MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005027	ACC	2	6	277205	277210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470954
5502	NC_005027	GAA	2	6	277298	277303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470954
5503	NC_005027	CGA	2	6	277344	277349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5504	NC_005027	TCCG	2	8	277449	277456	0 %	25 %	25 %	50 %	32470954
5505	NC_005027	CTG	2	6	277532	277537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5506	NC_005027	TCGA	2	8	277622	277629	25 %	25 %	25 %	25 %	32470954
5507	NC_005027	CCA	2	6	277668	277673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470954
5508	NC_005027	GATT	2	8	277831	277838	25 %	50 %	25 %	0 %	32470954
5509	NC_005027	CGG	2	6	277922	277927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470954
5510	NC_005027	GAC	2	6	278045	278050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5511	NC_005027	TGC	2	6	278145	278150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5512	NC_005027	ACCT	2	8	278152	278159	25 %	25 %	0 %	50 %	32470954
5513	NC_005027	ACCA	2	8	278180	278187	50 %	0 %	0 %	50 %	32470954
5514	NC_005027	ACG	2	6	278188	278193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5515	NC_005027	ATC	2	6	278285	278290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470954
5516	NC_005027	ATG	2	6	278310	278315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470954
5517	NC_005027	TGC	2	6	278388	278393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5518	NC_005027	CCAA	2	8	278424	278431	50 %	0 %	0 %	50 %	32470954
5519	NC_005027	ACA	2	6	278520	278525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5520	NC_005027	ATC	2	6	278596	278601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470954
5521	NC_005027	CTC	2	6	278682	278687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470954
5522	NC_005027	CCG	2	6	278691	278696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470954
5523	NC_005027	GAAGC	2	10	278786	278795	40 %	0 %	40 %	20 %	32470954
5524	NC_005027	GAAGC	2	10	278801	278810	40 %	0 %	40 %	20 %	32470954
5525	NC_005027	GAAGC	2	10	278816	278825	40 %	0 %	40 %	20 %	32470954
5526	NC_005027	ACCCA	2	10	278879	278888	40 %	0 %	0 %	60 %	32470954
5527	NC_005027	GACT	2	8	278932	278939	25 %	25 %	25 %	25 %	32470954
5528	NC_005027	CAAC	2	8	278940	278947	50 %	0 %	0 %	50 %	32470954
5529	NC_005027	CCGA	2	8	278979	278986	25 %	0 %	25 %	50 %	32470954
5530	NC_005027	CAAAA	2	10	279028	279037	80 %	0 %	0 %	20 %	32470954
5531	NC_005027	ACA	2	6	279084	279089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5532	NC_005027	CTC	2	6	279130	279135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470954
5533	NC_005027	CGG	3	9	279159	279167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470954
5534	NC_005027	CAAAAC	2	12	279192	279203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5535	NC_005027	CCA	2	6	279216	279221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470954
5536	NC_005027	AAG	2	6	279260	279265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470954
5537	NC_005027	CAA	2	6	279289	279294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5538	NC_005027	TCCAAA	2	12	279314	279325	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32470954
5539	NC_005027	GTCA	2	8	279419	279426	25 %	25 %	25 %	25 %	32470954
5540	NC_005027	CGA	2	6	279471	279476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5541	NC_005027	CCGG	2	8	279477	279484	0 %	0 %	50 %	50 %	32470954
5542	NC_005027	GAA	2	6	279530	279535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470954
5543	NC_005027	CGA	2	6	279544	279549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5544	NC_005027	GTC	2	6	279569	279574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5545	NC_005027	TCG	2	6	279664	279669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5546	NC_005027	TCG	2	6	279702	279707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5547	NC_005027	GA	3	6	279715	279720	50 %	0 %	50 %	0 %	32470954
5548	NC_005027	TTG	2	6	279747	279752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470954
5549	NC_005027	GCA	2	6	279862	279867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5550	NC_005027	GTC	2	6	279869	279874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5551	NC_005027	CTG	2	6	279899	279904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5552	NC_005027	GA	3	6	279927	279932	50 %	0 %	50 %	0 %	32470954
5553	NC_005027	AAGA	2	8	279941	279948	75 %	0 %	25 %	0 %	32470954
5554	NC_005027	ACG	2	6	279991	279996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5555	NC_005027	TCG	2	6	280053	280058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5556	NC_005027	CGG	2	6	280106	280111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470954
5557	NC_005027	ATG	2	6	280115	280120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470954
5558	NC_005027	CGA	2	6	280144	280149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5559	NC_005027	GAAC	2	8	280207	280214	50 %	0 %	25 %	25 %	32470954
5560	NC_005027	TC	3	6	280222	280227	0 %	50 %	0 %	50 %	32470954
