MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_005296	GCC	2	6	285960	285965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_005296	CGC	2	6	285991	285996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7503	NC_005296	CTT	2	6	286007	286012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_005296	TCA	2	6	286028	286033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_005296	CCG	2	6	286053	286058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7506	NC_005296	TGC	2	6	286126	286131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_005296	CGC	2	6	286147	286152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7508	NC_005296	GGC	2	6	286162	286167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_005296	CG	3	6	286274	286279	0 %	0 %	50 %	50 %	39933337
7510	NC_005296	T	6	6	286347	286352	0 %	100 %	0 %	0 %	39933337
7511	NC_005296	GTGC	2	8	286374	286381	0 %	25 %	50 %	25 %	39933337
7512	NC_005296	TCG	2	6	286423	286428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933337
7513	NC_005296	CGG	2	6	286468	286473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933337
7514	NC_005296	GCGG	2	8	286556	286563	0 %	0 %	75 %	25 %	39933337
7515	NC_005296	ACCG	2	8	286598	286605	25 %	0 %	25 %	50 %	39933337
7516	NC_005296	TGT	2	6	286711	286716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933337
7517	NC_005296	TGC	2	6	286750	286755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933337
7518	NC_005296	GCT	2	6	286808	286813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933337
7519	NC_005296	GGTT	2	8	286887	286894	0 %	50 %	50 %	0 %	39933337
7520	NC_005296	GC	3	6	286976	286981	0 %	0 %	50 %	50 %	39933337
7521	NC_005296	GGT	2	6	287006	287011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933337
7522	NC_005296	TCG	2	6	287056	287061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933337
7523	NC_005296	CGC	2	6	287069	287074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933337
7524	NC_005296	CGG	2	6	287140	287145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933337
7525	NC_005296	GATCT	2	10	287159	287168	20 %	40 %	20 %	20 %	39933337
7526	NC_005296	CCG	2	6	287169	287174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7527	NC_005296	GGC	2	6	287211	287216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_005296	CGTTG	2	10	287217	287226	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7529	NC_005296	CGAAA	2	10	287347	287356	60 %	0 %	20 %	20 %	39933338
7530	NC_005296	GAT	2	6	287380	287385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933338
7531	NC_005296	ACG	2	6	287391	287396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7532	NC_005296	CGATGC	2	12	287424	287435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7533	NC_005296	CAC	2	6	287485	287490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933338
7534	NC_005296	GAT	2	6	287500	287505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933338
7535	NC_005296	ACG	2	6	287555	287560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7536	NC_005296	TGC	2	6	287595	287600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7537	NC_005296	CGC	2	6	287670	287675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933338
7538	NC_005296	CGC	2	6	287692	287697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933338
7539	NC_005296	TCG	2	6	287721	287726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7540	NC_005296	TCGCG	2	10	287770	287779	0 %	20 %	40 %	40 %	39933338
7541	NC_005296	GTG	2	6	287807	287812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933338
7542	NC_005296	CTG	2	6	287823	287828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7543	NC_005296	CGC	2	6	287860	287865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933338
7544	NC_005296	GGC	2	6	287884	287889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933338
7545	NC_005296	CGC	2	6	287929	287934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933338
7546	NC_005296	GC	3	6	287958	287963	0 %	0 %	50 %	50 %	39933338
7547	NC_005296	CGA	2	6	288022	288027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7548	NC_005296	TGG	2	6	288048	288053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933338
7549	NC_005296	GCA	2	6	288105	288110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7550	NC_005296	GCCG	2	8	288116	288123	0 %	0 %	50 %	50 %	39933338
7551	NC_005296	GAT	2	6	288139	288144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933338
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7553	NC_005296	GTC	2	6	288172	288177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7554	NC_005296	GCG	2	6	288188	288193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933338
7555	NC_005296	CG	3	6	288192	288197	0 %	0 %	50 %	50 %	39933338
7556	NC_005296	CAC	2	6	288274	288279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933338
7557	NC_005296	AGC	2	6	288311	288316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933338
7558	NC_005296	CCG	2	6	288342	288347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933338
7559	NC_005296	GCG	2	6	288379	288384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933338
