MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 141663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005027	ATG	2	6	252443	252448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_005027	TGG	2	6	252508	252513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470936
5003	NC_005027	ACG	2	6	252637	252642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470936
5004	NC_005027	AGGT	2	8	252673	252680	25 %	25 %	50 %	0 %	32470936
5005	NC_005027	GCC	2	6	252725	252730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470937
5006	NC_005027	GACT	2	8	252759	252766	25 %	25 %	25 %	25 %	32470937
5007	NC_005027	CCT	2	6	252768	252773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470937
5008	NC_005027	AATT	2	8	252779	252786	50 %	50 %	0 %	0 %	32470937
5009	NC_005027	GT	3	6	252803	252808	0 %	50 %	50 %	0 %	32470937
5010	NC_005027	GA	3	6	252897	252902	50 %	0 %	50 %	0 %	32470937
5011	NC_005027	A	6	6	252909	252914	100 %	0 %	0 %	0 %	32470937
5012	NC_005027	CGTT	2	8	253076	253083	0 %	50 %	25 %	25 %	32470937
5013	NC_005027	ACG	2	6	253110	253115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470937
5014	NC_005027	CGC	2	6	253140	253145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470937
5015	NC_005027	ACG	2	6	253166	253171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470937
5016	NC_005027	GTTGA	2	10	253178	253187	20 %	40 %	40 %	0 %	32470937
5017	NC_005027	TCG	2	6	253277	253282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470938
5018	NC_005027	CGTC	2	8	253349	253356	0 %	25 %	25 %	50 %	32470938
5019	NC_005027	GA	3	6	253436	253441	50 %	0 %	50 %	0 %	32470939
5020	NC_005027	CTG	2	6	253500	253505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470939
5021	NC_005027	T	7	7	253518	253524	0 %	100 %	0 %	0 %	32470939
5022	NC_005027	ATCG	2	8	253625	253632	25 %	25 %	25 %	25 %	32470939
5023	NC_005027	GAT	2	6	253640	253645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470939
5024	NC_005027	CGAT	2	8	253679	253686	25 %	25 %	25 %	25 %	32470940
5025	NC_005027	TTC	2	6	253711	253716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470940
5026	NC_005027	TCA	2	6	253743	253748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470940
5027	NC_005027	TTCA	2	8	253846	253853	25 %	50 %	0 %	25 %	32470940
5028	NC_005027	CGT	2	6	253978	253983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5029	NC_005027	GTC	2	6	254000	254005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5030	NC_005027	AGC	2	6	254192	254197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5031	NC_005027	CT	3	6	254224	254229	0 %	50 %	0 %	50 %	32470940
5032	NC_005027	TCA	2	6	254339	254344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470940
5033	NC_005027	ATG	2	6	254372	254377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470940
5034	NC_005027	TCG	3	9	254465	254473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5035	NC_005027	ACTG	2	8	254502	254509	25 %	25 %	25 %	25 %	32470940
5036	NC_005027	GTTT	2	8	254510	254517	0 %	75 %	25 %	0 %	32470940
5037	NC_005027	TCGA	2	8	254520	254527	25 %	25 %	25 %	25 %	32470940
5038	NC_005027	GTT	2	6	254592	254597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470940
5039	NC_005027	CGG	2	6	254760	254765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470940
5040	NC_005027	TCC	2	6	254767	254772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470940
5041	NC_005027	AAC	2	6	254888	254893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470940
5042	NC_005027	CACGG	2	10	254983	254992	20 %	0 %	40 %	40 %	32470940
5043	NC_005027	CCA	2	6	254994	254999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470940
5044	NC_005027	GCA	2	6	255042	255047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5045	NC_005027	CGC	4	12	255049	255060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470940
5046	NC_005027	GCG	2	6	255093	255098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470940
5047	NC_005027	TGC	2	6	255115	255120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5048	NC_005027	CGC	2	6	255156	255161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470940
5049	NC_005027	CAA	2	6	255169	255174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470940
5050	NC_005027	CCAACA	2	12	255180	255191	50 %	0 %	0 %	50 %	32470940
5051	NC_005027	TCC	2	6	255227	255232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470940
5052	NC_005027	A	8	8	255300	255307	100 %	0 %	0 %	0 %	32470940
5053	NC_005027	CCGA	2	8	255320	255327	25 %	0 %	25 %	50 %	32470940
