MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2125	NC_004041	TCG	2	6	103234	103239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492870
2126	NC_004041	CGA	2	6	103297	103302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492870
2127	NC_004041	TGGT	2	8	103384	103391	0 %	50 %	50 %	0 %	21492870
2128	NC_004041	CCAA	2	8	103424	103431	50 %	0 %	0 %	50 %	21492870
2129	NC_004041	TC	3	6	103436	103441	0 %	50 %	0 %	50 %	21492870
2130	NC_004041	CGG	2	6	103676	103681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492870
2131	NC_004041	CTT	2	6	103733	103738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492870
2132	NC_004041	TCGC	2	8	103793	103800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2133	NC_004041	CCG	2	6	103859	103864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_004041	CTTCC	2	10	103925	103934	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2135	NC_004041	GGCC	2	8	103947	103954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2136	NC_004041	CAC	2	6	104129	104134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2137	NC_004041	CGAT	2	8	104136	104143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2138	NC_004041	CGA	2	6	104173	104178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_004041	TGC	2	6	104179	104184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_004041	CGG	2	6	104253	104258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_004041	GCC	2	6	104286	104291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2142	NC_004041	AGAGC	2	10	104478	104487	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2143	NC_004041	ATCA	2	8	104573	104580	50 %	25 %	0 %	25 %	21492869
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2149	NC_004041	GTT	2	6	104797	104802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492869
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2152	NC_004041	CGC	2	6	105013	105018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492869
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2157	NC_004041	CAC	3	9	105182	105190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2158	NC_004041	GCA	2	6	105202	105207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2159	NC_004041	TCC	2	6	105257	105262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2160	NC_004041	GCA	2	6	105322	105327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255330
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2163	NC_004041	CGGT	2	8	105410	105417	0 %	25 %	50 %	25 %	89255330
2164	NC_004041	T	6	6	105441	105446	0 %	100 %	0 %	0 %	89255330
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2166	NC_004041	GTC	2	6	105608	105613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255330
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2171	NC_004041	ATCG	2	8	105847	105854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2172	NC_004041	CAG	2	6	105912	105917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2183	NC_004041	CAG	2	6	106600	106605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492866
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2187	NC_004041	CGT	2	6	107051	107056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2188	NC_004041	GAAT	2	8	107156	107163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2189	NC_004041	CACCT	2	10	107205	107214	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2190	NC_004041	CT	4	8	107275	107282	0 %	50 %	0 %	50 %	21492865
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2194	NC_004041	ATCG	2	8	107370	107377	25 %	25 %	25 %	25 %	21492865
2195	NC_004041	TCA	2	6	107446	107451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492865
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2232	NC_004041	CCA	2	6	109031	109036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492865
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2234	NC_004041	TGT	2	6	109104	109109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492865
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2236	NC_004041	GCCG	2	8	109137	109144	0 %	0 %	50 %	50 %	21492865
2237	NC_004041	CGG	2	6	109188	109193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492865
2238	NC_004041	TAC	2	6	109197	109202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492865
2239	NC_004041	CAGC	2	8	109287	109294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2240	NC_004041	GAC	2	6	109308	109313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2241	NC_004041	CGC	2	6	109349	109354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2242	NC_004041	TGC	2	6	109417	109422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_004041	GTC	2	6	109462	109467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_004041	ATC	2	6	109486	109491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492864
2245	NC_004041	GTC	2	6	109498	109503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492864
2246	NC_004041	CTTC	2	8	109713	109720	0 %	50 %	0 %	50 %	21492864
2247	NC_004041	CAAT	2	8	109777	109784	50 %	25 %	0 %	25 %	21492864
2248	NC_004041	GCT	2	6	109910	109915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_004041	CA	3	6	110046	110051	50 %	0 %	0 %	50 %	21492863
