MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_005027	GATC	2	8	600028	600035	25 %	25 %	25 %	25 %	32471266
12003	NC_005027	GTC	2	6	600053	600058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471266
12004	NC_005027	CAC	2	6	600078	600083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471266
12005	NC_005027	CCAATC	2	12	600085	600096	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32471266
12006	NC_005027	CGC	2	6	600121	600126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471266
12007	NC_005027	TGT	2	6	600139	600144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471266
12008	NC_005027	CGT	2	6	600172	600177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471266
12009	NC_005027	CAA	2	6	600179	600184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471266
12010	NC_005027	CATG	2	8	600200	600207	25 %	25 %	25 %	25 %	32471266
12011	NC_005027	GGC	2	6	600383	600388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471266
12012	NC_005027	CGG	2	6	600403	600408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471266
12013	NC_005027	GCG	2	6	600462	600467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471266
12014	NC_005027	ATCGA	2	10	600472	600481	40 %	20 %	20 %	20 %	32471266
12015	NC_005027	CGT	2	6	600523	600528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471266
12016	NC_005027	TTG	2	6	600548	600553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471266
12017	NC_005027	GCA	2	6	600570	600575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471266
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12019	NC_005027	AACC	2	8	600635	600642	50 %	0 %	0 %	50 %	32471266
12020	NC_005027	GTT	2	6	600663	600668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471266
12021	NC_005027	TGA	2	6	600728	600733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471266
12022	NC_005027	AG	3	6	600741	600746	50 %	0 %	50 %	0 %	32471266
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12024	NC_005027	TTG	2	6	600847	600852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471266
12025	NC_005027	CGA	2	6	600873	600878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471266
12026	NC_005027	CGT	2	6	600963	600968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471266
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12028	NC_005027	TAG	2	6	601019	601024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471267
12029	NC_005027	TCCGA	2	10	601028	601037	20 %	20 %	20 %	40 %	32471267
12030	NC_005027	GCGTC	2	10	601067	601076	0 %	20 %	40 %	40 %	32471267
12031	NC_005027	CCG	2	6	601079	601084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471267
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12037	NC_005027	TAG	2	6	601310	601315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471267
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12040	NC_005027	GCA	2	6	601496	601501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471267
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12042	NC_005027	AAT	2	6	601585	601590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32471267
12043	NC_005027	CGAT	2	8	601620	601627	25 %	25 %	25 %	25 %	32471267
12044	NC_005027	AAG	2	6	601712	601717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471267
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12051	NC_005027	GAA	2	6	602167	602172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_005027	A	6	6	602174	602179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_005027	CA	3	6	602190	602195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12055	NC_005027	AAC	2	6	602379	602384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471268
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12088	NC_005027	CGT	2	6	603963	603968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471271
12089	NC_005027	CTG	2	6	603982	603987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471271
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12112	NC_005027	ACCG	2	8	604914	604921	25 %	0 %	25 %	50 %	32471274
12113	NC_005027	CAC	2	6	604982	604987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12114	NC_005027	CAT	2	6	605035	605040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_005027	ACCTT	2	10	605070	605079	20 %	40 %	0 %	40 %	32471275
12116	NC_005027	GTTG	2	8	605092	605099	0 %	50 %	50 %	0 %	32471275
12117	NC_005027	TTC	2	6	605111	605116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471275
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12120	NC_005027	TGTA	2	8	605213	605220	25 %	50 %	25 %	0 %	32471275
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12122	NC_005027	GC	3	6	605321	605326	0 %	0 %	50 %	50 %	32471275
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12239	NC_005027	TCAG	2	8	612776	612783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12244	NC_005027	TGC	2	6	613090	613095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471289
12245	NC_005027	ACGGC	2	10	613115	613124	20 %	0 %	40 %	40 %	32471289
12246	NC_005027	ATC	2	6	613201	613206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471290
12247	NC_005027	GATGA	2	10	613237	613246	40 %	20 %	40 %	0 %	32471290
12248	NC_005027	CGA	2	6	613289	613294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471290
12249	NC_005027	CTTCG	2	10	613312	613321	0 %	40 %	20 %	40 %	32471290
12250	NC_005027	CGT	2	6	613418	613423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12251	NC_005027	CAA	2	6	613432	613437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471291
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12253	NC_005027	ACG	2	6	613514	613519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471291
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12278	NC_005027	CCCA	2	8	614768	614775	25 %	0 %	0 %	75 %	32471292
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12283	NC_005027	ACGT	2	8	614976	614983	25 %	25 %	25 %	25 %	32471292
12284	NC_005027	AG	3	6	614990	614995	50 %	0 %	50 %	0 %	32471292
12285	NC_005027	CGA	2	6	615080	615085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12286	NC_005027	CTTG	2	8	615213	615220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12287	NC_005027	GCAA	2	8	615360	615367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12288	NC_005027	TTTC	2	8	615530	615537	0 %	75 %	0 %	25 %	32471293
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12301	NC_005027	GTTTGG	2	12	616233	616244	0 %	50 %	50 %	0 %	32471293
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12304	NC_005027	GAT	2	6	616498	616503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12305	NC_005027	ACTCAG	2	12	616563	616574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32471294
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12309	NC_005027	CA	3	6	616785	616790	50 %	0 %	0 %	50 %	32471294
12310	NC_005027	CA	3	6	616999	617004	50 %	0 %	0 %	50 %	32471294
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12316	NC_005027	CAT	2	6	617123	617128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471294
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12319	NC_005027	GAC	2	6	617180	617185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471294
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12329	NC_005027	CGC	2	6	617831	617836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471296
