MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133501	NC_005296	CCA	3	9	5154175	5154183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937630
133502	NC_005296	GA	3	6	5154213	5154218	50 %	0 %	50 %	0 %	39937630
133503	NC_005296	CGC	2	6	5154219	5154224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937630
133504	NC_005296	CACGCG	2	12	5154401	5154412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133505	NC_005296	GA	3	6	5154437	5154442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133506	NC_005296	TTAC	2	8	5154454	5154461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133507	NC_005296	AGAT	2	8	5154471	5154478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133508	NC_005296	GGC	2	6	5154509	5154514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133509	NC_005296	GCG	2	6	5154550	5154555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937631
133510	NC_005296	CGAC	2	8	5154633	5154640	25 %	0 %	25 %	50 %	39937631
133511	NC_005296	TCC	2	6	5154661	5154666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39937631
133512	NC_005296	GCC	2	6	5154685	5154690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937631
133513	NC_005296	TCGCC	2	10	5154729	5154738	0 %	20 %	20 %	60 %	39937631
133514	NC_005296	GCC	2	6	5154757	5154762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937631
133515	NC_005296	TTC	2	6	5154766	5154771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937631
133516	NC_005296	CTG	2	6	5154823	5154828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937631
133517	NC_005296	GCC	4	12	5154838	5154849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937631
133518	NC_005296	ACG	2	6	5154858	5154863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937631
133519	NC_005296	AGC	3	9	5154977	5154985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937631
133520	NC_005296	CGG	2	6	5154999	5155004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937631
133521	NC_005296	GCG	2	6	5155016	5155021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937631
133522	NC_005296	GCG	2	6	5155065	5155070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133523	NC_005296	CGC	2	6	5155079	5155084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133524	NC_005296	GCCG	2	8	5155131	5155138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133525	NC_005296	CGA	2	6	5155173	5155178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937632
133526	NC_005296	ACC	2	6	5155238	5155243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937632
133527	NC_005296	ACG	2	6	5155284	5155289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937632
133528	NC_005296	CGC	2	6	5155312	5155317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937632
133529	NC_005296	CG	3	6	5155355	5155360	0 %	0 %	50 %	50 %	39937632
133530	NC_005296	CGA	2	6	5155380	5155385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937632
133531	NC_005296	CGG	2	6	5155386	5155391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937632
133532	NC_005296	AGC	2	6	5155394	5155399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937632
133533	NC_005296	ATG	2	6	5155427	5155432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937632
133534	NC_005296	GAC	2	6	5155450	5155455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133535	NC_005296	CGA	2	6	5155470	5155475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133536	NC_005296	CGC	3	9	5155489	5155497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133537	NC_005296	CGC	2	6	5155519	5155524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133538	NC_005296	GCC	2	6	5155567	5155572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133539	NC_005296	CG	3	6	5155611	5155616	0 %	0 %	50 %	50 %	39937633
133540	NC_005296	CGC	3	9	5155623	5155631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937633
133541	NC_005296	CGAT	2	8	5155686	5155693	25 %	25 %	25 %	25 %	39937633
133542	NC_005296	CGG	2	6	5155705	5155710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937633
133543	NC_005296	GCT	2	6	5155723	5155728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937633
133544	NC_005296	GCT	2	6	5155777	5155782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937633
133545	NC_005296	GAC	2	6	5155790	5155795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937633
133546	NC_005296	GAT	2	6	5155801	5155806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937633
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133549	NC_005296	GCA	2	6	5155876	5155881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937633
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133551	NC_005296	TCGG	2	8	5155946	5155953	0 %	25 %	50 %	25 %	39937633
133552	NC_005296	GTCG	2	8	5156032	5156039	0 %	25 %	50 %	25 %	39937633
133553	NC_005296	CG	3	6	5156066	5156071	0 %	0 %	50 %	50 %	39937633
133554	NC_005296	CTG	2	6	5156072	5156077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937633
133555	NC_005296	CGA	2	6	5156101	5156106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937633
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133559	NC_005296	CTG	2	6	5156186	5156191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937633
133560	NC_005296	TC	3	6	5156196	5156201	0 %	50 %	0 %	50 %	39937633
133561	NC_005296	CGA	2	6	5156209	5156214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937633
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133576	NC_005296	GCGCT	2	10	5156736	5156745	0 %	20 %	40 %	40 %	39937633
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133600	NC_005296	TGA	2	6	5157451	5157456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937634
133601	NC_005296	GCT	2	6	5157482	5157487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937634
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133607	NC_005296	CGCGGC	2	12	5157764	5157775	0 %	0 %	50 %	50 %	39937634
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133845	NC_005296	GCA	2	6	5167796	5167801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937643
133846	NC_005296	GC	3	6	5167810	5167815	0 %	0 %	50 %	50 %	39937643
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