MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130501	NC_005296	TTTG	2	8	5041989	5041996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130502	NC_005296	GCC	2	6	5042011	5042016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937527
130503	NC_005296	GCC	2	6	5042020	5042025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937527
130504	NC_005296	GAT	2	6	5042089	5042094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937527
130505	NC_005296	CGAGGC	2	12	5042125	5042136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39937527
130506	NC_005296	TTCGAC	2	12	5042242	5042253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	39937527
130507	NC_005296	CAC	2	6	5042263	5042268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937527
130508	NC_005296	CTT	2	6	5042323	5042328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937527
130509	NC_005296	CTT	2	6	5042341	5042346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937527
130510	NC_005296	CGC	2	6	5042365	5042370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937527
130511	NC_005296	TCC	2	6	5042479	5042484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130512	NC_005296	CAT	2	6	5042559	5042564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130513	NC_005296	GGA	2	6	5042642	5042647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130514	NC_005296	GGA	2	6	5042649	5042654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130515	NC_005296	CGG	2	6	5042680	5042685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937528
130516	NC_005296	TCG	2	6	5042716	5042721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937528
130517	NC_005296	GAT	2	6	5042768	5042773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937528
130518	NC_005296	AGC	2	6	5042962	5042967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937528
130519	NC_005296	CTG	2	6	5042970	5042975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937528
130520	NC_005296	TGCA	2	8	5042979	5042986	25 %	25 %	25 %	25 %	39937528
130521	NC_005296	CGC	2	6	5043024	5043029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937528
130522	NC_005296	TGG	2	6	5043067	5043072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937528
130523	NC_005296	CAA	2	6	5043083	5043088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39937528
130524	NC_005296	CCG	2	6	5043170	5043175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937528
130525	NC_005296	CGG	2	6	5043176	5043181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937528
130526	NC_005296	GC	3	6	5043322	5043327	0 %	0 %	50 %	50 %	39937528
130527	NC_005296	CAA	2	6	5043428	5043433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39937528
130528	NC_005296	CGG	2	6	5043439	5043444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937528
130529	NC_005296	GCG	2	6	5043445	5043450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937528
130530	NC_005296	GAGG	2	8	5043478	5043485	25 %	0 %	75 %	0 %	39937528
130531	NC_005296	CGG	2	6	5043531	5043536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937529
130532	NC_005296	CG	3	6	5043568	5043573	0 %	0 %	50 %	50 %	39937529
130533	NC_005296	GCCG	2	8	5043594	5043601	0 %	0 %	50 %	50 %	39937529
130534	NC_005296	CGA	2	6	5043638	5043643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937529
130535	NC_005296	CCA	2	6	5043665	5043670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937529
130536	NC_005296	CAC	2	6	5043681	5043686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937529
130537	NC_005296	GCA	2	6	5043756	5043761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937529
130538	NC_005296	CGA	2	6	5043774	5043779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937529
130539	NC_005296	CAA	2	6	5043795	5043800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39937529
130540	NC_005296	ACG	2	6	5043809	5043814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937529
130541	NC_005296	GCGAT	2	10	5043830	5043839	20 %	20 %	40 %	20 %	39937529
130542	NC_005296	GGT	2	6	5043861	5043866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937529
130543	NC_005296	GGC	2	6	5043934	5043939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937529
130544	NC_005296	GGC	2	6	5043970	5043975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937529
130545	NC_005296	GGT	2	6	5044119	5044124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937529
130546	NC_005296	CAG	2	6	5044174	5044179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937529
130547	NC_005296	CCA	2	6	5044239	5044244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130548	NC_005296	CGC	2	6	5044283	5044288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130549	NC_005296	TCG	2	6	5044341	5044346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130550	NC_005296	CT	3	6	5044348	5044353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130551	NC_005296	GA	3	6	5044366	5044371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130552	NC_005296	TAGTCG	2	12	5044420	5044431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	39937530
130553	NC_005296	GCT	2	6	5044439	5044444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937530
130554	NC_005296	CGA	2	6	5044463	5044468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937530
130555	NC_005296	CGC	2	6	5044514	5044519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937530
130556	NC_005296	GGC	2	6	5044523	5044528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937530
