MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_005296	CGG	2	6	425485	425490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933465
11003	NC_005296	GCT	2	6	425498	425503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933465
11004	NC_005296	CAG	2	6	425571	425576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933465
11005	NC_005296	CGT	2	6	425632	425637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933465
11006	NC_005296	CTG	2	6	425724	425729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933465
11007	NC_005296	GCC	2	6	425732	425737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
11008	NC_005296	CTT	2	6	425762	425767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933465
11009	NC_005296	GCC	2	6	425777	425782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
11010	NC_005296	CGC	3	9	425852	425860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
11011	NC_005296	GCC	2	6	425876	425881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
11012	NC_005296	AGG	2	6	425887	425892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933465
11013	NC_005296	ATCT	2	8	425919	425926	25 %	50 %	0 %	25 %	39933465
11014	NC_005296	TGG	2	6	425977	425982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933465
11015	NC_005296	CGG	3	9	425993	426001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933465
11016	NC_005296	GGA	2	6	426032	426037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933465
11017	NC_005296	AGA	2	6	426038	426043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933465
11018	NC_005296	CCG	3	9	426051	426059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
11019	NC_005296	AAC	2	6	426128	426133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_005296	CGGC	2	8	426191	426198	0 %	0 %	50 %	50 %	39933466
11021	NC_005296	CGG	2	6	426225	426230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933466
11022	NC_005296	GGC	2	6	426232	426237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933466
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11024	NC_005296	GCA	2	6	426257	426262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933466
11025	NC_005296	CGG	3	9	426312	426320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933466
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11043	NC_005296	GCA	2	6	427087	427092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933466
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11045	NC_005296	CG	3	6	427127	427132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_005296	CGGG	2	8	427170	427177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_005296	GAT	2	6	427178	427183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11049	NC_005296	CTG	2	6	427319	427324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11051	NC_005296	GCCC	2	8	427387	427394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11052	NC_005296	T	6	6	427429	427434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_005296	TGG	2	6	427473	427478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_005296	GTG	2	6	427482	427487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_005296	GAA	2	6	427506	427511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933467
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11058	NC_005296	GC	3	6	427565	427570	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
11059	NC_005296	TGCC	2	8	427571	427578	0 %	25 %	25 %	50 %	39933467
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11062	NC_005296	GGA	2	6	427659	427664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933467
11063	NC_005296	TCAGT	2	10	427797	427806	20 %	40 %	20 %	20 %	39933467
11064	NC_005296	GC	3	6	427811	427816	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
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11091	NC_005296	GCGACG	2	12	428798	428809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39933467
11092	NC_005296	CTG	2	6	428821	428826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933467
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11094	NC_005296	AAG	2	6	428857	428862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933467
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11096	NC_005296	CG	3	6	428904	428909	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
11097	NC_005296	GC	3	6	428917	428922	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
11098	NC_005296	GC	3	6	428943	428948	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
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11102	NC_005296	GCCG	2	8	429069	429076	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
11103	NC_005296	ATTC	2	8	429078	429085	25 %	50 %	0 %	25 %	39933467
11104	NC_005296	GC	3	6	429122	429127	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
11105	NC_005296	TGC	2	6	429153	429158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933467
11106	NC_005296	GC	3	6	429157	429162	0 %	0 %	50 %	50 %	39933467
11107	NC_005296	CGC	2	6	429197	429202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933467
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11112	NC_005296	TGCGC	2	10	429342	429351	0 %	20 %	40 %	40 %	39933467
11113	NC_005296	TCG	2	6	429397	429402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933467
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11115	NC_005296	TCGT	2	8	429451	429458	0 %	50 %	25 %	25 %	39933467
11116	NC_005296	GAGCT	2	10	429568	429577	20 %	20 %	40 %	20 %	39933467
11117	NC_005296	GCCC	2	8	429628	429635	0 %	0 %	25 %	75 %	39933467
11118	NC_005296	GCT	2	6	429654	429659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933467
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11122	NC_005296	GCG	2	6	429769	429774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933468
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11243	NC_005296	CGA	2	6	435164	435169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933473
11244	NC_005296	GC	3	6	435308	435313	0 %	0 %	50 %	50 %	39933473
11245	NC_005296	TCG	2	6	435315	435320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933473
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11487	NC_005296	CTG	2	6	444279	444284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11489	NC_005296	GCC	2	6	444301	444306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11490	NC_005296	CCA	2	6	444313	444318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11491	NC_005296	GCA	2	6	444348	444353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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