MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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131002	NC_005296	ACC	2	6	5061300	5061305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937547
131003	NC_005296	GGCC	2	8	5061332	5061339	0 %	0 %	50 %	50 %	39937547
131004	NC_005296	GCCT	2	8	5061360	5061367	0 %	25 %	25 %	50 %	39937547
131005	NC_005296	GCT	2	6	5061380	5061385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937547
131006	NC_005296	CGC	2	6	5061395	5061400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937547
131007	NC_005296	CTT	2	6	5061449	5061454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937547
131008	NC_005296	TGC	2	6	5061469	5061474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937547
131009	NC_005296	GCG	2	6	5061475	5061480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937547
131010	NC_005296	CGA	2	6	5061491	5061496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937547
131011	NC_005296	CTG	2	6	5061519	5061524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937547
131012	NC_005296	GAA	2	6	5061527	5061532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39937547
131013	NC_005296	GC	3	6	5061573	5061578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131014	NC_005296	CCA	2	6	5061587	5061592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131015	NC_005296	GC	3	6	5061651	5061656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131016	NC_005296	GC	3	6	5061659	5061664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131017	NC_005296	CGT	3	9	5061789	5061797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131018	NC_005296	ACG	2	6	5061799	5061804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131019	NC_005296	GGGGCG	2	12	5061806	5061817	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
131020	NC_005296	CGC	2	6	5061818	5061823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131021	NC_005296	TGG	2	6	5061835	5061840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131022	NC_005296	CG	3	6	5061867	5061872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131023	NC_005296	GC	3	6	5061884	5061889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131024	NC_005296	CCA	2	6	5061890	5061895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131025	NC_005296	GCG	2	6	5061896	5061901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131026	NC_005296	TTC	2	6	5061922	5061927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131027	NC_005296	CCGTC	2	10	5061965	5061974	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131028	NC_005296	TAG	2	6	5062000	5062005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131029	NC_005296	CGG	2	6	5062006	5062011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131030	NC_005296	ACC	2	6	5062049	5062054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131031	NC_005296	CGC	2	6	5062065	5062070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131032	NC_005296	GCCG	2	8	5062115	5062122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131033	NC_005296	CGA	2	6	5062133	5062138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131034	NC_005296	CGC	2	6	5062248	5062253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131035	NC_005296	CGGC	2	8	5062254	5062261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131036	NC_005296	CG	3	6	5062268	5062273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131037	NC_005296	CGA	2	6	5062281	5062286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131038	NC_005296	TCGT	2	8	5062358	5062365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131039	NC_005296	GC	3	6	5062375	5062380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131040	NC_005296	GCT	2	6	5062412	5062417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131041	NC_005296	AACT	2	8	5062423	5062430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131042	NC_005296	ATC	2	6	5062443	5062448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131043	NC_005296	GC	3	6	5062485	5062490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131044	NC_005296	GC	3	6	5062495	5062500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131045	NC_005296	ACGA	2	8	5062512	5062519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131046	NC_005296	TAC	2	6	5062559	5062564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937548
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131050	NC_005296	ATG	2	6	5062716	5062721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937548
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131054	NC_005296	ACA	2	6	5062905	5062910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131055	NC_005296	CTC	2	6	5062914	5062919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131056	NC_005296	GC	3	6	5062931	5062936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131057	NC_005296	GCT	2	6	5062968	5062973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131058	NC_005296	ATC	2	6	5062999	5063004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131059	NC_005296	GC	3	6	5063041	5063046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131060	NC_005296	GC	3	6	5063051	5063056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131061	NC_005296	CGAC	2	8	5063118	5063125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131062	NC_005296	CGG	2	6	5063131	5063136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131063	NC_005296	CCG	2	6	5063179	5063184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131064	NC_005296	GCC	2	6	5063224	5063229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131065	NC_005296	GCT	2	6	5063246	5063251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131066	NC_005296	GCGA	2	8	5063259	5063266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131067	NC_005296	CGGG	2	8	5063275	5063282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131068	NC_005296	GA	3	6	5063307	5063312	50 %	0 %	50 %	0 %	39937549
131069	NC_005296	TGG	2	6	5063477	5063482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937549
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131071	NC_005296	TGCG	2	8	5063525	5063532	0 %	25 %	50 %	25 %	39937549
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131093	NC_005296	CG	4	8	5064342	5064349	0 %	0 %	50 %	50 %	39937549
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131105	NC_005296	CGC	2	6	5064762	5064767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937549
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