MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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123502	NC_005027	A	6	6	6237924	6237929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123503	NC_005027	GTCA	2	8	6237936	6237943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123504	NC_005027	CGG	2	6	6237974	6237979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123505	NC_005027	CGA	2	6	6238030	6238035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123506	NC_005027	GCT	2	6	6238067	6238072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477041
123507	NC_005027	A	6	6	6238139	6238144	100 %	0 %	0 %	0 %	32477041
123508	NC_005027	GGC	2	6	6238154	6238159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477041
123509	NC_005027	GAA	2	6	6238172	6238177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477041
123510	NC_005027	TTG	2	6	6238219	6238224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477041
123511	NC_005027	T	6	6	6238237	6238242	0 %	100 %	0 %	0 %	32477041
123512	NC_005027	C	6	6	6238320	6238325	0 %	0 %	0 %	100 %	32477041
123513	NC_005027	TCG	2	6	6238344	6238349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477041
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123515	NC_005027	GCCCA	2	10	6238384	6238393	20 %	0 %	20 %	60 %	32477041
123516	NC_005027	CCG	2	6	6238413	6238418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477041
123517	NC_005027	CCA	2	6	6238434	6238439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477041
123518	NC_005027	GCC	2	6	6238529	6238534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477041
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123521	NC_005027	AGC	2	6	6238642	6238647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477041
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123526	NC_005027	TTGG	2	8	6238832	6238839	0 %	50 %	50 %	0 %	32477042
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123533	NC_005027	GAG	2	6	6239479	6239484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32477042
123534	NC_005027	CAA	2	6	6239490	6239495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477042
123535	NC_005027	TG	3	6	6239527	6239532	0 %	50 %	50 %	0 %	32477042
123536	NC_005027	TGA	2	6	6239549	6239554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477042
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123552	NC_005027	CGG	2	6	6240223	6240228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123553	NC_005027	ATC	2	6	6240230	6240235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123554	NC_005027	CTGG	2	8	6240285	6240292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123555	NC_005027	T	6	6	6240308	6240313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123556	NC_005027	TGC	3	9	6240582	6240590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123557	NC_005027	GGA	2	6	6240602	6240607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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123572	NC_005027	GAC	2	6	6241328	6241333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477043
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123583	NC_005027	GAA	2	6	6241883	6241888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477044
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123590	NC_005027	GCCA	2	8	6242120	6242127	25 %	0 %	25 %	50 %	32477044
123591	NC_005027	GCGA	2	8	6242149	6242156	25 %	0 %	50 %	25 %	32477044
123592	NC_005027	CG	4	8	6242194	6242201	0 %	0 %	50 %	50 %	32477044
123593	NC_005027	CTG	2	6	6242214	6242219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477044
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123602	NC_005027	GTC	2	6	6242402	6242407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477044
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123604	NC_005027	GCG	2	6	6242453	6242458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477044
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123610	NC_005027	TGA	3	9	6242694	6242702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477044
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123848	NC_005027	CGA	2	6	6253982	6253987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477057
123849	NC_005027	GCC	2	6	6254000	6254005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477057
123850	NC_005027	GAA	2	6	6254027	6254032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477057
123851	NC_005027	GCA	2	6	6254061	6254066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477057
123852	NC_005027	TGGT	2	8	6254082	6254089	0 %	50 %	50 %	0 %	32477057
123853	NC_005027	CGA	2	6	6254093	6254098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477057
123854	NC_005027	CCT	2	6	6254247	6254252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32477058
123855	NC_005027	CGG	2	6	6254254	6254259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477058
123856	NC_005027	TCGA	2	8	6254288	6254295	25 %	25 %	25 %	25 %	32477058
123857	NC_005027	CCG	2	6	6254348	6254353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477058
123858	NC_005027	GTT	2	6	6254377	6254382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477058
123859	NC_005027	CAG	2	6	6254461	6254466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477058
123860	NC_005027	GATGCG	2	12	6254473	6254484	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	32477058
123861	NC_005027	CAT	2	6	6254491	6254496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477058
123862	NC_005027	CAA	2	6	6254545	6254550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477058
123863	NC_005027	CT	3	6	6254604	6254609	0 %	50 %	0 %	50 %	32477058
123864	NC_005027	TGA	2	6	6254709	6254714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477058
123865	NC_005027	GTC	2	6	6254729	6254734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477058
123866	NC_005027	GCC	2	6	6254779	6254784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477058
123867	NC_005027	TCT	2	6	6254922	6254927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477058
123868	NC_005027	CGT	2	6	6254938	6254943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477058
123869	NC_005027	TGC	2	6	6254962	6254967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477058
123870	NC_005027	TGCG	2	8	6255065	6255072	0 %	25 %	50 %	25 %	32477058
123871	NC_005027	T	7	7	6255148	6255154	0 %	100 %	0 %	0 %	32477058
123872	NC_005027	CCA	2	6	6255155	6255160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32477058
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123874	NC_005027	ATG	2	6	6255376	6255381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477058
123875	NC_005027	TCG	2	6	6255411	6255416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477059
123876	NC_005027	TC	3	6	6255417	6255422	0 %	50 %	0 %	50 %	32477059
123877	NC_005027	ATC	2	6	6255451	6255456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477059
123878	NC_005027	TGC	2	6	6255560	6255565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477059
123879	NC_005027	GTC	2	6	6255709	6255714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477059
123880	NC_005027	CCCA	2	8	6255718	6255725	25 %	0 %	0 %	75 %	32477059
123881	NC_005027	TCAA	2	8	6255779	6255786	50 %	25 %	0 %	25 %	32477060