7560	NC_005296	CGG	2	6	288439	288444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_005296	CCG	2	6	288459	288464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933339
7562	NC_005296	GCC	2	6	288480	288485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933339
7563	NC_005296	TGGC	2	8	288495	288502	0 %	25 %	50 %	25 %	39933339
7564	NC_005296	CGGC	2	8	288571	288578	0 %	0 %	50 %	50 %	39933339
7565	NC_005296	CGC	2	6	288598	288603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933339
7566	NC_005296	CGC	2	6	288662	288667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933339
7567	NC_005296	GCC	2	6	288677	288682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933339
7568	NC_005296	CAGG	2	8	288722	288729	25 %	0 %	50 %	25 %	39933339
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7571	NC_005296	TCA	2	6	288829	288834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933339
7572	NC_005296	GAAT	2	8	288840	288847	50 %	25 %	25 %	0 %	39933339
7573	NC_005296	GCA	2	6	288922	288927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933339
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7575	NC_005296	CGT	2	6	288997	289002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933339
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7579	NC_005296	TCG	2	6	289149	289154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933339
7580	NC_005296	GCG	2	6	289213	289218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933339
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7582	NC_005296	GAA	2	6	289382	289387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933339
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7584	NC_005296	GGCA	2	8	289468	289475	25 %	0 %	50 %	25 %	39933339
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7589	NC_005296	CGC	2	6	289596	289601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933339
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7591	NC_005296	TCGAAA	2	12	289665	289676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	39933339
7592	NC_005296	GTCGAG	2	12	289694	289705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	39933339
7593	NC_005296	CG	3	6	289709	289714	0 %	0 %	50 %	50 %	39933339
7594	NC_005296	GTC	2	6	289736	289741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933339
7595	NC_005296	TGA	2	6	289754	289759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_005296	ATCC	2	8	289806	289813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7597	NC_005296	GGA	2	6	289835	289840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_005296	CG	3	6	289846	289851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7599	NC_005296	GAT	2	6	289871	289876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933340
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7601	NC_005296	CG	3	6	289900	289905	0 %	0 %	50 %	50 %	39933340
7602	NC_005296	GAA	2	6	289922	289927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933340
7603	NC_005296	CGA	2	6	289982	289987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933340
7604	NC_005296	CGTTGA	2	12	290128	290139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	39933340
7605	NC_005296	GTG	2	6	290148	290153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933340
7606	NC_005296	GCAG	2	8	290155	290162	25 %	0 %	50 %	25 %	39933340
7607	NC_005296	CCT	2	6	290179	290184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933340
7608	NC_005296	GCG	2	6	290207	290212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933340
7609	NC_005296	GGT	2	6	290249	290254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933340
7610	NC_005296	CTT	2	6	290485	290490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_005296	GC	3	6	290549	290554	0 %	0 %	50 %	50 %	39933341
7612	NC_005296	TGC	2	6	290563	290568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933341
7613	NC_005296	TGG	2	6	290569	290574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933341
7614	NC_005296	CGG	2	6	290593	290598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933341
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7617	NC_005296	ATC	2	6	290664	290669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933341
7618	NC_005296	CGCC	2	8	290714	290721	0 %	0 %	25 %	75 %	39933341
7619	NC_005296	GCT	3	9	290744	290752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933341
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7622	NC_005296	CCT	2	6	290890	290895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933341
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7995	NC_005296	GGC	2	6	305653	305658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933355
7996	NC_005296	GC	3	6	305657	305662	0 %	0 %	50 %	50 %	39933355
7997	NC_005296	AGC	2	6	305682	305687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933355
7998	NC_005296	CGA	2	6	305719	305724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933355
7999	NC_005296	GC	3	6	305763	305768	0 %	0 %	50 %	50 %	39933355
8000	NC_005296	CGT	2	6	305797	305802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933355

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