MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_005296	GAC	2	6	504275	504280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_005296	ATG	2	6	504374	504379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933535
13003	NC_005296	TCG	2	6	504416	504421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13004	NC_005296	CG	3	6	504475	504480	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13005	NC_005296	CGT	2	6	504483	504488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13006	NC_005296	CGG	2	6	504489	504494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13007	NC_005296	CGGGCG	2	12	504508	504519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13008	NC_005296	TTC	2	6	504535	504540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933535
13009	NC_005296	GTC	2	6	504550	504555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13010	NC_005296	CG	3	6	504618	504623	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13011	NC_005296	CGC	3	9	504636	504644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933535
13012	NC_005296	CGA	2	6	504669	504674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13013	NC_005296	TCG	3	9	504689	504697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13014	NC_005296	TGG	2	6	504699	504704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933535
13015	NC_005296	CGG	2	6	504729	504734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13016	NC_005296	CGG	2	6	504747	504752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13017	NC_005296	T	6	6	504753	504758	0 %	100 %	0 %	0 %	39933535
13018	NC_005296	CGC	2	6	504810	504815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933535
13019	NC_005296	CG	3	6	504822	504827	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13020	NC_005296	CGA	2	6	504849	504854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13021	NC_005296	GGAT	2	8	504872	504879	25 %	25 %	50 %	0 %	39933535
13022	NC_005296	CCG	2	6	504898	504903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933535
13023	NC_005296	TCG	2	6	504914	504919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13024	NC_005296	CATCG	2	10	504988	504997	20 %	20 %	20 %	40 %	39933535
13025	NC_005296	ATG	2	6	505040	505045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933535
13026	NC_005296	CGA	2	6	505057	505062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13027	NC_005296	GAT	2	6	505086	505091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933535
13028	NC_005296	TCG	2	6	505110	505115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13029	NC_005296	CG	3	6	505303	505308	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13030	NC_005296	CGA	2	6	505311	505316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13031	NC_005296	GTT	2	6	505324	505329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933535
13032	NC_005296	TGT	2	6	505335	505340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933535
13033	NC_005296	GCGTCA	2	12	505344	505355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13034	NC_005296	GGT	2	6	505372	505377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933535
13035	NC_005296	TCG	2	6	505406	505411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13036	NC_005296	GGC	2	6	505432	505437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13037	NC_005296	CG	3	6	505454	505459	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13038	NC_005296	TCG	2	6	505478	505483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13039	NC_005296	CCG	2	6	505511	505516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933535
13040	NC_005296	GC	3	6	505560	505565	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13041	NC_005296	CGA	2	6	505569	505574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933535
13042	NC_005296	GCG	2	6	505651	505656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13043	NC_005296	GGC	3	9	505737	505745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933535
13044	NC_005296	TG	3	6	505750	505755	0 %	50 %	50 %	0 %	39933535
13045	NC_005296	CCGG	2	8	505766	505773	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13046	NC_005296	CG	3	6	505849	505854	0 %	0 %	50 %	50 %	39933535
13047	NC_005296	AGC	2	6	505963	505968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933536
13048	NC_005296	CGC	2	6	505982	505987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933536
13049	NC_005296	CTT	2	6	506044	506049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_005296	GTC	2	6	506060	506065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_005296	GCC	2	6	506103	506108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_005296	CCG	2	6	506126	506131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_005296	CTGC	2	8	506150	506157	0 %	25 %	25 %	50 %	39933537
13054	NC_005296	CGC	2	6	506183	506188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933537
13055	NC_005296	GCA	2	6	506234	506239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13056	NC_005296	GATC	2	8	506276	506283	25 %	25 %	25 %	25 %	39933537
13057	NC_005296	TCT	2	6	506345	506350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933537
13058	NC_005296	CTT	2	6	506379	506384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933537
13059	NC_005296	CGT	2	6	506408	506413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13060	NC_005296	TGG	2	6	506414	506419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933537
13061	NC_005296	CAT	2	6	506478	506483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933537
13062	NC_005296	GTTGCC	2	12	506511	506522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13063	NC_005296	TTG	2	6	506530	506535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933537
13064	NC_005296	ATC	2	6	506539	506544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933537
13065	NC_005296	CCG	2	6	506564	506569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933537
13066	NC_005296	GCCACC	2	12	506583	506594	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	39933537
13067	NC_005296	CGC	2	6	506654	506659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933537
