MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia eutropha H16 megaplasmid pHG1

Total Repeats: 9889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005241	TCGC	2	8	184865	184872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_005241	GC	3	6	184920	184925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_005241	CTG	2	6	185070	185075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_005241	CTTT	2	8	185119	185126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_005241	ACC	2	6	185137	185142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_005241	CGA	2	6	185167	185172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_005241	TGG	2	6	185205	185210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_005241	TGC	2	6	185447	185452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_005241	CCG	2	6	185560	185565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_005241	G	6	6	185687	185692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_005241	CATA	2	8	185731	185738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_005241	AC	3	6	185746	185751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_005241	ATG	2	6	185760	185765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_005241	AGC	2	6	185799	185804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_005241	CGC	2	6	185890	185895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_005241	CCCAA	2	10	185912	185921	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4017	NC_005241	TTC	2	6	185928	185933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_005241	TCG	2	6	185943	185948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_005241	CTC	2	6	185965	185970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_005241	CGGC	2	8	186228	186235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_005241	CCG	2	6	186238	186243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_005241	AGC	2	6	186275	186280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_005241	GGAA	2	8	186391	186398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_005241	TGC	2	6	186412	186417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_005241	TAT	2	6	186449	186454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_005241	CGC	2	6	186754	186759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637835
4027	NC_005241	GGCA	2	8	186760	186767	25 %	0 %	50 %	25 %	38637835
4028	NC_005241	TCG	2	6	186791	186796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637836
4029	NC_005241	CGC	2	6	186806	186811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637836
4030	NC_005241	GGCCGA	2	12	186813	186824	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	38637836
4031	NC_005241	CGCGC	2	10	186863	186872	0 %	0 %	40 %	60 %	38637836
4032	NC_005241	TCGC	2	8	186910	186917	0 %	25 %	25 %	50 %	38637836
4033	NC_005241	TCT	2	6	186998	187003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637836
4034	NC_005241	GTG	2	6	187009	187014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637836
4035	NC_005241	TGC	2	6	187040	187045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637836
4036	NC_005241	GCT	2	6	187077	187082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637836
4037	NC_005241	CGG	2	6	187111	187116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_005241	CGA	2	6	187149	187154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_005241	G	6	6	187276	187281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_005241	GTCG	2	8	187307	187314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_005241	GCA	2	6	187363	187368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637837
4042	NC_005241	GCG	2	6	187381	187386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637837
4043	NC_005241	CTT	2	6	187412	187417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637837
4044	NC_005241	AGA	2	6	187430	187435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637837
4045	NC_005241	GTCC	2	8	187496	187503	0 %	25 %	25 %	50 %	38637837
4046	NC_005241	TCA	2	6	187574	187579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637837
4047	NC_005241	TTGT	2	8	187732	187739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_005241	TCG	2	6	187775	187780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_005241	GCT	2	6	187822	187827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_005241	GAG	2	6	187843	187848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_005241	GAG	2	6	187879	187884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_005241	ATG	2	6	187894	187899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_005241	GCG	2	6	188057	188062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_005241	CAAT	2	8	188076	188083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_005241	TCATGA	2	12	188088	188099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4056	NC_005241	ATTG	2	8	188104	188111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_005241	GCC	2	6	188208	188213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_005241	TCTG	2	8	188275	188282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_005241	CGG	2	6	188286	188291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_005241	ACC	2	6	188310	188315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_005241	GC	3	6	188475	188480	0 %	0 %	50 %	50 %	38637838
4062	NC_005241	GAA	2	6	188499	188504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637838
4063	NC_005241	TTC	2	6	188505	188510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637838
4064	NC_005241	CAA	2	6	188543	188548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637838
4065	NC_005241	GTTC	2	8	188579	188586	0 %	50 %	25 %	25 %	38637838
4066	NC_005241	GTC	2	6	188625	188630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637838
4067	NC_005241	CCT	2	6	188636	188641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38637838
4068	NC_005241	TCG	2	6	188758	188763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637838
4069	NC_005241	ATG	3	9	188865	188873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_005241	ACCG	2	8	188922	188929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_005241	ACG	2	6	188984	188989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_005241	TTG	2	6	189060	189065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38637839
4073	NC_005241	CAA	2	6	189114	189119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637839
4074	NC_005241	TGA	2	6	189163	189168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637839
4075	NC_005241	CTT	2	6	189169	189174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637839
4076	NC_005241	TTA	2	6	189185	189190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38637839
4077	NC_005241	TCC	2	6	189191	189196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38637839
4078	NC_005241	TTCGCA	2	12	189203	189214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38637839
4079	NC_005241	CTT	2	6	189253	189258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637839
4080	NC_005241	CAG	2	6	189297	189302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637839
4081	NC_005241	CGG	2	6	189307	189312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637839
4082	NC_005241	CCA	2	6	189351	189356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637839
4083	NC_005241	CGT	2	6	189360	189365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637839
4084	NC_005241	TGG	2	6	189378	189383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637839
4085	NC_005241	GCCT	2	8	189419	189426	0 %	25 %	25 %	50 %	38637839
4086	NC_005241	CG	3	6	189488	189493	0 %	0 %	50 %	50 %	38637839
