MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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127002	NC_005027	CTG	2	6	6412831	6412836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477223
127003	NC_005027	GGCG	2	8	6412905	6412912	0 %	0 %	75 %	25 %	32477223
127004	NC_005027	TCGCG	2	10	6412936	6412945	0 %	20 %	40 %	40 %	32477223
127005	NC_005027	AG	3	6	6412948	6412953	50 %	0 %	50 %	0 %	32477223
127006	NC_005027	TGG	2	6	6413022	6413027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477223
127007	NC_005027	CGAT	2	8	6413042	6413049	25 %	25 %	25 %	25 %	32477223
127008	NC_005027	GAA	2	6	6413091	6413096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477224
127009	NC_005027	GGC	2	6	6413175	6413180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477224
127010	NC_005027	GTT	2	6	6413229	6413234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477224
127011	NC_005027	GTT	2	6	6413315	6413320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477224
127012	NC_005027	GTT	2	6	6413396	6413401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477224
127013	NC_005027	TCGAT	2	10	6413410	6413419	20 %	40 %	20 %	20 %	32477224
127014	NC_005027	TCG	2	6	6413468	6413473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477224
127015	NC_005027	ATG	2	6	6413484	6413489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477224
127016	NC_005027	GTG	2	6	6413508	6413513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477224
127017	NC_005027	GTCG	2	8	6413519	6413526	0 %	25 %	50 %	25 %	32477224
127018	NC_005027	TGG	2	6	6413528	6413533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477224
127019	NC_005027	GCC	2	6	6413643	6413648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477224
127020	NC_005027	CGC	2	6	6413729	6413734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477224
127021	NC_005027	ACC	2	6	6413742	6413747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477224
127022	NC_005027	TCGAG	2	10	6413823	6413832	20 %	20 %	40 %	20 %	32477224
127023	NC_005027	CAG	2	6	6413905	6413910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477224
127024	NC_005027	GTG	2	6	6414034	6414039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477224
127025	NC_005027	CGA	2	6	6414085	6414090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477224
127026	NC_005027	GAT	2	6	6414108	6414113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477224
127027	NC_005027	ATCG	2	8	6414170	6414177	25 %	25 %	25 %	25 %	32477224
127028	NC_005027	TGA	2	6	6414181	6414186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477224
127029	NC_005027	CGG	2	6	6414218	6414223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477224
127030	NC_005027	CGC	2	6	6414334	6414339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477224
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127032	NC_005027	GAG	2	6	6414423	6414428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32477224
127033	NC_005027	TTG	2	6	6414441	6414446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477224
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127035	NC_005027	TTC	2	6	6414546	6414551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477224
127036	NC_005027	TTCA	2	8	6414618	6414625	25 %	50 %	0 %	25 %	32477224
127037	NC_005027	GTT	2	6	6414650	6414655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477224
127038	NC_005027	TAC	2	6	6414792	6414797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477224
127039	NC_005027	GTCGA	2	10	6414825	6414834	20 %	20 %	40 %	20 %	32477224
127040	NC_005027	TC	3	6	6414851	6414856	0 %	50 %	0 %	50 %	32477224
127041	NC_005027	GCA	2	6	6414860	6414865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477224
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127047	NC_005027	TTG	2	6	6415020	6415025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477224
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127055	NC_005027	CTG	2	6	6415713	6415718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477226
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127061	NC_005027	CGGG	2	8	6415896	6415903	0 %	0 %	75 %	25 %	32477226
127062	NC_005027	TCCA	2	8	6415959	6415966	25 %	25 %	0 %	50 %	32477226
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127083	NC_005027	CTG	2	6	6416984	6416989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477226
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127106	NC_005027	GCA	2	6	6418146	6418151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477227
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127108	NC_005027	ACG	2	6	6418293	6418298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477227
127109	NC_005027	CAAAA	2	10	6418342	6418351	80 %	0 %	0 %	20 %	32477227
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127113	NC_005027	TG	3	6	6418755	6418760	0 %	50 %	50 %	0 %	32477228
127114	NC_005027	CGTC	2	8	6418803	6418810	0 %	25 %	25 %	50 %	32477228
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127116	NC_005027	CAT	2	6	6418909	6418914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477228
127117	NC_005027	GTA	2	6	6418948	6418953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477228
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127121	NC_005027	CTT	2	6	6419061	6419066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477229
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127134	NC_005027	CCGA	2	8	6419671	6419678	25 %	0 %	25 %	50 %	32477229
127135	NC_005027	GTGA	2	8	6419719	6419726	25 %	25 %	50 %	0 %	32477229
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127140	NC_005027	GCCA	2	8	6419903	6419910	25 %	0 %	25 %	50 %	32477230
127141	NC_005027	G	6	6	6419926	6419931	0 %	0 %	100 %	0 %	32477230
127142	NC_005027	TGG	2	6	6419965	6419970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477230
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127144	NC_005027	TTG	2	6	6420120	6420125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477231
127145	NC_005027	TGC	2	6	6420148	6420153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477231
127146	NC_005027	CTG	2	6	6420185	6420190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477231
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127233	NC_005027	GTC	3	9	6424596	6424604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477235
