MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_005296	CGAT	2	8	248751	248758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6502	NC_005296	CCA	3	9	248835	248843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933300
6503	NC_005296	GACC	2	8	248848	248855	25 %	0 %	25 %	50 %	39933300
6504	NC_005296	ACC	2	6	248864	248869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933300
6505	NC_005296	CCG	2	6	248874	248879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933300
6506	NC_005296	GCG	2	6	248883	248888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933300
6507	NC_005296	CGC	3	9	248932	248940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933300
6508	NC_005296	GAT	2	6	248950	248955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933300
6509	NC_005296	CGC	2	6	248980	248985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933300
6510	NC_005296	CG	3	6	249009	249014	0 %	0 %	50 %	50 %	39933300
6511	NC_005296	CGG	2	6	249025	249030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933300
6512	NC_005296	CGG	3	9	249037	249045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933300
6513	NC_005296	CGC	2	6	249061	249066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933300
6514	NC_005296	CAA	2	6	249133	249138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933300
6515	NC_005296	GAC	2	6	249209	249214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933300
6516	NC_005296	TGC	2	6	249258	249263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933300
6517	NC_005296	CGG	2	6	249340	249345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933300
6518	NC_005296	CG	3	6	249355	249360	0 %	0 %	50 %	50 %	39933300
6519	NC_005296	TTC	2	6	249371	249376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933300
6520	NC_005296	TCG	2	6	249390	249395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933300
6521	NC_005296	CGC	2	6	249421	249426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933300
6522	NC_005296	GAT	2	6	249451	249456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933300
6523	NC_005296	GCT	2	6	249545	249550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_005296	CTC	2	6	249554	249559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_005296	TGC	2	6	249586	249591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6526	NC_005296	CTG	2	6	249603	249608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6527	NC_005296	AAG	2	6	249624	249629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933301
6528	NC_005296	CTG	2	6	249630	249635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6529	NC_005296	ACG	2	6	249640	249645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6530	NC_005296	CGG	2	6	249672	249677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933301
6531	NC_005296	CGG	2	6	249689	249694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933301
6532	NC_005296	GC	3	6	249706	249711	0 %	0 %	50 %	50 %	39933301
6533	NC_005296	GCT	2	6	249716	249721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6534	NC_005296	CGT	2	6	249734	249739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6535	NC_005296	GCT	2	6	249761	249766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6536	NC_005296	ACG	2	6	249787	249792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933301
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6538	NC_005296	AC	3	6	249820	249825	50 %	0 %	0 %	50 %	39933301
6539	NC_005296	CCGTTC	2	12	249861	249872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	39933301
6540	NC_005296	CTA	2	6	249878	249883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933301
6541	NC_005296	AAG	2	6	249954	249959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933301
6542	NC_005296	CGA	2	6	250130	250135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6543	NC_005296	ACTGC	2	10	250161	250170	20 %	20 %	20 %	40 %	39933301
6544	NC_005296	CGG	2	6	250199	250204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933301
6545	NC_005296	TGC	2	6	250210	250215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6546	NC_005296	CG	3	6	250216	250221	0 %	0 %	50 %	50 %	39933301
6547	NC_005296	CGT	2	6	250283	250288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933301
6548	NC_005296	GGC	2	6	250317	250322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933301
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6550	NC_005296	CG	3	6	250402	250407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_005296	GCTC	2	8	250467	250474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_005296	CAA	2	6	250521	250526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_005296	CGG	2	6	250576	250581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_005296	AC	3	6	250615	250620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_005296	TGA	2	6	250635	250640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933302
6556	NC_005296	TGT	2	6	250653	250658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933302
6557	NC_005296	GC	3	6	250665	250670	0 %	0 %	50 %	50 %	39933302
6558	NC_005296	CAC	2	6	250681	250686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933302
6559	NC_005296	GGC	2	6	250687	250692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933302
6560	NC_005296	GGC	2	6	250696	250701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933302
6561	NC_005296	GAA	2	6	250723	250728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933302
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6563	NC_005296	GCC	2	6	250810	250815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933302
6564	NC_005296	GCC	2	6	250858	250863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933302
6565	NC_005296	CGG	2	6	250872	250877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933302
6566	NC_005296	AAG	2	6	250901	250906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933302
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6569	NC_005296	CGT	2	6	250990	250995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933302
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6571	NC_005296	CGG	2	6	251047	251052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933302
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6573	NC_005296	CCG	2	6	251100	251105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933302
6574	NC_005296	GCG	2	6	251130	251135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933302
6575	NC_005296	CG	3	6	251186	251191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_005296	TCGC	2	8	251255	251262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_005296	ACT	2	6	251298	251303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933303
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6581	NC_005296	GCG	2	6	251459	251464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933303
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6585	NC_005296	GAT	2	6	251629	251634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933303
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6587	NC_005296	CGC	2	6	251649	251654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
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6589	NC_005296	CCG	3	9	251744	251752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
6590	NC_005296	ACC	3	9	251831	251839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933303
6591	NC_005296	CGGCG	2	10	251854	251863	0 %	0 %	60 %	40 %	39933303
6592	NC_005296	GCC	3	9	251866	251874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
6593	NC_005296	CAG	2	6	251902	251907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933303
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6595	NC_005296	CCAG	2	8	251946	251953	25 %	0 %	25 %	50 %	39933303
6596	NC_005296	CCA	2	6	251959	251964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933303
6597	NC_005296	GCCG	2	8	251974	251981	0 %	0 %	50 %	50 %	39933303
6598	NC_005296	GCA	2	6	251985	251990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933303
6599	NC_005296	CGA	2	6	252010	252015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933303
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6602	NC_005296	CCG	2	6	252107	252112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
6603	NC_005296	GCGCC	2	10	252126	252135	0 %	0 %	40 %	60 %	39933303
6604	NC_005296	GCC	2	6	252155	252160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
6605	NC_005296	GC	3	6	252186	252191	0 %	0 %	50 %	50 %	39933303
6606	NC_005296	CGC	2	6	252238	252243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
6607	NC_005296	GC	3	6	252279	252284	0 %	0 %	50 %	50 %	39933303
6608	NC_005296	CGC	2	6	252298	252303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
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6610	NC_005296	GCA	3	9	252366	252374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933303
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6612	NC_005296	GC	3	6	252439	252444	0 %	0 %	50 %	50 %	39933303
6613	NC_005296	GCC	2	6	252458	252463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933303
6614	NC_005296	GCG	2	6	252544	252549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_005296	TTC	2	6	252608	252613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_005296	CATC	2	8	252639	252646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_005296	CTT	2	6	252725	252730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933304
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6621	NC_005296	CCA	2	6	252882	252887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933304
6622	NC_005296	TGGCGC	2	12	252888	252899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933304
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6872	NC_005296	CGT	2	6	263337	263342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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