13068	NC_005296	GCG	2	6	506729	506734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933537
13069	NC_005296	GAT	2	6	506741	506746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933537
13070	NC_005296	GCG	2	6	506852	506857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933537
13071	NC_005296	GAT	2	6	506883	506888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933537
13072	NC_005296	TGCCG	2	10	506897	506906	0 %	20 %	40 %	40 %	39933537
13073	NC_005296	CGG	2	6	506954	506959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933537
13074	NC_005296	GGCC	2	8	506997	507004	0 %	0 %	50 %	50 %	39933537
13075	NC_005296	GCA	2	6	507065	507070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13076	NC_005296	TCG	2	6	507085	507090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13077	NC_005296	CTTGC	2	10	507099	507108	0 %	40 %	20 %	40 %	39933537
13078	NC_005296	CGA	2	6	507110	507115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13079	NC_005296	TGC	2	6	507123	507128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13080	NC_005296	GGT	2	6	507177	507182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933537
13081	NC_005296	CCT	2	6	507236	507241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933537
13082	NC_005296	CCA	2	6	507260	507265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933537
13083	NC_005296	CGCT	2	8	507283	507290	0 %	25 %	25 %	50 %	39933537
13084	NC_005296	GATC	2	8	507308	507315	25 %	25 %	25 %	25 %	39933537
13085	NC_005296	TGC	2	6	507320	507325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933537
13086	NC_005296	TCC	2	6	507338	507343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_005296	TGGC	2	8	507350	507357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13088	NC_005296	TCCGC	2	10	507394	507403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13089	NC_005296	GCGA	2	8	507441	507448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13090	NC_005296	CGA	3	9	507446	507454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_005296	GAAC	2	8	507466	507473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13092	NC_005296	GTGGC	2	10	507477	507486	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13093	NC_005296	CGC	2	6	507498	507503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_005296	CGG	2	6	507518	507523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_005296	GAT	2	6	507572	507577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_005296	CGG	2	6	507620	507625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_005296	GC	3	6	507682	507687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_005296	CG	3	6	507748	507753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_005296	CGC	2	6	507771	507776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_005296	GCAC	2	8	507837	507844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_005296	TCG	2	6	507866	507871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_005296	GCC	2	6	507891	507896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_005296	CTC	2	6	507938	507943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_005296	GGCC	2	8	507957	507964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13105	NC_005296	CCA	2	6	508036	508041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_005296	CACC	2	8	508064	508071	25 %	0 %	0 %	75 %	39933538
13107	NC_005296	CGC	2	6	508083	508088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933538
13108	NC_005296	GCC	2	6	508096	508101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933538
13109	NC_005296	GCT	2	6	508131	508136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933538
13110	NC_005296	CGA	2	6	508178	508183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933538
13111	NC_005296	GCC	2	6	508240	508245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933538
13112	NC_005296	AGC	2	6	508310	508315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933538
13113	NC_005296	ATC	2	6	508348	508353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933538
13114	NC_005296	GCC	2	6	508438	508443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933538
13115	NC_005296	GCG	2	6	508470	508475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933538
13116	NC_005296	AGC	2	6	508532	508537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933538
13117	NC_005296	GCG	2	6	508550	508555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933538
13118	NC_005296	GAT	2	6	508584	508589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933538
13119	NC_005296	GGC	2	6	508614	508619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933538
13120	NC_005296	GTG	2	6	508630	508635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933538
13121	NC_005296	GCCG	2	8	508641	508648	0 %	0 %	50 %	50 %	39933538
13122	NC_005296	CGC	2	6	508655	508660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933538
13123	NC_005296	GGC	2	6	508677	508682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933538
13124	NC_005296	GGCG	2	8	508695	508702	0 %	0 %	75 %	25 %	39933538
13125	NC_005296	TCG	2	6	508784	508789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933538
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13146	NC_005296	CGG	2	6	509615	509620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13147	NC_005296	CGCC	2	8	509660	509667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13148	NC_005296	CGT	2	6	509699	509704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13228	NC_005296	GGC	2	6	513048	513053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13241	NC_005296	CGA	2	6	513558	513563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933542
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13243	NC_005296	GTA	2	6	513577	513582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933542
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13485	NC_005296	CGG	2	6	523034	523039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933550
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