_005296	GA	3	6	583389	583394	50 %	0 %	50 %	0 %	39933598
15039	NC_005296	AGTC	2	8	583444	583451	25 %	25 %	25 %	25 %	39933598
15040	NC_005296	CCG	2	6	583468	583473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15041	NC_005296	CGAG	2	8	583478	583485	25 %	0 %	50 %	25 %	39933599
15042	NC_005296	TAC	2	6	583501	583506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933599
15043	NC_005296	CGG	2	6	583524	583529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933599
15044	NC_005296	GAG	2	6	583546	583551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933599
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15046	NC_005296	GC	3	6	583607	583612	0 %	0 %	50 %	50 %	39933599
15047	NC_005296	CG	3	6	583691	583696	0 %	0 %	50 %	50 %	39933599
15048	NC_005296	CG	3	6	583787	583792	0 %	0 %	50 %	50 %	39933599
15049	NC_005296	GCT	2	6	583863	583868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933599
15050	NC_005296	GAA	3	9	583894	583902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933599
15051	NC_005296	CGC	2	6	583908	583913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933599
15052	NC_005296	GCG	2	6	583922	583927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_005296	CGC	2	6	583940	583945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933600
15054	NC_005296	ACGA	2	8	583983	583990	50 %	0 %	25 %	25 %	39933600
15055	NC_005296	ACG	2	6	583992	583997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933600
15056	NC_005296	GCG	2	6	584015	584020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933600
15057	NC_005296	CGGT	2	8	584028	584035	0 %	25 %	50 %	25 %	39933600
15058	NC_005296	ACGA	2	8	584073	584080	50 %	0 %	25 %	25 %	39933600
15059	NC_005296	TCG	2	6	584118	584123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933600
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15061	NC_005296	CGC	2	6	584155	584160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933600
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15074	NC_005296	GC	4	8	584452	584459	0 %	0 %	50 %	50 %	39933600
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15089	NC_005296	GTC	2	6	584841	584846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
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15091	NC_005296	GC	3	6	584891	584896	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
15092	NC_005296	CTG	2	6	584973	584978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
15093	NC_005296	CG	3	6	584983	584988	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
15094	NC_005296	GCC	2	6	585045	585050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933601
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15101	NC_005296	TGT	2	6	585239	585244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933601
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15105	NC_005296	CGAT	2	8	585325	585332	25 %	25 %	25 %	25 %	39933601
15106	NC_005296	GCG	2	6	585343	585348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933601
15107	NC_005296	GCC	3	9	585381	585389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933601
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15109	NC_005296	TCG	2	6	585454	585459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
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15111	NC_005296	GCCG	2	8	585467	585474	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
15112	NC_005296	AGC	2	6	585475	585480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933601
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15115	NC_005296	CGG	2	6	585610	585615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_005296	GGCCA	2	10	585625	585634	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15117	NC_005296	TGG	2	6	585708	585713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933602
15118	NC_005296	GCT	2	6	585721	585726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933602
15119	NC_005296	GGC	3	9	585758	585766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933602
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15121	NC_005296	CGA	2	6	585940	585945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933602
15122	NC_005296	CGG	2	6	585970	585975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933602
15123	NC_005296	CAG	2	6	585989	585994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933602
15124	NC_005296	GGCCG	2	10	586017	586026	0 %	0 %	60 %	40 %	39933602
15125	NC_005296	TGC	2	6	586080	586085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933602
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15132	NC_005296	GC	3	6	586448	586453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15133	NC_005296	GAA	2	6	586535	586540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933603
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15138	NC_005296	CGC	2	6	586769	586774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15139	NC_005296	CG	3	6	586813	586818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15140	NC_005296	CGTCCG	2	12	586887	586898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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15148	NC_005296	GCT	2	6	587186	587191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933604
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15168	NC_005296	GTCGT	2	10	588146	588155	0 %	40 %	40 %	20 %	39933606
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15220	NC_005296	GA	3	6	589899	589904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15221	NC_005296	GTC	2	6	589956	589961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15223	NC_005296	GCT	2	6	590018	590023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933607
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15232	NC_005296	ATCG	2	8	590304	590311	25 %	25 %	25 %	25 %	39933607
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15238	NC_005296	T	6	6	590577	590582	0 %	100 %	0 %	0 %	39933607
15239	NC_005296	CA	4	8	590619	590626	50 %	0 %	0 %	50 %	39933607
15240	NC_005296	GGA	2	6	590628	590633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933607
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15484	NC_005296	ATG	2	6	600087	600092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15485	NC_005296	TCAA	2	8	600154	600161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15486	NC_005296	CG	3	6	600203	600208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15487	NC_005296	GCAGG	2	10	600236	600245	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15488	NC_005296	CGA	2	6	600264	600269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_005296	ACA	2	6	600457	600462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15490	NC_005296	AGC	2	6	600507	600512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_005296	CTG	2	6	600549	600554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_005296	GCTT	2	8	600606	600613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15493	NC_005296	AG	3	6	600630	600635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_005296	CGA	2	6	600651	600656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15495	NC_005296	CGG	2	6	600664	600669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15496	NC_005296	CCG	2	6	600674	600679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15497	NC_005296	TCA	2	6	600684	600689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15498	NC_005296	CGGC	2	8	600779	600786	0 %	0 %	50 %	50 %	39933615
15499	NC_005296	GCA	2	6	600809	600814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933615
15500	NC_005296	GAG	2	6	600820	600825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933615

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