MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
129501	NC_005027	TTGCT	2	10	6539100	6539109	0 %	60 %	20 %	20 %	32477331
129502	NC_005027	GACT	2	8	6539127	6539134	25 %	25 %	25 %	25 %	32477331
129503	NC_005027	TGC	2	6	6539196	6539201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129504	NC_005027	CAGC	2	8	6539232	6539239	25 %	0 %	25 %	50 %	32477331
129505	NC_005027	ACG	2	6	6539357	6539362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129506	NC_005027	GTC	2	6	6539365	6539370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129507	NC_005027	GAT	2	6	6539410	6539415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477331
129508	NC_005027	TTC	2	6	6539419	6539424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477331
129509	NC_005027	GTC	2	6	6539482	6539487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129510	NC_005027	TGT	2	6	6539490	6539495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477331
129511	NC_005027	GCC	2	6	6539515	6539520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477331
129512	NC_005027	ACG	2	6	6539540	6539545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129513	NC_005027	TTC	2	6	6539659	6539664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477331
129514	NC_005027	TTGGCG	2	12	6539681	6539692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	32477331
129515	NC_005027	GCA	2	6	6539781	6539786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129516	NC_005027	CGA	2	6	6539820	6539825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129517	NC_005027	CGG	2	6	6539859	6539864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477331
129518	NC_005027	GGTC	2	8	6539871	6539878	0 %	25 %	50 %	25 %	32477331
129519	NC_005027	TCG	2	6	6539883	6539888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129520	NC_005027	CTT	2	6	6539922	6539927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477331
129521	NC_005027	AGT	2	6	6539958	6539963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477331
129522	NC_005027	TCT	2	6	6540015	6540020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477331
129523	NC_005027	GTC	2	6	6540025	6540030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477331
129524	NC_005027	CGA	2	6	6540125	6540130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477332
129525	NC_005027	GGATC	2	10	6540190	6540199	20 %	20 %	40 %	20 %	32477332
129526	NC_005027	GGC	2	6	6540252	6540257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477332
129527	NC_005027	TCG	2	6	6540262	6540267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129528	NC_005027	GAT	2	6	6540290	6540295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477333
129529	NC_005027	G	6	6	6540331	6540336	0 %	0 %	100 %	0 %	32477333
129530	NC_005027	CGA	3	9	6540421	6540429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477333
129531	NC_005027	TCC	2	6	6540467	6540472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32477333
129532	NC_005027	TCC	2	6	6540498	6540503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32477333
129533	NC_005027	ATC	2	6	6540576	6540581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477333
129534	NC_005027	CGC	2	6	6540598	6540603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477333
129535	NC_005027	GGC	2	6	6540627	6540632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477333
129536	NC_005027	TGG	2	6	6540673	6540678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477333
129537	NC_005027	TCG	2	6	6540688	6540693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477333
129538	NC_005027	GCGA	2	8	6540727	6540734	25 %	0 %	50 %	25 %	32477333
129539	NC_005027	TCG	2	6	6540749	6540754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477333
129540	NC_005027	CTTT	2	8	6540781	6540788	0 %	75 %	0 %	25 %	32477333
129541	NC_005027	CCG	2	6	6540865	6540870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477333
129542	NC_005027	GTG	2	6	6540917	6540922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477333
129543	NC_005027	CCAA	2	8	6540937	6540944	50 %	0 %	0 %	50 %	32477333
129544	NC_005027	TCGC	2	8	6541000	6541007	0 %	25 %	25 %	50 %	32477333
129545	NC_005027	ATC	2	6	6541106	6541111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477333
129546	NC_005027	TGGAT	2	10	6541120	6541129	20 %	40 %	40 %	0 %	32477333
129547	NC_005027	TCC	2	6	6541158	6541163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32477333
129548	NC_005027	CAGC	2	8	6541235	6541242	25 %	0 %	25 %	50 %	32477333
129549	NC_005027	TC	3	6	6541258	6541263	0 %	50 %	0 %	50 %	32477333
129550	NC_005027	CGC	2	6	6541264	6541269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477333
129551	NC_005027	CCG	2	6	6541279	6541284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477333
129552	NC_005027	ATCG	2	8	6541328	6541335	25 %	25 %	25 %	25 %	32477333
129553	NC_005027	TTC	2	6	6541434	6541439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477334
129554	NC_005027	TCTT	2	8	6541449	6541456	0 %	75 %	0 %	25 %	32477334
129555	NC_005027	TGC	2	6	6541492	6541497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477334
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129557	NC_005027	CCG	2	6	6541544	6541549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477334
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129559	NC_005027	GGC	2	6	6541579	6541584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477334
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129561	NC_005027	TCAA	3	12	6541722	6541733	50 %	25 %	0 %	25 %	32477334
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129563	NC_005027	CTT	2	6	6541786	6541791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477334
129564	NC_005027	GGAACG	2	12	6541822	6541833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	32477335
129565	NC_005027	CGTTG	2	10	6541871	6541880	0 %	40 %	40 %	20 %	32477335
129566	NC_005027	ACG	2	6	6541908	6541913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477335
129567	NC_005027	CGTG	2	8	6541939	6541946	0 %	25 %	50 %	25 %	32477335
