MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_005296	GGC	2	6	404739	404744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933447
10503	NC_005296	TGG	2	6	404822	404827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933447
10504	NC_005296	AAT	2	6	404829	404834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39933447
10505	NC_005296	CTT	2	6	404927	404932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933447
10506	NC_005296	CCG	2	6	404968	404973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933447
10507	NC_005296	ACG	2	6	405205	405210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933447
10508	NC_005296	CGGC	2	8	405261	405268	0 %	0 %	50 %	50 %	39933447
10509	NC_005296	CGGAA	2	10	405348	405357	40 %	0 %	40 %	20 %	39933447
10510	NC_005296	TCG	2	6	405358	405363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933447
10511	NC_005296	CGGTGG	2	12	405413	405424	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	39933447
10512	NC_005296	GC	4	8	405448	405455	0 %	0 %	50 %	50 %	39933447
10513	NC_005296	CG	3	6	405465	405470	0 %	0 %	50 %	50 %	39933447
10514	NC_005296	CAC	2	6	405553	405558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10515	NC_005296	CAT	2	6	405573	405578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_005296	AAC	2	6	405736	405741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_005296	CAAG	2	8	405760	405767	50 %	0 %	25 %	25 %	39933448
10518	NC_005296	TCC	2	6	405789	405794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933448
10519	NC_005296	GTCC	2	8	405817	405824	0 %	25 %	25 %	50 %	39933448
10520	NC_005296	CG	4	8	405837	405844	0 %	0 %	50 %	50 %	39933448
10521	NC_005296	CGGC	2	8	405957	405964	0 %	0 %	50 %	50 %	39933448
10522	NC_005296	GCC	2	6	405998	406003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933448
10523	NC_005296	GCT	2	6	406036	406041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933448
10524	NC_005296	GTA	2	6	406061	406066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933448
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10527	NC_005296	CGG	2	6	406114	406119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933448
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10529	NC_005296	CGA	2	6	406222	406227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933448
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10532	NC_005296	GCC	2	6	406289	406294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933448
10533	NC_005296	TCG	2	6	406303	406308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933448
10534	NC_005296	CGA	3	9	406378	406386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933448
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10536	NC_005296	GGC	2	6	406421	406426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933448
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10539	NC_005296	GAT	2	6	406610	406615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933448
10540	NC_005296	CAG	2	6	406631	406636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933448
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10543	NC_005296	CCGCG	2	10	406787	406796	0 %	0 %	40 %	60 %	39933448
10544	NC_005296	GCG	2	6	406803	406808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933448
10545	NC_005296	GCG	2	6	406840	406845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933448
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10548	NC_005296	TCT	2	6	407017	407022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_005296	TGC	2	6	407029	407034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_005296	GCA	2	6	407035	407040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_005296	CGAT	2	8	407072	407079	25 %	25 %	25 %	25 %	39933449
10552	NC_005296	GTCGCC	2	12	407151	407162	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933449
10553	NC_005296	CGG	2	6	407170	407175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933449
10554	NC_005296	CCGCG	2	10	407229	407238	0 %	0 %	40 %	60 %	39933449
10555	NC_005296	GTG	3	9	407386	407394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933449
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10557	NC_005296	TGC	2	6	407423	407428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933449
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10589	NC_005296	GC	3	6	408542	408547	0 %	0 %	50 %	50 %	39933451
10590	NC_005296	CGG	2	6	408568	408573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933451
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10603	NC_005296	CATC	2	8	409081	409088	25 %	25 %	0 %	50 %	39933451
10604	NC_005296	GC	3	6	409127	409132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_005296	AGCCG	2	10	409150	409159	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10606	NC_005296	CG	3	6	409172	409177	0 %	0 %	50 %	50 %	39933452
10607	NC_005296	CTT	2	6	409209	409214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933452
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10609	NC_005296	CTC	2	6	409254	409259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933452
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10613	NC_005296	CGC	2	6	409401	409406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10621	NC_005296	CG	3	6	409748	409753	0 %	0 %	50 %	50 %	39933453
10622	NC_005296	CGC	2	6	409812	409817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933453
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10989	NC_005296	ATC	2	6	425097	425102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933465
10990	NC_005296	CG	3	6	425118	425123	0 %	0 %	50 %	50 %	39933465
10991	NC_005296	GTG	2	6	425133	425138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933465
10992	NC_005296	GCC	2	6	425151	425156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
10993	NC_005296	CTGG	2	8	425159	425166	0 %	25 %	50 %	25 %	39933465
10994	NC_005296	TGC	2	6	425185	425190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933465
10995	NC_005296	CGC	2	6	425206	425211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933465
10996	NC_005296	GCA	2	6	425224	425229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933465
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10998	NC_005296	TGG	2	6	425266	425271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933465
10999	NC_005296	GCGCG	2	10	425354	425363	0 %	0 %	60 %	40 %	39933465
11000	NC_005296	GTG	3	9	425439	425447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933465

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