5054	NC_005027	CGAG	2	8	255367	255374	25 %	0 %	50 %	25 %	32470940
5055	NC_005027	GGGCG	2	10	255385	255394	0 %	0 %	80 %	20 %	32470940
5056	NC_005027	GCACTC	2	12	255417	255428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32470940
5057	NC_005027	TCGG	2	8	255440	255447	0 %	25 %	50 %	25 %	32470940
5058	NC_005027	CTC	2	6	255457	255462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470940
5059	NC_005027	GCT	2	6	255484	255489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470940
5060	NC_005027	GCTGCC	2	12	255515	255526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	32470940
5061	NC_005027	GCC	2	6	255596	255601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470940
5062	NC_005027	TGCC	2	8	255670	255677	0 %	25 %	25 %	50 %	32470940
5063	NC_005027	CAAA	2	8	255678	255685	75 %	0 %	0 %	25 %	32470940
5064	NC_005027	GCGA	2	8	255770	255777	25 %	0 %	50 %	25 %	32470940
5065	NC_005027	TGCGA	2	10	255785	255794	20 %	20 %	40 %	20 %	32470940
5066	NC_005027	ATTTG	2	10	255795	255804	20 %	60 %	20 %	0 %	32470940
5067	NC_005027	A	6	6	255876	255881	100 %	0 %	0 %	0 %	32470941
5068	NC_005027	GCGAA	2	10	255884	255893	40 %	0 %	40 %	20 %	32470941
5069	NC_005027	GCG	2	6	255954	255959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470941
5070	NC_005027	GATT	2	8	255986	255993	25 %	50 %	25 %	0 %	32470941
5071	NC_005027	AAC	2	6	256037	256042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470941
5072	NC_005027	CAG	2	6	256091	256096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5073	NC_005027	CTG	2	6	256103	256108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5074	NC_005027	ATC	2	6	256109	256114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470941
5075	NC_005027	TCCCG	2	10	256116	256125	0 %	20 %	20 %	60 %	32470941
5076	NC_005027	GAT	2	6	256196	256201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470941
5077	NC_005027	TCA	2	6	256276	256281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470941
5078	NC_005027	GTC	3	9	256301	256309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5079	NC_005027	CTG	2	6	256340	256345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5080	NC_005027	GCC	2	6	256530	256535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470941
5081	NC_005027	TCAC	2	8	256617	256624	25 %	25 %	0 %	50 %	32470941
5082	NC_005027	TCT	2	6	256731	256736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470941
5083	NC_005027	CTT	2	6	256747	256752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470941
5084	NC_005027	CGG	2	6	256786	256791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470941
5085	NC_005027	CAC	2	6	256810	256815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470941
5086	NC_005027	CAT	2	6	256916	256921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470941
5087	NC_005027	TGC	2	6	257002	257007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5088	NC_005027	CAC	2	6	257135	257140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470941
5089	NC_005027	TCG	2	6	257145	257150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5090	NC_005027	CCA	2	6	257203	257208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470941
5091	NC_005027	TCGA	2	8	257216	257223	25 %	25 %	25 %	25 %	32470941
5092	NC_005027	TCGC	2	8	257250	257257	0 %	25 %	25 %	50 %	32470941
5093	NC_005027	CTG	2	6	257294	257299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5094	NC_005027	CG	3	6	257343	257348	0 %	0 %	50 %	50 %	32470941
5095	NC_005027	TCG	2	6	257466	257471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5096	NC_005027	ACG	2	6	257474	257479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470941
5097	NC_005027	CGG	2	6	257522	257527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470941
5098	NC_005027	CTCA	2	8	257606	257613	25 %	25 %	0 %	50 %	32470941
5099	NC_005027	CGTC	2	8	257639	257646	0 %	25 %	25 %	50 %	32470941
5100	NC_005027	GCC	2	6	257661	257666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470941
5101	NC_005027	CGT	2	6	257677	257682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
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5103	NC_005027	CGGA	2	8	257720	257727	25 %	0 %	50 %	25 %	32470941
5104	NC_005027	AGA	2	6	257736	257741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470941
5105	NC_005027	CTG	2	6	257806	257811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
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5107	NC_005027	CCAAC	2	10	257888	257897	40 %	0 %	0 %	60 %	32470941