2250	NC_004041	GCA	2	6	110129	110134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492863
2251	NC_004041	GT	3	6	110146	110151	0 %	50 %	50 %	0 %	21492863
2252	NC_004041	GCA	2	6	110202	110207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492863
2253	NC_004041	TGC	2	6	110285	110290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492863
2254	NC_004041	GCG	2	6	110318	110323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492863
2255	NC_004041	GAGACG	2	12	110400	110411	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21492863
2256	NC_004041	GAC	2	6	110412	110417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492863
2257	NC_004041	GAG	2	6	110476	110481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492863
2258	NC_004041	C	7	7	110514	110520	0 %	0 %	0 %	100 %	21492863
2259	NC_004041	ATCG	2	8	110668	110675	25 %	25 %	25 %	25 %	21492863
2260	NC_004041	GCG	2	6	110736	110741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492863
2261	NC_004041	ACG	2	6	110804	110809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492863
2262	NC_004041	ATG	2	6	110848	110853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492863
2263	NC_004041	GAT	2	6	110951	110956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492863
2264	NC_004041	CTAT	2	8	111063	111070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2265	NC_004041	GCGA	2	8	111136	111143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2266	NC_004041	TC	3	6	111193	111198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2267	NC_004041	ATC	2	6	111224	111229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2268	NC_004041	CCT	2	6	111267	111272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2269	NC_004041	ATG	2	6	111305	111310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2270	NC_004041	AGGCA	2	10	111384	111393	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2271	NC_004041	AGC	2	6	111431	111436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2272	NC_004041	CTG	2	6	111471	111476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2273	NC_004041	GC	3	6	111553	111558	0 %	0 %	50 %	50 %	21492862
2274	NC_004041	CGG	2	6	111570	111575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492862
2275	NC_004041	ATCC	2	8	111663	111670	25 %	25 %	0 %	50 %	21492862
2276	NC_004041	TGGC	2	8	111683	111690	0 %	25 %	50 %	25 %	21492862
2277	NC_004041	CGC	2	6	111695	111700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492862
2278	NC_004041	GTC	2	6	111795	111800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492862
2279	NC_004041	GC	3	6	111803	111808	0 %	0 %	50 %	50 %	21492862
2280	NC_004041	CCG	2	6	111811	111816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492862
2281	NC_004041	GCGG	2	8	112003	112010	0 %	0 %	75 %	25 %	21492861
2282	NC_004041	TGG	2	6	112028	112033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492861
2283	NC_004041	CTG	2	6	112084	112089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492861
2284	NC_004041	GCTCA	2	10	112127	112136	20 %	20 %	20 %	40 %	21492861
2285	NC_004041	GCC	2	6	112189	112194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492861
2286	NC_004041	TTG	2	6	112200	112205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492861
2287	NC_004041	GCG	2	6	112217	112222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2288	NC_004041	CGC	2	6	112288	112293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492860
2289	NC_004041	GAT	2	6	112311	112316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492860
2290	NC_004041	GC	3	6	112362	112367	0 %	0 %	50 %	50 %	21492860
2291	NC_004041	CGA	2	6	112421	112426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492860
2292	NC_004041	CGGC	2	8	112478	112485	0 %	0 %	50 %	50 %	21492860
2293	NC_004041	GAT	2	6	112515	112520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492860
2294	NC_004041	AGC	2	6	112522	112527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492860
2295	NC_004041	GTG	2	6	112665	112670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492860
2296	NC_004041	CGT	2	6	112748	112753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492860
2297	NC_004041	CGG	2	6	112782	112787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492860
2298	NC_004041	CCGCGC	2	12	112831	112842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492860
2299	NC_004041	CAT	2	6	112844	112849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492860
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2301	NC_004041	ATGG	2	8	112985	112992	25 %	25 %	50 %	0 %	21492860
2302	NC_004041	AAG	2	6	113046	113051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492860
2303	NC_004041	GACGA	2	10	113070	113079	40 %	0 %	40 %	20 %	21492860
2304	NC_004041	CGGATC	2	12	113099	113110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21492860
2305	NC_004041	GAT	2	6	113145	113150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492860
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2312	NC_004041	CTG	2	6	113491	113496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492860
