MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_005296	GTT	3	9	464077	464085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_005296	CGG	2	6	464125	464130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_005296	CG	3	6	464137	464142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12004	NC_005296	GGC	2	6	464162	464167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_005296	CAGG	2	8	464191	464198	25 %	0 %	50 %	25 %	39933499
12006	NC_005296	CGG	2	6	464207	464212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12007	NC_005296	TGA	2	6	464242	464247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933499
12008	NC_005296	GCA	3	9	464302	464310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12009	NC_005296	GCTCGT	2	12	464359	464370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12010	NC_005296	GCCGGC	2	12	464381	464392	0 %	0 %	50 %	50 %	39933499
12011	NC_005296	TCG	2	6	464430	464435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12012	NC_005296	CGC	2	6	464443	464448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933499
12013	NC_005296	GC	3	6	464447	464452	0 %	0 %	50 %	50 %	39933499
12014	NC_005296	GCC	2	6	464491	464496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933499
12015	NC_005296	ACA	2	6	464503	464508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933499
12016	NC_005296	GAT	2	6	464546	464551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933499
12017	NC_005296	TCG	2	6	464604	464609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12018	NC_005296	GGCGCG	2	12	464663	464674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12019	NC_005296	GC	3	6	464675	464680	0 %	0 %	50 %	50 %	39933499
12020	NC_005296	GAT	2	6	464708	464713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933499
12021	NC_005296	GCC	2	6	464726	464731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933499
12022	NC_005296	CGC	2	6	464776	464781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933499
12023	NC_005296	GCG	2	6	464796	464801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12024	NC_005296	ATC	2	6	464808	464813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933499
12025	NC_005296	CGG	2	6	464851	464856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12026	NC_005296	CG	3	6	464899	464904	0 %	0 %	50 %	50 %	39933499
12027	NC_005296	CGG	2	6	464992	464997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12028	NC_005296	TCG	2	6	465003	465008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12029	NC_005296	CGG	2	6	465031	465036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12030	NC_005296	GCGG	2	8	465038	465045	0 %	0 %	75 %	25 %	39933499
12031	NC_005296	GCT	2	6	465055	465060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12032	NC_005296	CGG	2	6	465061	465066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933499
12033	NC_005296	TCG	2	6	465078	465083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12034	NC_005296	TCGA	2	8	465123	465130	25 %	25 %	25 %	25 %	39933499
12035	NC_005296	GAC	3	9	465149	465157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933499
12036	NC_005296	CT	3	6	465189	465194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12037	NC_005296	GCA	2	6	465249	465254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12038	NC_005296	AGA	2	6	465335	465340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_005296	GCCGC	2	10	465380	465389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12040	NC_005296	CGA	2	6	465398	465403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_005296	CGATGA	2	12	465414	465425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	39933500
12042	NC_005296	GAT	2	6	465460	465465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933500
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12045	NC_005296	CGC	2	6	465719	465724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933500
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12047	NC_005296	GTG	2	6	465797	465802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933500
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12049	NC_005296	TCG	2	6	465864	465869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933500
12050	NC_005296	CGA	2	6	465922	465927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933500
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12052	NC_005296	A	6	6	465981	465986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_005296	TGC	2	6	465998	466003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12054	NC_005296	CTT	2	6	466054	466059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933501
12055	NC_005296	ACG	3	9	466070	466078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933501
12056	NC_005296	AGTTCG	2	12	466127	466138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	39933501
12057	NC_005296	GTT	2	6	466165	466170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933501
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12061	NC_005296	GCA	2	6	466425	466430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933501
12062	NC_005296	CAT	2	6	466440	466445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933501
12063	NC_005296	TTG	2	6	466601	466606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_005296	TAAG	2	8	466648	466655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_005296	GC	3	6	466717	466722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12066	NC_005296	GCAC	2	8	466728	466735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12068	NC_005296	CGAA	2	8	466769	466776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12069	NC_005296	TCG	2	6	466791	466796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12078	NC_005296	CGG	2	6	467091	467096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933502
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12080	NC_005296	GTC	2	6	467170	467175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933502
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12082	NC_005296	CGA	3	9	467247	467255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933502
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12092	NC_005296	CG	3	6	467573	467578	0 %	0 %	50 %	50 %	39933503
12093	NC_005296	GCG	2	6	467600	467605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933503
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12103	NC_005296	GC	3	6	468122	468127	0 %	0 %	50 %	50 %	39933503
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12108	NC_005296	GCCG	2	8	468289	468296	0 %	0 %	50 %	50 %	39933503
12109	NC_005296	CCG	2	6	468302	468307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933503
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12117	NC_005296	TTCGGC	2	12	468560	468571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933503
12118	NC_005296	CT	3	6	468622	468627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12119	NC_005296	GTT	2	6	468709	468714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12120	NC_005296	CG	5	10	468735	468744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12121	NC_005296	GC	4	8	468745	468752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12122	NC_005296	AG	3	6	468775	468780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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