129568	NC_005027	GCC	2	6	6541949	6541954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477335
129569	NC_005027	ACC	2	6	6541961	6541966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477335
129570	NC_005027	CGT	2	6	6542045	6542050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477335
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129572	NC_005027	TCT	2	6	6542164	6542169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477335
129573	NC_005027	GCGA	2	8	6542261	6542268	25 %	0 %	50 %	25 %	32477335
129574	NC_005027	TTG	2	6	6542378	6542383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477335
129575	NC_005027	GTC	2	6	6542391	6542396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477335
129576	NC_005027	TGC	2	6	6542418	6542423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477335
129577	NC_005027	AG	3	6	6542587	6542592	50 %	0 %	50 %	0 %	32477335
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129583	NC_005027	CGA	2	6	6543139	6543144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477335
129584	NC_005027	TGC	2	6	6543183	6543188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477335
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129588	NC_005027	CGT	2	6	6543629	6543634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477336
129589	NC_005027	GAA	2	6	6543644	6543649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477336
129590	NC_005027	TTCA	2	8	6543656	6543663	25 %	50 %	0 %	25 %	32477336
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129598	NC_005027	CGAT	2	8	6544033	6544040	25 %	25 %	25 %	25 %	32477336
129599	NC_005027	CTG	2	6	6544043	6544048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477336
129600	NC_005027	CCAG	2	8	6544094	6544101	25 %	0 %	25 %	50 %	32477336
129601	NC_005027	TGC	2	6	6544209	6544214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477336
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129603	NC_005027	CCA	2	6	6544261	6544266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477336
129604	NC_005027	TCG	2	6	6544308	6544313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477336
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129606	NC_005027	GAC	2	6	6544355	6544360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477336
129607	NC_005027	GCTC	2	8	6544416	6544423	0 %	25 %	25 %	50 %	32477336
129608	NC_005027	TCA	2	6	6544426	6544431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477336
129609	NC_005027	TTGC	2	8	6544514	6544521	0 %	50 %	25 %	25 %	32477336
129610	NC_005027	CCCTC	2	10	6544549	6544558	0 %	20 %	0 %	80 %	32477336
129611	NC_005027	AGGG	2	8	6544579	6544586	25 %	0 %	75 %	0 %	32477336
129612	NC_005027	TTGT	2	8	6544610	6544617	0 %	75 %	25 %	0 %	32477336
129613	NC_005027	GCGA	2	8	6544661	6544668	25 %	0 %	50 %	25 %	32477336
129614	NC_005027	TTC	2	6	6544703	6544708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477336
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129616	NC_005027	GTT	2	6	6544793	6544798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477336
129617	NC_005027	GAA	2	6	6544799	6544804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477336
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129647	NC_005027	GCC	2	6	6546284	6546289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477337
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129690	NC_005027	AAG	2	6	6548274	6548279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477337
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129695	NC_005027	GCA	2	6	6548455	6548460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477338
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129702	NC_005027	TCG	2	6	6548796	6548801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477340
129703	NC_005027	AAGC	2	8	6548819	6548826	50 %	0 %	25 %	25 %	32477340
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129712	NC_005027	GGCA	2	8	6549110	6549117	25 %	0 %	50 %	25 %	32477340
129713	NC_005027	CGCCTT	2	12	6549130	6549141	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	32477340
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129715	NC_005027	CGT	2	6	6549189	6549194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477340
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129719	NC_005027	CAC	2	6	6549409	6549414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477340
129720	NC_005027	CGA	2	6	6549451	6549456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477340
129721	NC_005027	CGG	2	6	6549496	6549501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477340
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129723	NC_005027	GACCAC	2	12	6549533	6549544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	32477340
129724	NC_005027	ATTTG	2	10	6549628	6549637	20 %	60 %	20 %	0 %	32477340
129725	NC_005027	GTC	2	6	6549707	6549712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477340
129726	NC_005027	CAG	2	6	6549863	6549868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477340
129727	NC_005027	TGG	2	6	6549880	6549885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477340
129728	NC_005027	GGCC	2	8	6549904	6549911	0 %	0 %	50 %	50 %	32477340
129729	NC_005027	GGC	2	6	6549938	6549943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477340
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129731	NC_005027	CGG	2	6	6549960	6549965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477340
129732	NC_005027	GCT	2	6	6549974	6549979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477340
129733	NC_005027	TCAA	2	8	6550002	6550009	50 %	25 %	0 %	25 %	32477340
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129735	NC_005027	CGG	2	6	6550057	6550062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477340
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129738	NC_005027	ACC	2	6	6550225	6550230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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