5561	NC_005027	GAA	2	6	280250	280255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470954
5562	NC_005027	TGA	2	6	280257	280262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470954
5563	NC_005027	CAT	3	9	280306	280314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470954
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5565	NC_005027	CGC	2	6	280354	280359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470954
5566	NC_005027	GCTG	2	8	280363	280370	0 %	25 %	50 %	25 %	32470954
5567	NC_005027	AAC	2	6	280383	280388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5568	NC_005027	CCGCGA	2	12	280455	280466	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	32470954
5569	NC_005027	CGA	2	6	280486	280491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5570	NC_005027	GCGAA	2	10	280512	280521	40 %	0 %	40 %	20 %	32470954
5571	NC_005027	ACC	2	6	280535	280540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470954
5572	NC_005027	ATG	2	6	280617	280622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470954
5573	NC_005027	GTC	2	6	280664	280669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5574	NC_005027	TG	3	6	280684	280689	0 %	50 %	50 %	0 %	32470954
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5578	NC_005027	ATCCG	2	10	280928	280937	20 %	20 %	20 %	40 %	32470954
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5580	NC_005027	ACCG	2	8	280982	280989	25 %	0 %	25 %	50 %	32470954
5581	NC_005027	GAA	2	6	281003	281008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470954
5582	NC_005027	CGT	2	6	281032	281037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
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5584	NC_005027	GTT	2	6	281197	281202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470954
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5588	NC_005027	ATC	2	6	281323	281328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470954
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5590	NC_005027	AAC	2	6	281346	281351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5591	NC_005027	AAGC	2	8	281363	281370	50 %	0 %	25 %	25 %	32470954
5592	NC_005027	TGA	2	6	281455	281460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470954
5593	NC_005027	TGA	2	6	281484	281489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470954
5594	NC_005027	CGAG	2	8	281515	281522	25 %	0 %	50 %	25 %	32470954
5595	NC_005027	CAA	2	6	281528	281533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470954
5596	NC_005027	CGA	2	6	281545	281550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
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5599	NC_005027	CCGC	2	8	281659	281666	0 %	0 %	25 %	75 %	32470954
5600	NC_005027	CGAT	2	8	281727	281734	25 %	25 %	25 %	25 %	32470954
5601	NC_005027	AC	3	6	281759	281764	50 %	0 %	0 %	50 %	32470955
5602	NC_005027	CA	3	6	281787	281792	50 %	0 %	0 %	50 %	32470955
5603	NC_005027	GAA	2	6	281794	281799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470955
5604	NC_005027	CGCAA	2	10	281847	281856	40 %	0 %	20 %	40 %	32470955
5605	NC_005027	TGC	2	6	281865	281870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470955
5606	NC_005027	CCG	2	6	281914	281919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470955
5607	NC_005027	GCGA	2	8	281959	281966	25 %	0 %	50 %	25 %	32470955
5608	NC_005027	ATC	2	6	281982	281987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470955
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5611	NC_005027	GAA	2	6	282049	282054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470955
5612	NC_005027	GC	3	6	282134	282139	0 %	0 %	50 %	50 %	32470955
5613	NC_005027	TC	3	6	282143	282148	0 %	50 %	0 %	50 %	32470955
5614	NC_005027	CGT	3	9	282178	282186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470955
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5619	NC_005027	TAC	3	9	282763	282771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470955
5620	NC_005027	TAC	2	6	282781	282786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470955
5621	NC_005027	AGC	2	6	282787	282792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470955
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5623	NC_005027	GAA	2	6	282826	282831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470955
5624	NC_005027	CGC	2	6	282846	282851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470955
5625	NC_005027	CGGG	2	8	282893	282900	0 %	0 %	75 %	25 %	32470955
5626	NC_005027	CGAA	2	8	282902	282909	50 %	0 %	25 %	25 %	32470955
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5628	NC_005027	CTCG	2	8	282936	282943	0 %	25 %	25 %	50 %	32470955
5629	NC_005027	TCGCG	2	10	283006	283015	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5658	NC_005027	GCTG	2	8	284388	284395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5993	NC_005027	GAT	2	6	302455	302460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470976
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6000	NC_005027	AG	3	6	302822	302827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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