MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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131002	NC_005027	TTGGGC	2	12	6611640	6611651	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	32477428
131003	NC_005027	CGAC	2	8	6611681	6611688	25 %	0 %	25 %	50 %	32477428
131004	NC_005027	CGT	2	6	6611714	6611719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131005	NC_005027	CGG	2	6	6611720	6611725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477428
131006	NC_005027	TGG	2	6	6611753	6611758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477428
131007	NC_005027	CGAT	2	8	6611802	6611809	25 %	25 %	25 %	25 %	32477428
131008	NC_005027	ATG	2	6	6611824	6611829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477428
131009	NC_005027	CGC	2	6	6611847	6611852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477428
131010	NC_005027	ACCA	2	8	6611853	6611860	50 %	0 %	0 %	50 %	32477428
131011	NC_005027	CGA	2	6	6611870	6611875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131012	NC_005027	GTT	2	6	6611886	6611891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477428
131013	NC_005027	CGG	2	6	6611903	6611908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477428
131014	NC_005027	CGA	2	6	6612053	6612058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131015	NC_005027	CAA	2	6	6612090	6612095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477428
131016	NC_005027	GAC	2	6	6612105	6612110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131017	NC_005027	GAT	2	6	6612241	6612246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477428
131018	NC_005027	CAAC	2	8	6612268	6612275	50 %	0 %	0 %	50 %	32477428
131019	NC_005027	CAG	2	6	6612276	6612281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131020	NC_005027	CGA	2	6	6612365	6612370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131021	NC_005027	CCAG	2	8	6612391	6612398	25 %	0 %	25 %	50 %	32477428
131022	NC_005027	CGA	2	6	6612462	6612467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477428
131023	NC_005027	CGG	2	6	6612485	6612490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477428
131024	NC_005027	TCA	2	6	6612503	6612508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477428
131025	NC_005027	T	6	6	6612599	6612604	0 %	100 %	0 %	0 %	32477429
131026	NC_005027	GCC	2	6	6612641	6612646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477429
131027	NC_005027	GAT	2	6	6612725	6612730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477429
131028	NC_005027	GT	3	6	6612781	6612786	0 %	50 %	50 %	0 %	32477429
131029	NC_005027	TGA	2	6	6612955	6612960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477430
131030	NC_005027	CGG	2	6	6612961	6612966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477430
131031	NC_005027	TCAA	2	8	6613029	6613036	50 %	25 %	0 %	25 %	32477430
131032	NC_005027	GTT	2	6	6613046	6613051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477430
131033	NC_005027	TCGC	2	8	6613062	6613069	0 %	25 %	25 %	50 %	32477430
131034	NC_005027	GAT	2	6	6613106	6613111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477430
131035	NC_005027	CGA	2	6	6613129	6613134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477430
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131037	NC_005027	CGA	3	9	6613186	6613194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477430
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131042	NC_005027	TCCT	2	8	6613310	6613317	0 %	50 %	0 %	50 %	32477430
131043	NC_005027	CGA	2	6	6613396	6613401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477430
131044	NC_005027	CGA	2	6	6613432	6613437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477430
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131049	NC_005027	GCA	2	6	6613822	6613827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477430
131050	NC_005027	TCA	2	6	6613896	6613901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477430
131051	NC_005027	CTT	2	6	6613964	6613969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477430
131052	NC_005027	CTCGC	2	10	6613995	6614004	0 %	20 %	20 %	60 %	32477430
131053	NC_005027	GT	3	6	6614052	6614057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131054	NC_005027	CAGC	2	8	6614063	6614070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131055	NC_005027	ATC	2	6	6614086	6614091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131056	NC_005027	AC	3	6	6614130	6614135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131057	NC_005027	CGTG	2	8	6614139	6614146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131058	NC_005027	ACG	2	6	6614161	6614166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131059	NC_005027	CGT	2	6	6614442	6614447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477431
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131061	NC_005027	TGC	2	6	6614532	6614537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477432
131062	NC_005027	TCG	2	6	6614722	6614727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477432