130557	NC_005296	GGT	2	6	5044598	5044603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937530
130558	NC_005296	CA	3	6	5044629	5044634	50 %	0 %	0 %	50 %	39937530
130559	NC_005296	ACCGGC	2	12	5044680	5044691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39937530
130560	NC_005296	CGT	3	9	5044751	5044759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937530
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130562	NC_005296	TCG	2	6	5044777	5044782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937530
130563	NC_005296	GCC	2	6	5044785	5044790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937530
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130565	NC_005296	CG	3	6	5044900	5044905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130566	NC_005296	GC	3	6	5044918	5044923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130567	NC_005296	GGC	2	6	5044980	5044985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130568	NC_005296	TCGC	2	8	5044996	5045003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130569	NC_005296	GAGCGC	2	12	5045005	5045016	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130570	NC_005296	CGG	2	6	5045131	5045136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937531
130571	NC_005296	CTT	2	6	5045179	5045184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937531
130572	NC_005296	GGC	2	6	5045185	5045190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937531
130573	NC_005296	TGC	2	6	5045277	5045282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937531
130574	NC_005296	CGT	2	6	5045382	5045387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937531
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130576	NC_005296	TCA	2	6	5045637	5045642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937531
130577	NC_005296	TCC	2	6	5045647	5045652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130578	NC_005296	GCA	2	6	5045701	5045706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937532
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130581	NC_005296	AGC	2	6	5045892	5045897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937532
130582	NC_005296	GCC	2	6	5045910	5045915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937532
130583	NC_005296	CAG	2	6	5045936	5045941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937532
130584	NC_005296	TCG	2	6	5045944	5045949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937532
130585	NC_005296	CACG	2	8	5045963	5045970	25 %	0 %	25 %	50 %	39937532
130586	NC_005296	CGA	2	6	5045998	5046003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937532
130587	NC_005296	AAC	2	6	5046078	5046083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39937532
130588	NC_005296	GAT	3	9	5046107	5046115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937532
130589	NC_005296	GGC	2	6	5046233	5046238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937532
130590	NC_005296	CG	3	6	5046280	5046285	0 %	0 %	50 %	50 %	39937532
130591	NC_005296	GCA	2	6	5046340	5046345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937532
130592	NC_005296	ACC	2	6	5046408	5046413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937532
130593	NC_005296	GCG	2	6	5046516	5046521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130594	NC_005296	GGC	2	6	5046536	5046541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130595	NC_005296	GCT	2	6	5046644	5046649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937533
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130598	NC_005296	GC	3	6	5046808	5046813	0 %	0 %	50 %	50 %	39937533
130599	NC_005296	CGC	2	6	5046815	5046820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937533
130600	NC_005296	GCC	2	6	5046836	5046841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937533
130601	NC_005296	GC	3	6	5046983	5046988	0 %	0 %	50 %	50 %	39937534
130602	NC_005296	GCT	4	12	5047030	5047041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937534
130603	NC_005296	CGAGCG	2	12	5047054	5047065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39937534
130604	NC_005296	GCA	2	6	5047117	5047122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937534
130605	NC_005296	ACG	2	6	5047140	5047145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937534
130606	NC_005296	TAC	2	6	5047181	5047186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937534
130607	NC_005296	GAC	2	6	5047199	5047204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937534
130608	NC_005296	TCT	2	6	5047236	5047241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937534
130609	NC_005296	ACA	2	6	5047292	5047297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130610	NC_005296	GC	3	6	5047326	5047331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130611	NC_005296	GGCC	2	8	5047379	5047386	0 %	0 %	50 %	50 %	39937535
130612	NC_005296	CCG	2	6	5047402	5047407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937535
130613	NC_005296	TTC	2	6	5047410	5047415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937535
130614	NC_005296	GCG	2	6	5047468	5047473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937535
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130733	NC_005296	GAT	2	6	5051944	5051949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937539
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