MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 7567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004041	C	6	6	221913	221918	0 %	0 %	0 %	100 %	89255364
4502	NC_004041	TCGA	2	8	222147	222154	25 %	25 %	25 %	25 %	21492759
4503	NC_004041	CGG	2	6	222177	222182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492759
4504	NC_004041	CCA	2	6	222211	222216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492759
4505	NC_004041	GAC	2	6	222233	222238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492759
4506	NC_004041	CCA	2	6	222330	222335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492759
4507	NC_004041	CGG	3	9	222366	222374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492759
4508	NC_004041	CGC	2	6	222466	222471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492759
4509	NC_004041	CG	3	6	222511	222516	0 %	0 %	50 %	50 %	21492759
4510	NC_004041	CGG	2	6	222550	222555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492759
4511	NC_004041	GCA	2	6	222567	222572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492759
4512	NC_004041	TCG	2	6	222633	222638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492759
4513	NC_004041	CGC	2	6	222644	222649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492759
4514	NC_004041	ACG	2	6	222655	222660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492759
4515	NC_004041	GCGA	2	8	222748	222755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_004041	ACTG	2	8	222810	222817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_004041	CTT	2	6	222829	222834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_004041	CGG	2	6	222859	222864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_004041	TGT	2	6	222940	222945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_004041	A	6	6	223020	223025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_004041	GGA	2	6	223039	223044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_004041	GGCG	2	8	223100	223107	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_004041	TGC	2	6	223160	223165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255365
4524	NC_004041	CGC	2	6	223285	223290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255365
4525	NC_004041	GTCCGG	2	12	223296	223307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	89255365
4526	NC_004041	GTG	2	6	223348	223353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255365
4527	NC_004041	AG	3	6	223377	223382	50 %	0 %	50 %	0 %	89255365
4528	NC_004041	CGCCA	2	10	223419	223428	20 %	0 %	20 %	60 %	89255365
4529	NC_004041	AT	3	6	223437	223442	50 %	50 %	0 %	0 %	89255365
4530	NC_004041	CAT	2	6	223467	223472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255365
4531	NC_004041	CGT	2	6	223574	223579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255365
4532	NC_004041	GAC	2	6	223640	223645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255365
4533	NC_004041	TG	3	6	223697	223702	0 %	50 %	50 %	0 %	89255365
4534	NC_004041	TGG	2	6	223784	223789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255365
4535	NC_004041	TCT	2	6	223846	223851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255365
4536	NC_004041	CCT	2	6	223878	223883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255365
4537	NC_004041	GCA	2	6	223926	223931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255365
4538	NC_004041	CGC	2	6	223935	223940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255365
4539	NC_004041	CTT	2	6	224001	224006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255365
4540	NC_004041	TTG	2	6	224187	224192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255365
4541	NC_004041	CCA	2	6	224214	224219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255365
4542	NC_004041	TGGA	2	8	224231	224238	25 %	25 %	50 %	0 %	89255365
4543	NC_004041	CG	3	6	224240	224245	0 %	0 %	50 %	50 %	89255365
4544	NC_004041	CCT	2	6	224296	224301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255365
4545	NC_004041	GCT	2	6	224321	224326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255365
4546	NC_004041	GCA	2	6	224332	224337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255365
4547	NC_004041	CT	3	6	224374	224379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_004041	GAAT	2	8	224437	224444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_004041	GTT	2	6	224488	224493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_004041	CGG	2	6	224533	224538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_004041	CCA	2	6	224580	224585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_004041	GCC	2	6	224602	224607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_004041	AAG	2	6	224628	224633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_004041	GTG	2	6	224652	224657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_004041	GAC	2	6	224665	224670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_004041	TGC	2	6	224703	224708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492757
4557	NC_004041	TGA	2	6	224717	224722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492757
4558	NC_004041	ATC	2	6	224727	224732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492757
4559	NC_004041	AGC	3	9	224803	224811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492757
4560	NC_004041	CGT	3	9	224834	224842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492757
4561	NC_004041	CGA	2	6	224855	224860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492757
4562	NC_004041	CCG	2	6	224868	224873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492757