123882	NC_005027	TCG	2	6	6255791	6255796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477060
123883	NC_005027	CAT	2	6	6255880	6255885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477060
123884	NC_005027	CGCA	2	8	6256209	6256216	25 %	0 %	25 %	50 %	32477060
123885	NC_005027	TCT	2	6	6256307	6256312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477060
123886	NC_005027	ACG	2	6	6256366	6256371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477060
123887	NC_005027	AGT	2	6	6256386	6256391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477060
123888	NC_005027	TCG	2	6	6256457	6256462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477060
123889	NC_005027	TTC	2	6	6256584	6256589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477061
123890	NC_005027	AAC	2	6	6256641	6256646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477061
123891	NC_005027	GGC	2	6	6256690	6256695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477061
123892	NC_005027	CCTT	2	8	6256734	6256741	0 %	50 %	0 %	50 %	32477062
123893	NC_005027	GAG	2	6	6256764	6256769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32477062
123894	NC_005027	CGA	2	6	6256798	6256803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477062
123895	NC_005027	GAT	2	6	6256844	6256849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123896	NC_005027	CGG	2	6	6256888	6256893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477063
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123898	NC_005027	CGAT	2	8	6257035	6257042	25 %	25 %	25 %	25 %	32477063
123899	NC_005027	GAT	2	6	6257123	6257128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477063
123900	NC_005027	TCG	2	6	6257139	6257144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123901	NC_005027	GTT	2	6	6257261	6257266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32477063
123902	NC_005027	GTTT	2	8	6257281	6257288	0 %	75 %	25 %	0 %	32477063
123903	NC_005027	ATC	2	6	6257469	6257474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477063
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123905	NC_005027	GAT	2	6	6257570	6257575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477063
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123908	NC_005027	GTTG	2	8	6257803	6257810	0 %	50 %	50 %	0 %	32477063
123909	NC_005027	GCA	2	6	6257851	6257856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123910	NC_005027	GCA	2	6	6257863	6257868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123911	NC_005027	GCA	2	6	6257890	6257895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477063
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123914	NC_005027	GTA	2	6	6258116	6258121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32477063
123915	NC_005027	CGC	2	6	6258191	6258196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477063
123916	NC_005027	TCG	2	6	6258198	6258203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123917	NC_005027	CGGT	2	8	6258322	6258329	0 %	25 %	50 %	25 %	32477063
123918	NC_005027	TCG	2	6	6258357	6258362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123919	NC_005027	CGAA	2	8	6258404	6258411	50 %	0 %	25 %	25 %	32477063
123920	NC_005027	TCT	2	6	6258421	6258426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32477063
123921	NC_005027	GCG	2	6	6258477	6258482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477063
123922	NC_005027	CAT	2	6	6258491	6258496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477063
123923	NC_005027	CGG	2	6	6258505	6258510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32477063
123924	NC_005027	TGC	2	6	6258522	6258527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123925	NC_005027	TGC	2	6	6258535	6258540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123926	NC_005027	AGCA	2	8	6258618	6258625	50 %	0 %	25 %	25 %	32477063
123927	NC_005027	CGA	2	6	6258784	6258789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477063
123928	NC_005027	T	8	8	6258833	6258840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123929	NC_005027	GCA	2	6	6258884	6258889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123930	NC_005027	TGG	2	6	6259036	6259041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477064
123931	NC_005027	CTG	2	6	6259121	6259126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123932	NC_005027	CTG	2	6	6259145	6259150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123933	NC_005027	TGC	2	6	6259197	6259202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123934	NC_005027	CTG	2	6	6259238	6259243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123935	NC_005027	CAT	3	9	6259322	6259330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32477064
123936	NC_005027	AAC	2	6	6259333	6259338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32477064
123937	NC_005027	AGC	2	6	6259474	6259479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123938	NC_005027	GAA	2	6	6259542	6259547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123939	NC_005027	CTG	2	6	6259549	6259554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123940	NC_005027	AAG	2	6	6259555	6259560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123941	NC_005027	GTC	2	6	6259566	6259571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123942	NC_005027	GAA	2	6	6259614	6259619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123943	NC_005027	AGA	2	6	6259628	6259633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123944	NC_005027	GAA	2	6	6259644	6259649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123945	NC_005027	GCC	2	6	6259653	6259658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477064
123946	NC_005027	GAA	2	6	6259707	6259712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123947	NC_005027	GAC	2	6	6259767	6259772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123948	NC_005027	GGT	2	6	6259791	6259796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477064
123949	NC_005027	TTTG	2	8	6259865	6259872	0 %	75 %	25 %	0 %	32477064
123950	NC_005027	CTG	2	6	6259927	6259932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123951	NC_005027	TGG	2	6	6259955	6259960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477064
123952	NC_005027	CGAAGC	2	12	6259961	6259972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123953	NC_005027	CTG	2	6	6259975	6259980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123954	NC_005027	CCG	2	6	6259987	6259992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32477064
123955	NC_005027	CTG	2	6	6259999	6260004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32477064
123956	NC_005027	TGG	2	6	6260027	6260032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32477064
123957	NC_005027	GAA	2	6	6260052	6260057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32477064
123958	NC_005027	AGG	2	6	6260072	6260077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32477064
123959	NC_005027	GGAC	2	8	6260081	6260088	25 %	0 %	50 %	25 %	32477064
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123961	NC_005027	GAC	2	6	6260142	6260147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32477064
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