MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_005296	TCG	2	6	483883	483888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12502	NC_005296	TCT	2	6	483907	483912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933515
12503	NC_005296	TCG	2	6	483931	483936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12504	NC_005296	CG	3	6	483986	483991	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12505	NC_005296	TCG	2	6	484069	484074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12506	NC_005296	CGT	2	6	484109	484114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12507	NC_005296	CGG	3	9	484253	484261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933515
12508	NC_005296	TCG	2	6	484267	484272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12509	NC_005296	TCGA	2	8	484279	484286	25 %	25 %	25 %	25 %	39933515
12510	NC_005296	CG	3	6	484295	484300	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12511	NC_005296	TTC	2	6	484317	484322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933515
12512	NC_005296	AGC	2	6	484348	484353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12513	NC_005296	CGA	2	6	484358	484363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12514	NC_005296	TCG	2	6	484366	484371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12515	NC_005296	TCT	2	6	484403	484408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933515
12516	NC_005296	GGC	2	6	484421	484426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933515
12517	NC_005296	GATGTC	2	12	484452	484463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	39933515
12518	NC_005296	TCG	2	6	484573	484578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12519	NC_005296	CGGC	2	8	484598	484605	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12520	NC_005296	ATG	2	6	484651	484656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933515
12521	NC_005296	TCT	2	6	484661	484666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933515
12522	NC_005296	GTTC	2	8	484676	484683	0 %	50 %	25 %	25 %	39933515
12523	NC_005296	ACC	2	6	484684	484689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933515
12524	NC_005296	CG	3	6	484697	484702	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12525	NC_005296	GAG	2	6	484741	484746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933515
12526	NC_005296	GAC	2	6	484755	484760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12527	NC_005296	GC	3	6	484771	484776	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12528	NC_005296	CGA	2	6	484808	484813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12529	NC_005296	CGT	2	6	484817	484822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12530	NC_005296	CGG	2	6	484909	484914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933515
12531	NC_005296	CG	3	6	484961	484966	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12532	NC_005296	GCA	2	6	484967	484972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12533	NC_005296	TCG	2	6	484975	484980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12534	NC_005296	CGG	2	6	484981	484986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933515
12535	NC_005296	CGC	2	6	484997	485002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933515
12536	NC_005296	CGA	2	6	485012	485017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12537	NC_005296	GAC	2	6	485043	485048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933515
12538	NC_005296	GCG	2	6	485149	485154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933515
12539	NC_005296	GCG	2	6	485171	485176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933515
12540	NC_005296	GC	3	6	485207	485212	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12541	NC_005296	GC	3	6	485221	485226	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12542	NC_005296	CTT	2	6	485310	485315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933515
12543	NC_005296	GC	4	8	485359	485366	0 %	0 %	50 %	50 %	39933515
12544	NC_005296	CGC	2	6	485391	485396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933515
12545	NC_005296	TGC	2	6	485405	485410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933515
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12548	NC_005296	CGG	2	6	485530	485535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933516
12549	NC_005296	GGC	2	6	485585	485590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933516
12550	NC_005296	CTT	2	6	485618	485623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933516
12551	NC_005296	GCG	3	9	485644	485652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933516
12552	NC_005296	GCCGC	2	10	485702	485711	0 %	0 %	40 %	60 %	39933516
12553	NC_005296	TCG	2	6	485730	485735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933516
12554	NC_005296	GCA	3	9	485773	485781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933516
12555	NC_005296	GCG	2	6	485936	485941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933516
12556	NC_005296	GAG	2	6	485967	485972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933516
12557	NC_005296	GATCG	2	10	485996	486005	20 %	20 %	40 %	20 %	39933516
12558	NC_005296	TCG	2	6	486051	486056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933516
12559	NC_005296	CCGCG	2	10	486182	486191	0 %	0 %	40 %	60 %	39933516
12560	NC_005296	CAG	2	6	486244	486249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933516
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12562	NC_005296	GCG	2	6	486343	486348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_005296	TAA	2	6	486370	486375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_005296	A	6	6	486374	486379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_005296	T	6	6	486450	486455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_005296	CGC	2	6	486520	486525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_005296	GATG	2	8	486594	486601	25 %	25 %	50 %	0 %	39933517
12568	NC_005296	CAGG	2	8	486643	486650	25 %	0 %	50 %	25 %	39933517
12569	NC_005296	GC	3	6	486664	486669	0 %	0 %	50 %	50 %	39933517
12570	NC_005296	CTG	2	6	486755	486760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933517
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12572	NC_005296	GCG	2	6	486895	486900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933517
12573	NC_005296	GAT	2	6	486904	486909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933517
12574	NC_005296	GAT	2	6	486914	486919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933517
12575	NC_005296	TCG	2	6	486927	486932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933517
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12581	NC_005296	CG	3	6	487387	487392	0 %	0 %	50 %	50 %	39933517
12582	NC_005296	GAG	2	6	487406	487411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933517
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12587	NC_005296	GCA	2	6	487603	487608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933517
12588	NC_005296	GCC	2	6	487685	487690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_005296	CG	3	6	487691	487696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12590	NC_005296	GAT	2	6	487801	487806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_005296	TAC	2	6	487828	487833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933518
12592	NC_005296	CGA	2	6	487852	487857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12593	NC_005296	TTCG	2	8	487963	487970	0 %	50 %	25 %	25 %	39933518
12594	NC_005296	CAA	2	6	487993	487998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933518
12595	NC_005296	ACG	2	6	488010	488015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12596	NC_005296	AGC	2	6	488042	488047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12597	NC_005296	TGC	2	6	488049	488054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12598	NC_005296	GTC	2	6	488057	488062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12599	NC_005296	TCG	2	6	488093	488098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12600	NC_005296	AGG	2	6	488127	488132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933518
12601	NC_005296	ATC	2	6	488249	488254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933518
12602	NC_005296	ACG	2	6	488301	488306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12603	NC_005296	TGCC	2	8	488322	488329	0 %	25 %	25 %	50 %	39933518
12604	NC_005296	CGG	2	6	488365	488370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933518
12605	NC_005296	CGC	2	6	488393	488398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933518
12606	NC_005296	GCA	2	6	488437	488442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933518
12607	NC_005296	CGG	2	6	488492	488497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933518
12608	NC_005296	CGATC	2	10	488557	488566	20 %	20 %	20 %	40 %	39933518
12609	NC_005296	CGC	2	6	488658	488663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12610	NC_005296	ATC	2	6	488768	488773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933519
12611	NC_005296	GC	4	8	488803	488810	0 %	0 %	50 %	50 %	39933519
12612	NC_005296	GC	5	10	488884	488893	0 %	0 %	50 %	50 %	39933519
12613	NC_005296	CGC	2	6	488897	488902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933519
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12615	NC_005296	GGAT	2	8	488961	488968	25 %	25 %	50 %	0 %	39933519
12616	NC_005296	GCCG	2	8	488990	488997	0 %	0 %	50 %	50 %	39933519
12617	NC_005296	CAG	2	6	489008	489013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933519
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12619	NC_005296	GCA	2	6	489265	489270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933519
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12621	NC_005296	GAA	2	6	489326	489331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933519
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12739	NC_005296	AGCCG	2	10	493936	493945	20 %	0 %	40 %	40 %	39933524
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