4563	NC_004041	TGC	2	6	224929	224934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492757
4564	NC_004041	GCC	2	6	225041	225046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492757
4565	NC_004041	CACGC	2	10	225226	225235	20 %	0 %	20 %	60 %	21492756
4566	NC_004041	GAA	2	6	225257	225262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492756
4567	NC_004041	GCCTCG	2	12	225277	225288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21492756
4568	NC_004041	GAT	2	6	225336	225341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492756
4569	NC_004041	ACC	2	6	225363	225368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492756
4570	NC_004041	GAGG	2	8	225381	225388	25 %	0 %	75 %	0 %	21492756
4571	NC_004041	ACCTTC	2	12	225442	225453	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21492756
4572	NC_004041	TTC	2	6	225462	225467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492756
4573	NC_004041	CTT	2	6	225563	225568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492756
4574	NC_004041	CCG	2	6	225575	225580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492756
4575	NC_004041	GCCC	2	8	225669	225676	0 %	0 %	25 %	75 %	21492756
4576	NC_004041	TTC	2	6	225730	225735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492756
4577	NC_004041	ATC	2	6	225802	225807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492756
4578	NC_004041	GCA	2	6	225812	225817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492756
4579	NC_004041	ATCGGC	2	12	225819	225830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21492756
4580	NC_004041	TCA	2	6	225857	225862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492756
4581	NC_004041	GTC	2	6	225864	225869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492756
4582	NC_004041	GGT	2	6	225877	225882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_004041	AAG	2	6	225972	225977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_004041	AT	4	8	225984	225991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_004041	GGC	2	6	226112	226117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_004041	GAA	2	6	226248	226253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_004041	T	7	7	226275	226281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_004041	TCT	2	6	226367	226372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_004041	TAC	2	6	226525	226530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492755
4590	NC_004041	TCG	2	6	226553	226558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492755
4591	NC_004041	A	6	6	226574	226579	100 %	0 %	0 %	0 %	21492755
4592	NC_004041	CGA	2	6	226671	226676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492755
4593	NC_004041	TGC	2	6	226682	226687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492755
4594	NC_004041	ATG	2	6	226742	226747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_004041	CTG	2	6	226801	226806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_004041	GTG	2	6	226819	226824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492754
4597	NC_004041	CCG	3	9	226840	226848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492754
4598	NC_004041	CGT	2	6	226854	226859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492754
4599	NC_004041	AGA	2	6	226871	226876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492754
4600	NC_004041	GATCG	2	10	226915	226924	20 %	20 %	40 %	20 %	21492754
4601	NC_004041	TGG	2	6	226931	226936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492754
4602	NC_004041	GAT	2	6	226944	226949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492754
4603	NC_004041	CTT	2	6	226971	226976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492754
4604	NC_004041	GTC	2	6	227133	227138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492754
4605	NC_004041	TGA	2	6	227163	227168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492754
4606	NC_004041	CGC	2	6	227192	227197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_004041	CT	3	6	227257	227262	0 %	50 %	0 %	50 %	89255366
4608	NC_004041	GCTC	2	8	227342	227349	0 %	25 %	25 %	50 %	89255366
4609	NC_004041	AAACC	2	10	227387	227396	60 %	0 %	0 %	40 %	89255366
4610	NC_004041	GGA	2	6	227410	227415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255366
4611	NC_004041	GAT	2	6	227421	227426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255366
4612	NC_004041	TTCC	2	8	227445	227452	0 %	50 %	0 %	50 %	89255366
4613	NC_004041	CGT	2	6	227468	227473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255366
4614	NC_004041	TGA	2	6	227488	227493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255366
4615	NC_004041	TAA	2	6	227502	227507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255366
4616	NC_004041	AGT	2	6	227516	227521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255366
4617	NC_004041	GACA	2	8	227578	227585	50 %	0 %	25 %	25 %	89255366
4618	NC_004041	TTG	2	6	227596	227601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_004041	TCT	2	6	227612	227617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_004041	TCC	2	6	227675	227680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255367
4621	NC_004041	AAG	2	6	227734	227739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255367
4622	NC_004041	GGC	2	6	227745	227750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255367
4623	NC_004041	TC	3	6	227835	227840	0 %	50 %	0 %	50 %	89255367
4624	NC_004041	TCGCG	2	10	227949	227958	0 %	20 %	40 %	40 %	89255367
4625	NC_004041	CAA	2	6	227962	227967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255367
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4880	NC_004041	CTC	2	6	240193	240198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492738
