MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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130002	NC_005296	GCA	3	9	5022845	5022853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130003	NC_005296	ACG	2	6	5022913	5022918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130004	NC_005296	GCG	2	6	5022928	5022933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937509
130005	NC_005296	GC	3	6	5022959	5022964	0 %	0 %	50 %	50 %	39937509
130006	NC_005296	CGG	2	6	5022992	5022997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937509
130007	NC_005296	CTT	2	6	5023007	5023012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937509
130008	NC_005296	TCG	2	6	5023114	5023119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130009	NC_005296	CGC	2	6	5023137	5023142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937509
130010	NC_005296	AGCGGC	2	12	5023143	5023154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39937509
130011	NC_005296	TCG	2	6	5023156	5023161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130012	NC_005296	CGA	2	6	5023265	5023270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130013	NC_005296	TGC	2	6	5023327	5023332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130014	NC_005296	CGGTGT	2	12	5023345	5023356	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	39937509
130015	NC_005296	GCG	2	6	5023364	5023369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937509
130016	NC_005296	CGG	2	6	5023418	5023423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937509
130017	NC_005296	CATCGA	2	12	5023427	5023438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	39937509
130018	NC_005296	ACG	2	6	5023459	5023464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937509
130019	NC_005296	GCC	2	6	5023519	5023524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937509
130020	NC_005296	GC	4	8	5023554	5023561	0 %	0 %	50 %	50 %	39937509
130021	NC_005296	CCAA	2	8	5023585	5023592	50 %	0 %	0 %	50 %	39937509
130022	NC_005296	TCG	2	6	5023627	5023632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937509
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130026	NC_005296	GCC	3	9	5023725	5023733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937509
130027	NC_005296	GTC	3	9	5023787	5023795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937509
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130032	NC_005296	CTG	2	6	5023959	5023964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937509
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130043	NC_005296	CAG	2	6	5024262	5024267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937509
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130048	NC_005296	CGGC	2	8	5024442	5024449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130049	NC_005296	GCCG	2	8	5024460	5024467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130050	NC_005296	AGCG	2	8	5024620	5024627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130051	NC_005296	CGG	2	6	5024656	5024661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937510
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130053	NC_005296	CGAT	2	8	5024677	5024684	25 %	25 %	25 %	25 %	39937510
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130110	NC_005296	AGC	4	12	5026436	5026447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937511
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130115	NC_005296	ACG	2	6	5026622	5026627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937511
130116	NC_005296	CTCCGA	2	12	5026644	5026655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	39937511
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130180	NC_005296	GC	3	6	5029080	5029085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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130217	NC_005296	CCG	2	6	5030872	5030877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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130469	NC_005296	CAG	2	6	5040331	5040336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937525
130470	NC_005296	CGA	2	6	5040351	5040356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937525
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130475	NC_005296	CAG	2	6	5040661	5040666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937525
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130488	NC_005296	GCT	2	6	5041398	5041403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937525
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130491	NC_005296	GCG	2	6	5041457	5041462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937525
130492	NC_005296	ATC	2	6	5041493	5041498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937525
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130495	NC_005296	GGT	2	6	5041598	5041603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130496	NC_005296	CGG	2	6	5041607	5041612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130497	NC_005296	CGT	2	6	5041620	5041625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130499	NC_005296	TGA	2	6	5041822	5041827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937526
130500	NC_005296	CG	3	6	5041945	5041950	0 %	0 %	50 %	50 %	39937526

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