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2316	NC_004041	AATC	2	8	113945	113952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2317	NC_004041	GCT	2	6	113984	113989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2318	NC_004041	GA	3	6	114035	114040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2319	NC_004041	AG	3	6	114175	114180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2320	NC_004041	CGA	2	6	114219	114224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2321	NC_004041	CTA	2	6	114236	114241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2322	NC_004041	TCG	2	6	114283	114288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2323	NC_004041	CTT	2	6	114309	114314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2324	NC_004041	AGA	2	6	114350	114355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2325	NC_004041	TGA	2	6	114372	114377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2326	NC_004041	TGC	2	6	114393	114398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2327	NC_004041	TGT	2	6	114410	114415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2328	NC_004041	CG	3	6	114422	114427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2329	NC_004041	GGC	2	6	114458	114463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2330	NC_004041	GA	3	6	114464	114469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2331	NC_004041	CCG	2	6	114575	114580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2332	NC_004041	A	6	6	114589	114594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2333	NC_004041	CTT	2	6	114721	114726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2334	NC_004041	GCG	2	6	114739	114744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2335	NC_004041	TTTG	2	8	114889	114896	0 %	75 %	25 %	0 %	21492859
2336	NC_004041	GC	3	6	114897	114902	0 %	0 %	50 %	50 %	21492859
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2341	NC_004041	GCG	2	6	115287	115292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492859
2342	NC_004041	ACT	2	6	115299	115304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492859
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2344	NC_004041	AGAT	2	8	115497	115504	50 %	25 %	25 %	0 %	21492859
2345	NC_004041	AAC	2	6	115594	115599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2346	NC_004041	A	6	6	115604	115609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2347	NC_004041	GTTC	2	8	115642	115649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2348	NC_004041	TCG	2	6	115718	115723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2349	NC_004041	GGC	2	6	115794	115799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255332
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2351	NC_004041	GCTT	2	8	115829	115836	0 %	50 %	25 %	25 %	89255332
2352	NC_004041	TTC	2	6	115865	115870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255332
2353	NC_004041	GCG	2	6	116002	116007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255332
2354	NC_004041	GCA	2	6	116072	116077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
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2356	NC_004041	CGGA	2	8	116309	116316	25 %	0 %	50 %	25 %	89255332
2357	NC_004041	AGC	2	6	116321	116326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2358	NC_004041	CTG	2	6	116396	116401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2359	NC_004041	CGA	2	6	116510	116515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
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2361	NC_004041	TCGA	2	8	116641	116648	25 %	25 %	25 %	25 %	89255332
2362	NC_004041	CAG	2	6	116692	116697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2363	NC_004041	GCA	2	6	116923	116928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2364	NC_004041	GGC	2	6	117015	117020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255332
2365	NC_004041	GA	3	6	117129	117134	50 %	0 %	50 %	0 %	89255332
2366	NC_004041	GGAT	2	8	117245	117252	25 %	25 %	50 %	0 %	89255332
2367	NC_004041	GAACGC	2	12	117256	117267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2368	NC_004041	GGA	3	9	117276	117284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255332
2369	NC_004041	TC	3	6	117344	117349	0 %	50 %	0 %	50 %	89255332
2370	NC_004041	GA	4	8	117423	117430	50 %	0 %	50 %	0 %	89255332
2371	NC_004041	CGA	2	6	117444	117449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255332
2372	NC_004041	GAT	2	6	117499	117504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255332
2373	NC_004041	GCC	2	6	117529	117534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255332
2374	NC_004041	GGA	2	6	117540	117545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255332
2375	NC_004041	GCC	2	6	117553	117558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255332
2376	NC_004041	ACGGTC	2	12	117571	117582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89255332
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2491	NC_004041	CAACT	2	10	122665	122674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2492	NC_004041	TGCTC	2	10	122778	122787	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2493	NC_004041	TTC	2	6	122867	122872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2500	NC_004041	AGCC	2	8	123238	123245	25 %	0 %	25 %	50 %	89255333

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