4881	NC_004041	GCC	2	6	240213	240218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492738
4882	NC_004041	GAA	2	6	240221	240226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492738
4883	NC_004041	GCT	2	6	240314	240319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492738
4884	NC_004041	CGT	2	6	240368	240373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492738
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4903	NC_004041	CTG	2	6	241015	241020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492738
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4917	NC_004041	ACCG	2	8	241725	241732	25 %	0 %	25 %	50 %	21492737
4918	NC_004041	GCT	2	6	241787	241792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492737
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4922	NC_004041	CAA	2	6	242032	242037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492737
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4928	NC_004041	TGCC	2	8	242392	242399	0 %	25 %	25 %	50 %	21492737
4929	NC_004041	CTG	2	6	242400	242405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492737
4930	NC_004041	TTC	2	6	242424	242429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492737
4931	NC_004041	TCA	2	6	242527	242532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492737
4932	NC_004041	GC	4	8	242577	242584	0 %	0 %	50 %	50 %	21492737
4933	NC_004041	GA	3	6	242597	242602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4934	NC_004041	TA	3	6	243007	243012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4935	NC_004041	GCAA	2	8	243016	243023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4936	NC_004041	GCCC	2	8	243072	243079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4937	NC_004041	CTG	2	6	243116	243121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4938	NC_004041	CGCAG	2	10	243143	243152	20 %	0 %	40 %	40 %	89255370
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4940	NC_004041	CCCG	2	8	243187	243194	0 %	0 %	25 %	75 %	89255370
4941	NC_004041	CGT	2	6	243216	243221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4942	NC_004041	CT	3	6	243229	243234	0 %	50 %	0 %	50 %	89255370
4943	NC_004041	GTT	2	6	243265	243270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255370
4944	NC_004041	C	6	6	243315	243320	0 %	0 %	0 %	100 %	89255370
4945	NC_004041	CGA	2	6	243377	243382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4946	NC_004041	ATT	2	6	243423	243428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255370
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4949	NC_004041	ATCG	3	12	243525	243536	25 %	25 %	25 %	25 %	89255370
4950	NC_004041	ACG	2	6	243545	243550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370
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4952	NC_004041	AG	3	6	243672	243677	50 %	0 %	50 %	0 %	89255370
4953	NC_004041	ATC	2	6	243691	243696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255370
4954	NC_004041	GC	3	6	243707	243712	0 %	0 %	50 %	50 %	89255370
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4958	NC_004041	GC	3	6	243996	244001	0 %	0 %	50 %	50 %	89255370
4959	NC_004041	CGCC	2	8	244061	244068	0 %	0 %	25 %	75 %	89255370
4960	NC_004041	CTG	2	6	244081	244086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
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4966	NC_004041	TCG	2	6	244492	244497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
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4970	NC_004041	CGGG	2	8	244586	244593	0 %	0 %	75 %	25 %	89255370
4971	NC_004041	GCATC	2	10	244788	244797	20 %	20 %	20 %	40 %	89255370
4972	NC_004041	TGG	2	6	244860	244865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4973	NC_004041	ATGGC	2	10	244975	244984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4974	NC_004041	GAT	2	6	245040	245045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492734
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4979	NC_004041	CATG	2	8	245229	245236	25 %	25 %	25 %	25 %	21492734
4980	NC_004041	GCC	2	6	245306	245311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492734
4981	NC_004041	GTC	2	6	245317	245322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
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4984	NC_004041	CGT	2	6	245635	245640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
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4986	NC_004041	CAT	2	6	245715	245720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492734
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4989	NC_004041	TAAA	2	8	245777	245784	75 %	25 %	0 %	0 %	21492734
4990	NC_004041	G	6	6	245798	245803	0 %	0 %	100 %	0 %	21492734
4991	NC_004041	CTA	2	6	245853	245858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492734
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4993	NC_004041	GAT	2	6	245986	245991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492734
4994	NC_004041	GA	3	6	246026	246031	50 %	0 %	50 %	0 %	21492734
4995	NC_004041	AGC	2	6	246132	246137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4996	NC_004041	GTCGCG	2	12	246157	246168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21492734
4997	NC_004041	TCG	2	6	246235	246240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4998	NC_004041	CAT	2	6	246321	246326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492734
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5000	NC_004041	CGC	2	6	246465	246470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492734

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