MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_004041	GTC	2	6	368407	368412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255406
7502	NC_004041	CCG	2	6	368462	368467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255406
7503	NC_004041	AGTTCA	2	12	368579	368590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89255406
7504	NC_004041	TGG	2	6	368648	368653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255406
7505	NC_004041	GAC	2	6	368706	368711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255406
7506	NC_004041	ACG	2	6	368819	368824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255406
7507	NC_004041	A	6	6	368842	368847	100 %	0 %	0 %	0 %	89255406
7508	NC_004041	CCT	2	6	368879	368884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7509	NC_004041	CAC	2	6	368891	368896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7510	NC_004041	TCA	2	6	368913	368918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_004041	GCT	2	6	368919	368924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_004041	CGA	2	6	368992	368997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492966
7513	NC_004041	GAG	2	6	369057	369062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492966
7514	NC_004041	GCG	2	6	369068	369073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492966
7515	NC_004041	TGAAC	2	10	369098	369107	40 %	20 %	20 %	20 %	21492966
7516	NC_004041	CGT	2	6	369109	369114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492966
7517	NC_004041	CTT	2	6	369165	369170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492966
7518	NC_004041	CATC	2	8	369172	369179	25 %	25 %	0 %	50 %	21492966
7519	NC_004041	CAG	2	6	369192	369197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492966
7520	NC_004041	CCG	2	6	369260	369265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492966
7521	NC_004041	GC	3	6	369269	369274	0 %	0 %	50 %	50 %	21492966
7522	NC_004041	GTT	2	6	369306	369311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492966
7523	NC_004041	GACG	2	8	369320	369327	25 %	0 %	50 %	25 %	21492966
7524	NC_004041	GTTG	2	8	369332	369339	0 %	50 %	50 %	0 %	21492966
7525	NC_004041	CA	3	6	369403	369408	50 %	0 %	0 %	50 %	21492966
7526	NC_004041	TTG	2	6	369490	369495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492966
7527	NC_004041	CCCTC	2	10	369499	369508	0 %	20 %	0 %	80 %	21492966
7528	NC_004041	GCA	2	6	369560	369565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492966
7529	NC_004041	TGC	2	6	369617	369622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492966
7530	NC_004041	GGA	2	6	369626	369631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492966
7531	NC_004041	CGT	2	6	369646	369651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492966
7532	NC_004041	GC	3	6	369699	369704	0 %	0 %	50 %	50 %	21492966
7533	NC_004041	AGAGCA	2	12	369760	369771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21492966
7534	NC_004041	AAAAG	2	10	369896	369905	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_004041	CGT	2	6	369923	369928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_004041	CTG	2	6	370026	370031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_004041	GA	3	6	370038	370043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_004041	GCG	2	6	370078	370083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492965
7539	NC_004041	GCG	2	6	370105	370110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492965
7540	NC_004041	GGC	2	6	370114	370119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492965
7541	NC_004041	GA	3	6	370165	370170	50 %	0 %	50 %	0 %	21492965
7542	NC_004041	CCG	2	6	370176	370181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492965
7543	NC_004041	ATTG	2	8	370276	370283	25 %	50 %	25 %	0 %	21492965
7544	NC_004041	GGCG	2	8	370327	370334	0 %	0 %	75 %	25 %	21492965
7545	NC_004041	GCG	2	6	370342	370347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492965
7546	NC_004041	TGG	2	6	370362	370367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492965
7547	NC_004041	CGA	2	6	370426	370431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492965
7548	NC_004041	CCT	2	6	370471	370476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492965
7549	NC_004041	GGC	2	6	370516	370521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492965
7550	NC_004041	GA	3	6	370523	370528	50 %	0 %	50 %	0 %	21492965
7551	NC_004041	AG	3	6	370549	370554	50 %	0 %	50 %	0 %	21492965
7552	NC_004041	CGG	2	6	370568	370573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492965
7553	NC_004041	TTA	2	6	370587	370592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492965
7554	NC_004041	CTG	2	6	370593	370598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492965
7555	NC_004041	GAC	2	6	370630	370635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492965
7556	NC_004041	CG	3	6	370671	370676	0 %	0 %	50 %	50 %	21492965
7557	NC_004041	A	6	6	370770	370775	100 %	0 %	0 %	0 %	21492965
7558	NC_004041	TGC	2	6	370786	370791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492965
7559	NC_004041	AGC	2	6	370800	370805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492965
7560	NC_004041	GAA	2	6	370897	370902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492965
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7562	NC_004041	CG	3	6	370971	370976	0 %	0 %	50 %	50 %	21492965
7563	NC_004041	TGG	2	6	371013	371018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492965
7564	NC_004041	TGC	2	6	371086	371091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492965
7565	NC_004041	TCA	2	6	371127	371132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492965
7566	NC_004041	GAT	2	6	371200	371205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492965
7567	NC_004041	GTT	2	6	371212	371217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492965

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.