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12332	NC_005027	TGA	2	6	617894	617899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471296
12333	NC_005027	TTC	3	9	617940	617948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471296
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12350	NC_005027	TCA	2	6	618458	618463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471296
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12354	NC_005027	CGG	2	6	618617	618622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471296
12355	NC_005027	TTC	2	6	618666	618671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471296
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12357	NC_005027	CAA	3	9	618919	618927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12358	NC_005027	GTT	2	6	618948	618953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471297
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12365	NC_005027	CGA	2	6	619139	619144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471297
12366	NC_005027	GTG	2	6	619249	619254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471297
12367	NC_005027	CTTGGC	2	12	619274	619285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471297
12368	NC_005027	GTT	2	6	619306	619311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471297
12369	NC_005027	GTG	2	6	619363	619368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471297
12370	NC_005027	GGAA	2	8	619574	619581	50 %	0 %	50 %	0 %	32471298
12371	NC_005027	GCAAA	2	10	619703	619712	60 %	0 %	20 %	20 %	32471298
12372	NC_005027	CGG	2	6	619765	619770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471298
12373	NC_005027	CTG	2	6	619804	619809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471298
12374	NC_005027	CGAAT	2	10	619811	619820	40 %	20 %	20 %	20 %	32471298
12375	NC_005027	TGC	2	6	619871	619876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471298
12376	NC_005027	GCT	2	6	619907	619912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471298
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12380	NC_005027	GTGC	2	8	620050	620057	0 %	25 %	50 %	25 %	32471298
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12394	NC_005027	TAC	2	6	620541	620546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471298
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12397	NC_005027	GTCA	2	8	620616	620623	25 %	25 %	25 %	25 %	32471298
12398	NC_005027	TTTG	2	8	620661	620668	0 %	75 %	25 %	0 %	32471298
12399	NC_005027	TTTC	2	8	620749	620756	0 %	75 %	0 %	25 %	32471299
12400	NC_005027	TCG	2	6	620828	620833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471299
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12402	NC_005027	GTC	2	6	620886	620891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471299
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12406	NC_005027	GCC	2	6	621088	621093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471299
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12429	NC_005027	CGC	3	9	621791	621799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471299
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12438	NC_005027	CGT	2	6	622283	622288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471299
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12444	NC_005027	TGA	2	6	622481	622486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471299
12445	NC_005027	ATC	2	6	622552	622557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471299
12446	NC_005027	GCA	2	6	622596	622601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471299
12447	NC_005027	TTC	2	6	622651	622656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12448	NC_005027	TC	3	6	622667	622672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12449	NC_005027	CGATCC	2	12	622813	622824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12450	NC_005027	GCT	2	6	622965	622970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471300
12451	NC_005027	TCGG	2	8	623075	623082	0 %	25 %	50 %	25 %	32471300
12452	NC_005027	TTGC	2	8	623160	623167	0 %	50 %	25 %	25 %	32471300
12453	NC_005027	CGG	2	6	623169	623174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471300
12454	NC_005027	CA	3	6	623189	623194	50 %	0 %	0 %	50 %	32471300
12455	NC_005027	GTG	2	6	623196	623201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471300
12456	NC_005027	CGGA	2	8	623276	623283	25 %	0 %	50 %	25 %	32471300
12457	NC_005027	CGG	2	6	623315	623320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471300
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12461	NC_005027	TCCA	2	8	623455	623462	25 %	25 %	0 %	50 %	32471300
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12470	NC_005027	GCA	2	6	623814	623819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471300
12471	NC_005027	ATGC	2	8	623828	623835	25 %	25 %	25 %	25 %	32471300
12472	NC_005027	GGT	2	6	623985	623990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471301
12473	NC_005027	G	6	6	623991	623996	0 %	0 %	100 %	0 %	32471301
12474	NC_005027	GGT	2	6	624099	624104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471302
12475	NC_005027	ACC	2	6	624120	624125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471302
12476	NC_005027	TGGGC	2	10	624208	624217	0 %	20 %	60 %	20 %	32471302
12477	NC_005027	TGATT	2	10	624305	624314	20 %	60 %	20 %	0 %	32471302
12478	NC_005027	ACC	2	6	624338	624343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12479	NC_005027	GGC	2	6	624445	624450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471303
12480	NC_005027	TTGG	2	8	624495	624502	0 %	50 %	50 %	0 %	32471303
12481	NC_005027	GAA	2	6	624527	624532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471303
12482	NC_005027	TCA	2	6	624542	624547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471304
12483	NC_005027	GGT	2	6	624557	624562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471304
12484	NC_005027	CAT	2	6	624612	624617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471304
12485	NC_005027	GTC	2	6	624684	624689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471304
12486	NC_005027	CAG	3	9	624705	624713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471304
12487	NC_005027	GCGT	2	8	624733	624740	0 %	25 %	50 %	25 %	32471304
12488	NC_005027	CTCG	2	8	624932	624939	0 %	25 %	25 %	50 %	32471304
12489	NC_005027	AGC	2	6	624948	624953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471304
12490	NC_005027	TTTG	2	8	625013	625020	0 %	75 %	25 %	0 %	32471304
12491	NC_005027	CAG	2	6	625104	625109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471304
12492	NC_005027	GTC	2	6	625126	625131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471304
12493	NC_005027	CCG	2	6	625132	625137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471304
12494	NC_005027	GGC	2	6	625204	625209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471304
12495	NC_005027	TCGA	2	8	625216	625223	25 %	25 %	25 %	25 %	32471304
12496	NC_005027	CAT	2	6	625242	625247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471304
12497	NC_005027	ATC	2	6	625284	625289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471304
12498	NC_005027	CGAA	2	8	625312	625319	50 %	0 %	25 %	25 %	32471304
12499	NC_005027	GAGC	2	8	625334	625341	25 %	0 %	50 %	25 %	32471304
12500	NC_005027	GTC	2	6	625371	625376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471304

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