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131064	NC_005027	TGT	2	6	6614804	6614809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477432
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131068	NC_005027	TG	3	6	6614882	6614887	0 %	50 %	50 %	0 %	32477432
131069	NC_005027	TCC	2	6	6614901	6614906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32477432
131070	NC_005027	CGG	2	6	6614939	6614944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477432
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131073	NC_005027	TCGA	2	8	6615108	6615115	25 %	25 %	25 %	25 %	32477432
131074	NC_005027	CA	3	6	6615203	6615208	50 %	0 %	0 %	50 %	32477432
131075	NC_005027	TCT	2	6	6615211	6615216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477432
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131077	NC_005027	GTTT	2	8	6615314	6615321	0 %	75 %	25 %	0 %	32477432
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131082	NC_005027	GCG	2	6	6615498	6615503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131083	NC_005027	GGC	2	6	6615540	6615545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131084	NC_005027	CTT	2	6	6615577	6615582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131085	NC_005027	GAA	2	6	6615634	6615639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477433
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131087	NC_005027	CGG	2	6	6615722	6615727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477433
131088	NC_005027	GGT	2	6	6615796	6615801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477433
131089	NC_005027	CCGT	2	8	6615876	6615883	0 %	25 %	25 %	50 %	32477433
131090	NC_005027	ACA	2	6	6615887	6615892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477433
131091	NC_005027	CCGG	2	8	6615915	6615922	0 %	0 %	50 %	50 %	32477433
131092	NC_005027	CTGG	2	8	6615932	6615939	0 %	25 %	50 %	25 %	32477433
131093	NC_005027	GATGCC	2	12	6615949	6615960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	32477433
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131095	NC_005027	GCGG	2	8	6616012	6616019	0 %	0 %	75 %	25 %	32477433
131096	NC_005027	CATT	2	8	6616138	6616145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131097	NC_005027	ATC	2	6	6616161	6616166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131098	NC_005027	CATCCC	2	12	6616181	6616192	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131099	NC_005027	AC	3	6	6616308	6616313	50 %	0 %	0 %	50 %	32477434
131100	NC_005027	TCGAC	2	10	6616336	6616345	20 %	20 %	20 %	40 %	32477434
131101	NC_005027	GTG	2	6	6616478	6616483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477434
131102	NC_005027	CGG	2	6	6616489	6616494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477434
131103	NC_005027	TGGGCA	2	12	6616500	6616511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	32477434
131104	NC_005027	CGA	2	6	6616573	6616578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477434
131105	NC_005027	CGA	2	6	6616585	6616590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477434
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131107	NC_005027	ACAA	2	8	6616680	6616687	75 %	0 %	0 %	25 %	32477434
131108	NC_005027	GGC	2	6	6616690	6616695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477434
131109	NC_005027	CAA	2	6	6616750	6616755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477434
131110	NC_005027	GAC	2	6	6616784	6616789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131111	NC_005027	CCG	2	6	6616793	6616798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131112	NC_005027	CGG	2	6	6616814	6616819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131113	NC_005027	AGCAG	2	10	6616902	6616911	40 %	0 %	40 %	20 %	32477435
131114	NC_005027	CTCG	2	8	6617004	6617011	0 %	25 %	25 %	50 %	32477435
131115	NC_005027	GAT	2	6	6617024	6617029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477435
131116	NC_005027	CAG	2	6	6617035	6617040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477435
131117	NC_005027	CGC	2	6	6617058	6617063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477435
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131119	NC_005027	CCG	2	6	6617219	6617224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477435
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131129	NC_005027	TTG	2	6	6617767	6617772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477435
131130	NC_005027	CAT	2	6	6617796	6617801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477435
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131225	NC_005027	GA	3	6	6622662	6622667	50 %	0 %	50 %	0 %	32477437
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131227	NC_005027	TTGGAA	2	12	6622737	6622748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477438
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131230	NC_005027	CACG	2	8	6622883	6622890	25 %	0 %	25 %	50 %	32477438
131231	NC_005027	CGT	2	6	6623031	6623036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477439
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