127234	NC_005027	CAA	2	6	6424674	6424679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477235
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127331	NC_005027	TCG	2	6	6429635	6429640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477241
127332	NC_005027	GTTC	2	8	6429783	6429790	0 %	50 %	25 %	25 %	32477241
127333	NC_005027	CCAT	2	8	6429815	6429822	25 %	25 %	0 %	50 %	32477241
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127336	NC_005027	GACT	2	8	6430084	6430091	25 %	25 %	25 %	25 %	32477242
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127339	NC_005027	CA	3	6	6430261	6430266	50 %	0 %	0 %	50 %	32477242
127340	NC_005027	AGCGA	2	10	6430311	6430320	40 %	0 %	40 %	20 %	32477242
127341	NC_005027	GC	3	6	6430340	6430345	0 %	0 %	50 %	50 %	32477242
127342	NC_005027	GCC	2	6	6430366	6430371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477242
127343	NC_005027	TCGT	2	8	6430506	6430513	0 %	50 %	25 %	25 %	32477242
127344	NC_005027	TGA	2	6	6430514	6430519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477242
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127347	NC_005027	CCG	2	6	6430872	6430877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477243
127348	NC_005027	GCG	2	6	6430904	6430909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477243
127349	NC_005027	TGGC	2	8	6430944	6430951	0 %	25 %	50 %	25 %	32477243
127350	NC_005027	TCT	2	6	6431016	6431021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477243
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127352	NC_005027	GCA	2	6	6431098	6431103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477243
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127354	NC_005027	T	6	6	6431243	6431248	0 %	100 %	0 %	0 %	32477243
127355	NC_005027	TTC	3	9	6431264	6431272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477243
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127368	NC_005027	CGGC	2	8	6431665	6431672	0 %	0 %	50 %	50 %	32477243
127369	NC_005027	AGTGA	2	10	6431702	6431711	40 %	20 %	40 %	0 %	32477243
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127377	NC_005027	TTCG	2	8	6431905	6431912	0 %	50 %	25 %	25 %	32477243
127378	NC_005027	CAC	2	6	6431944	6431949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477243
127379	NC_005027	GGT	2	6	6432017	6432022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477243
127380	NC_005027	TCC	2	6	6432090	6432095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32477243
127381	NC_005027	CG	4	8	6432247	6432254	0 %	0 %	50 %	50 %	32477243
127382	NC_005027	GCG	2	6	6432354	6432359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477243
127383	NC_005027	ATC	2	6	6432372	6432377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477243
127384	NC_005027	GGC	2	6	6432419	6432424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127385	NC_005027	T	6	6	6432445	6432450	0 %	100 %	0 %	0 %	32477244
127386	NC_005027	GGC	2	6	6432468	6432473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477244
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127392	NC_005027	T	6	6	6432851	6432856	0 %	100 %	0 %	0 %	32477244
127393	NC_005027	CAC	2	6	6432933	6432938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477244
127394	NC_005027	TGC	2	6	6433047	6433052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477244
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127397	NC_005027	CGT	2	6	6433116	6433121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477244
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127400	NC_005027	AATC	2	8	6433199	6433206	50 %	25 %	0 %	25 %	32477244
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127402	NC_005027	CGAT	2	8	6433265	6433272	25 %	25 %	25 %	25 %	32477244
127403	NC_005027	GAGT	2	8	6433274	6433281	25 %	25 %	50 %	0 %	32477244
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127412	NC_005027	GTT	2	6	6433745	6433750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477244
127413	NC_005027	TCG	2	6	6433795	6433800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477244
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127416	NC_005027	GTT	2	6	6433932	6433937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477244
127417	NC_005027	TGGA	2	8	6433959	6433966	25 %	25 %	50 %	0 %	32477244
127418	NC_005027	GCC	2	6	6434095	6434100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477244
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127428	NC_005027	GCC	2	6	6434879	6434884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477246
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127440	NC_005027	CTCG	2	8	6435518	6435525	0 %	25 %	25 %	50 %	32477246
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127446	NC_005027	TTCG	2	8	6435812	6435819	0 %	50 %	25 %	25 %	32477247
127447	NC_005027	AAC	2	6	6435824	6435829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477247
127448	NC_005027	AGT	2	6	6435873	6435878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477247
127449	NC_005027	TCGAT	2	10	6435915	6435924	20 %	40 %	20 %	20 %	32477247
127450	NC_005027	CGT	3	9	6435926	6435934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477247
127451	NC_005027	GTTT	2	8	6435963	6435970	0 %	75 %	25 %	0 %	32477247
127452	NC_005027	TGG	2	6	6435985	6435990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477247
127453	NC_005027	GCTT	2	8	6436047	6436054	0 %	50 %	25 %	25 %	32477247
127454	NC_005027	GTG	2	6	6436079	6436084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477247
127455	NC_005027	CCG	2	6	6436131	6436136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477247
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127457	NC_005027	TTGG	2	8	6436307	6436314	0 %	50 %	50 %	0 %	32477247
127458	NC_005027	GCG	2	6	6436320	6436325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477247
127459	NC_005027	TCG	2	6	6436434	6436439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477247
127460	NC_005027	TCA	2	6	6436624	6436629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477247
127461	NC_005027	CCG	2	6	6436646	6436651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477247
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127463	NC_005027	CATT	2	8	6436719	6436726	25 %	50 %	0 %	25 %	32477247
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