4087	NC_005241	GCA	2	6	189512	189517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637839
4088	NC_005241	CAACTG	2	12	189548	189559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38637839
4089	NC_005241	ATCGA	2	10	189656	189665	40 %	20 %	20 %	20 %	38637839
4090	NC_005241	TCGC	2	8	189690	189697	0 %	25 %	25 %	50 %	38637839
4091	NC_005241	GC	3	6	189762	189767	0 %	0 %	50 %	50 %	38637839
4092	NC_005241	CG	3	6	189828	189833	0 %	0 %	50 %	50 %	38637839
4093	NC_005241	CTT	2	6	189949	189954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_005241	CGG	2	6	189963	189968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_005241	CTT	2	6	189979	189984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_005241	CGTAAC	2	12	190023	190034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_005241	GCC	2	6	190141	190146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4098	NC_005241	TGC	2	6	190169	190174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637840
4099	NC_005241	TCC	2	6	190245	190250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38637840
4100	NC_005241	CCG	2	6	190293	190298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4101	NC_005241	CCA	2	6	190303	190308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637840
4102	NC_005241	CGG	2	6	190335	190340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637840
4103	NC_005241	GAA	2	6	190381	190386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637840
4104	NC_005241	GCC	2	6	190447	190452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4105	NC_005241	GCC	2	6	190496	190501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4106	NC_005241	GGC	2	6	190555	190560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637840
4107	NC_005241	GGCG	2	8	190584	190591	0 %	0 %	75 %	25 %	38637840
4108	NC_005241	GGC	2	6	190618	190623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637840
4109	NC_005241	GAT	2	6	190644	190649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637840
4110	NC_005241	GCC	2	6	190760	190765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4111	NC_005241	GTC	2	6	190816	190821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637840
4112	NC_005241	GGC	2	6	190845	190850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637840
4113	NC_005241	GCC	2	6	190908	190913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4114	NC_005241	GGGT	2	8	190955	190962	0 %	25 %	75 %	0 %	38637840
4115	NC_005241	GCT	2	6	191043	191048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637840
4116	NC_005241	T	6	6	191078	191083	0 %	100 %	0 %	0 %	38637840
4117	NC_005241	TCG	2	6	191096	191101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637840
4118	NC_005241	GAA	2	6	191145	191150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637840
4119	NC_005241	GC	3	6	191151	191156	0 %	0 %	50 %	50 %	38637840
4120	NC_005241	TGA	2	6	191166	191171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637840
4121	NC_005241	GCC	2	6	191285	191290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637840
4122	NC_005241	CAG	2	6	191299	191304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637840
4123	NC_005241	CAG	2	6	191320	191325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637840
4124	NC_005241	ATC	2	6	191404	191409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637840
4125	NC_005241	ACC	2	6	191451	191456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637840
4126	NC_005241	CAGC	2	8	191556	191563	25 %	0 %	25 %	50 %	38637840
4127	NC_005241	CAA	2	6	191574	191579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637840
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4152	NC_005241	TGCC	2	8	192903	192910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_005241	TGC	2	6	192911	192916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4156	NC_005241	GCC	2	6	193080	193085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4158	NC_005241	CG	3	6	193246	193251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4159	NC_005241	GCCG	2	8	193285	193292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4220	NC_005241	GCG	2	6	196539	196544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4234	NC_005241	GTGC	2	8	197525	197532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4235	NC_005241	AGCG	2	8	197537	197544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4236	NC_005241	ATT	2	6	197603	197608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_005241	GCC	2	6	197688	197693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4238	NC_005241	GCC	2	6	197729	197734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4239	NC_005241	CAG	2	6	197867	197872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4240	NC_005241	CGAT	2	8	197899	197906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4241	NC_005241	CAC	2	6	198050	198055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4242	NC_005241	ACCA	2	8	198178	198185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_005241	GCC	2	6	198187	198192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4244	NC_005241	CTA	2	6	198237	198242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4245	NC_005241	GCC	2	6	198263	198268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_005241	GCT	2	6	198272	198277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_005241	ACA	2	6	198322	198327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_005241	GTG	2	6	198329	198334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_005241	GC	4	8	198395	198402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4250	NC_005241	AG	3	6	198418	198423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_005241	T	7	7	198426	198432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_005241	GTGC	2	8	198444	198451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4253	NC_005241	A	6	6	198459	198464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_005241	GGC	2	6	198554	198559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_005241	CAA	2	6	198576	198581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_005241	CG	3	6	198636	198641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_005241	GCA	2	6	198649	198654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4260	NC_005241	GC	3	6	198785	198790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4263	NC_005241	TCG	2	6	198900	198905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4270	NC_005241	GTC	2	6	199215	199220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4362	NC_005241	TC	3	6	203873	203878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4363	NC_005241	CGAG	2	8	203945	203952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4364	NC_005241	GC	3	6	204037	204042	0 %	0 %	50 %	50 %	38637849
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4377	NC_005241	CGT	2	6	204465	204470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637849
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4379	NC_005241	GCA	2	6	204570	204575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637849
4380	NC_005241	GAC	2	6	204652	204657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637849
4381	NC_005241	TCCGGA	2	12	204744	204755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	38637849
4382	NC_005241	CGGGCT	5	30	204771	204800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	38637849
4383	NC_005241	GTG	2	6	204916	204921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_005241	TGCC	2	8	204931	204938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_005241	CGT	2	6	204943	204948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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