MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004041	GAA	2	6	196798	196803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492784
4002	NC_004041	GCG	2	6	196884	196889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492783
4003	NC_004041	AAG	2	6	196908	196913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492783
4004	NC_004041	GC	3	6	196972	196977	0 %	0 %	50 %	50 %	21492783
4005	NC_004041	TA	3	6	196992	196997	50 %	50 %	0 %	0 %	21492783
4006	NC_004041	CGA	2	6	197024	197029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492783
4007	NC_004041	ATC	2	6	197098	197103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492783
4008	NC_004041	ATG	2	6	197110	197115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492783
4009	NC_004041	CAC	2	6	197195	197200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492783
4010	NC_004041	ACG	2	6	197230	197235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492783
4011	NC_004041	CCG	2	6	197311	197316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492783
4012	NC_004041	AGG	2	6	197326	197331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492783
4013	NC_004041	GAT	2	6	197358	197363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492783
4014	NC_004041	GT	3	6	197477	197482	0 %	50 %	50 %	0 %	21492783
4015	NC_004041	TTA	2	6	197623	197628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004041	GCC	2	6	197679	197684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_004041	GC	3	6	197824	197829	0 %	0 %	50 %	50 %	21492782
4018	NC_004041	CGCAG	2	10	197845	197854	20 %	0 %	40 %	40 %	21492782
4019	NC_004041	CGG	2	6	197874	197879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492782
4020	NC_004041	AGC	2	6	197895	197900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492782
4021	NC_004041	CCG	2	6	197929	197934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492782
4022	NC_004041	ACA	2	6	197940	197945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492782
4023	NC_004041	GATCG	2	10	198011	198020	20 %	20 %	40 %	20 %	21492782
4024	NC_004041	AAC	2	6	198044	198049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492782
4025	NC_004041	GA	3	6	198128	198133	50 %	0 %	50 %	0 %	21492782
4026	NC_004041	TGA	2	6	198235	198240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492782
4027	NC_004041	TCGGC	2	10	198264	198273	0 %	20 %	40 %	40 %	21492782
4028	NC_004041	CAG	2	6	198317	198322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492782
4029	NC_004041	ATC	2	6	198356	198361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492782
4030	NC_004041	AT	3	6	198412	198417	50 %	50 %	0 %	0 %	21492782
4031	NC_004041	ACGA	2	8	198503	198510	50 %	0 %	25 %	25 %	21492782
4032	NC_004041	GCGA	2	8	198518	198525	25 %	0 %	50 %	25 %	21492782
4033	NC_004041	CGT	3	9	198583	198591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492782
4034	NC_004041	GCT	2	6	198668	198673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492782
4035	NC_004041	GAT	2	6	198766	198771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_004041	TAGG	2	8	198774	198781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_004041	AGG	2	6	198835	198840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_004041	AGG	2	6	198901	198906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_004041	GTG	2	6	198910	198915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_004041	GCG	2	6	198920	198925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_004041	CGAT	2	8	198957	198964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_004041	GCG	2	6	198970	198975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_004041	CGG	2	6	199029	199034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_004041	AGA	2	6	199077	199082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004041	GTT	2	6	199127	199132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_004041	CAG	2	6	199254	199259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_004041	AGT	2	6	199266	199271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_004041	GGT	2	6	199435	199440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_004041	CGA	2	6	199554	199559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_004041	CGG	2	6	199579	199584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_004041	GTG	2	6	199667	199672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_004041	GAC	2	6	199728	199733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_004041	CCG	2	6	199749	199754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_004041	TGT	2	6	199800	199805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_004041	CAAT	2	8	199826	199833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_004041	ACG	2	6	199856	199861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_004041	GAA	2	6	199881	199886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_004041	TCG	2	6	199937	199942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_004041	GC	3	6	199996	200001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_004041	AGG	2	6	200061	200066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_004041	GGAA	2	8	200157	200164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_004041	GAA	2	6	200185	200190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_004041	GAA	2	6	200197	200202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_004041	AAG	2	6	200219	200224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_004041	CGA	2	6	201898	201903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492779
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4111	NC_004041	TC	3	6	202785	202790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_004041	TCT	2	6	202844	202849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_004041	GAACG	2	10	202937	202946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4114	NC_004041	CCG	2	6	203001	203006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_004041	CAAC	2	8	203038	203045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_004041	TCG	2	6	203117	203122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492777
4117	NC_004041	AAG	2	6	203168	203173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492777
4118	NC_004041	T	6	6	203185	203190	0 %	100 %	0 %	0 %	21492777
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4120	NC_004041	TGG	2	6	203273	203278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492777
4121	NC_004041	CTGCA	2	10	203289	203298	20 %	20 %	20 %	40 %	21492777
4122	NC_004041	CAG	2	6	203372	203377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492777
4123	NC_004041	GCA	2	6	203413	203418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492777
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4125	NC_004041	GGC	2	6	203559	203564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_004041	GA	3	6	203614	203619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_004041	CGGC	2	8	203685	203692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4253	NC_004041	TGA	2	6	210398	210403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_004041	GCC	2	6	210409	210414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_004041	GCA	2	6	210416	210421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_004041	CGG	2	6	210427	210432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_004041	GCTG	2	8	210461	210468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4258	NC_004041	CCT	2	6	210588	210593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4259	NC_004041	CAA	2	6	210663	210668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_004041	TGG	2	6	210837	210842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_004041	A	6	6	210847	210852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_004041	CGA	2	6	210977	210982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492770
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4275	NC_004041	AGG	2	6	211805	211810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492770
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4375	NC_004041	GCA	2	6	216568	216573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492764
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4378	NC_004041	GC	3	6	216647	216652	0 %	0 %	50 %	50 %	21492764
4379	NC_004041	TGC	2	6	216664	216669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492764
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