5108	NC_005027	CGG	2	6	257902	257907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470941
5109	NC_005027	GATCG	2	10	257936	257945	20 %	20 %	40 %	20 %	32470941
5110	NC_005027	GATG	2	8	258056	258063	25 %	25 %	50 %	0 %	32470941
5111	NC_005027	CCA	2	6	258175	258180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470941
5112	NC_005027	AACC	2	8	258200	258207	50 %	0 %	0 %	50 %	32470941
5113	NC_005027	GTA	2	6	258212	258217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470941
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5116	NC_005027	GGAT	2	8	258359	258366	25 %	25 %	50 %	0 %	32470941
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5119	NC_005027	AAGC	2	8	258532	258539	50 %	0 %	25 %	25 %	32470941
5120	NC_005027	GTT	2	6	258570	258575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470941
5121	NC_005027	CAA	2	6	258605	258610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470941
5122	NC_005027	ATCCC	2	10	258615	258624	20 %	20 %	0 %	60 %	32470941
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5124	NC_005027	CGT	2	6	258700	258705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
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5126	NC_005027	CGT	2	6	258761	258766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470941
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5243	NC_005027	CGC	2	6	264871	264876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470947
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5248	NC_005027	CCAT	2	8	265281	265288	25 %	25 %	0 %	50 %	32470947
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5253	NC_005027	GAC	2	6	265480	265485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470947
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5260	NC_005027	CAAC	2	8	265929	265936	50 %	0 %	0 %	50 %	32470947
5261	NC_005027	GCT	2	6	265960	265965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470947
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5272	NC_005027	CGT	3	9	266422	266430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470948
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5317	NC_005027	CGT	2	6	268817	268822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
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5320	NC_005027	GCT	2	6	269000	269005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
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5326	NC_005027	A	6	6	269427	269432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5332	NC_005027	TCG	2	6	269612	269617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470950
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5343	NC_005027	CGT	3	9	270207	270215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470950
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5353	NC_005027	CGA	2	6	270774	270779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470951
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5357	NC_005027	GAGAT	2	10	270951	270960	40 %	20 %	40 %	0 %	32470951
5358	NC_005027	ATTG	2	8	270968	270975	25 %	50 %	25 %	0 %	32470951
5359	NC_005027	TTCG	2	8	271004	271011	0 %	50 %	25 %	25 %	32470951
5360	NC_005027	GAA	2	6	271022	271027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470951
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5365	NC_005027	TCC	2	6	271176	271181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470951
5366	NC_005027	ATTC	2	8	271198	271205	25 %	50 %	0 %	25 %	32470951
5367	NC_005027	AGC	2	6	271212	271217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470951
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5491	NC_005027	CTGG	2	8	276902	276909	0 %	25 %	50 %	25 %	32470953
5492	NC_005027	ATC	2	6	276936	276941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470953
5493	NC_005027	ACC	2	6	276974	276979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470954
5494	NC_005027	GCG	2	6	277033	277038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470954
5495	NC_005027	ATC	2	6	277064	277069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470954
5496	NC_005027	GT	3	6	277095	277100	0 %	50 %	50 %	0 %	32470954
5497	NC_005027	TGC	2	6	277101	277106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
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5499	NC_005027	ACTG	2	8	277174	277181	25 %	25 %	25 %	25 %	32470954
5500	NC_005027	TTG	2	6	277191	277196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470954

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