MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003911	CCA	2	6	159349	159354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695069
3502	NC_003911	CCA	3	9	159397	159405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695069
3503	NC_003911	CG	4	8	159434	159441	0 %	0 %	50 %	50 %	56695069
3504	NC_003911	ACC	2	6	159471	159476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695069
3505	NC_003911	GGGC	2	8	159477	159484	0 %	0 %	75 %	25 %	56695069
3506	NC_003911	AGCG	2	8	159513	159520	25 %	0 %	50 %	25 %	56695069
3507	NC_003911	ACC	3	9	159534	159542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695069
3508	NC_003911	GCA	2	6	159553	159558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3509	NC_003911	CAG	2	6	159617	159622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3510	NC_003911	TCG	2	6	159696	159701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3511	NC_003911	CGG	2	6	159765	159770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695069
3512	NC_003911	CGG	2	6	159801	159806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695069
3513	NC_003911	TCG	2	6	159813	159818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3514	NC_003911	ATG	2	6	159828	159833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695069
3515	NC_003911	GAT	2	6	159848	159853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695069
3516	NC_003911	CGG	2	6	159862	159867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695069
3517	NC_003911	GCA	2	6	159925	159930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3518	NC_003911	GCA	2	6	159940	159945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3519	NC_003911	GCCCA	2	10	160020	160029	20 %	0 %	20 %	60 %	56695069
3520	NC_003911	CGC	2	6	160041	160046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695069
3521	NC_003911	CGG	2	6	160067	160072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695069
3522	NC_003911	TCC	2	6	160089	160094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695069
3523	NC_003911	CGC	2	6	160150	160155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695069
3524	NC_003911	CAC	2	6	160157	160162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695069
3525	NC_003911	GGC	2	6	160198	160203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695069
3526	NC_003911	CGA	2	6	160225	160230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3527	NC_003911	GCGG	2	8	160232	160239	0 %	0 %	75 %	25 %	56695069
3528	NC_003911	GCA	2	6	160291	160296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695069
3529	NC_003911	CGC	2	6	160315	160320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695069
3530	NC_003911	GGC	3	9	160358	160366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695069
3531	NC_003911	GCGG	2	8	160402	160409	0 %	0 %	75 %	25 %	56695069
3532	NC_003911	GC	3	6	160570	160575	0 %	0 %	50 %	50 %	56695069
3533	NC_003911	GGCG	2	8	160580	160587	0 %	0 %	75 %	25 %	56695069
3534	NC_003911	GC	3	6	160636	160641	0 %	0 %	50 %	50 %	56695069
3535	NC_003911	GCGCG	2	10	160661	160670	0 %	0 %	60 %	40 %	56695069
3536	NC_003911	GAT	2	6	160739	160744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695069
3537	NC_003911	GCG	2	6	160791	160796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695070
3538	NC_003911	CGC	2	6	160838	160843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695070
3539	NC_003911	CCA	2	6	160894	160899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695070
3540	NC_003911	GGC	2	6	161026	161031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695070
3541	NC_003911	GCA	2	6	161041	161046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695070
3542	NC_003911	GCGG	2	8	161074	161081	0 %	0 %	75 %	25 %	56695070
3543	NC_003911	CAC	2	6	161159	161164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695070
3544	NC_003911	CTCGGC	2	12	161189	161200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56695070
3545	NC_003911	CATGGC	2	12	161251	161262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56695070
3546	NC_003911	CG	3	6	161264	161269	0 %	0 %	50 %	50 %	56695070
3547	NC_003911	C	7	7	161300	161306	0 %	0 %	0 %	100 %	56695070
3548	NC_003911	CAG	2	6	161315	161320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695070
3549	NC_003911	GCG	2	6	161335	161340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695070
3550	NC_003911	CAT	2	6	161351	161356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695070
3551	NC_003911	ACATC	2	10	161389	161398	40 %	20 %	0 %	40 %	56695070
3552	NC_003911	CGAC	2	8	161422	161429	25 %	0 %	25 %	50 %	56695070
3553	NC_003911	GGT	2	6	161492	161497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695070
3554	NC_003911	GAG	2	6	161592	161597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_003911	GCG	2	6	161633	161638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695071
3556	NC_003911	CG	3	6	161672	161677	0 %	0 %	50 %	50 %	56695071
3557	NC_003911	GCG	3	9	161762	161770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695071
3558	NC_003911	G	6	6	161798	161803	0 %	0 %	100 %	0 %	56695071
3559	NC_003911	ACC	2	6	161881	161886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695071
3560	NC_003911	CGG	2	6	161887	161892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695071
3561	NC_003911	GCC	2	6	162072	162077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695071
3562	NC_003911	GCT	2	6	162110	162115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695071
3563	NC_003911	CCGGG	2	10	162170	162179	0 %	0 %	60 %	40 %	56695071
3564	NC_003911	CGC	2	6	162184	162189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695071
3565	NC_003911	CGC	3	9	162209	162217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695071
3566	NC_003911	GCC	2	6	162370	162375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695071
3567	NC_003911	GC	3	6	162436	162441	0 %	0 %	50 %	50 %	56695071
3568	NC_003911	AAC	2	6	162500	162505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_003911	ATC	2	6	162537	162542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695072
3570	NC_003911	TCA	2	6	162679	162684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695072
3571	NC_003911	GCC	2	6	162705	162710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695072
3572	NC_003911	GCC	2	6	162777	162782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695072
3573	NC_003911	ATC	2	6	162813	162818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695072
3574	NC_003911	TCA	2	6	162877	162882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695072
3575	NC_003911	CGG	2	6	162886	162891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695072
3576	NC_003911	CGG	2	6	162944	162949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695072
3577	NC_003911	TGG	2	6	162970	162975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695072
3578	NC_003911	CAAGTC	2	12	162977	162988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56695072
3579	NC_003911	ACCTGA	2	12	162994	163005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56695072
3580	NC_003911	GC	3	6	163037	163042	0 %	0 %	50 %	50 %	56695072
3581	NC_003911	AAG	2	6	163071	163076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695072
3582	NC_003911	AGA	2	6	163105	163110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695072
3583	NC_003911	GAT	2	6	163124	163129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695072
3584	NC_003911	AGG	2	6	163147	163152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695072
3585	NC_003911	GCT	2	6	163190	163195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695072
3586	NC_003911	GAAG	2	8	163241	163248	50 %	0 %	50 %	0 %	56695072
3587	NC_003911	GCGG	2	8	163271	163278	0 %	0 %	75 %	25 %	56695072
3588	NC_003911	CGG	2	6	163354	163359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_003911	GCC	2	6	163377	163382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_003911	GAACC	2	10	163489	163498	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3591	NC_003911	GCA	2	6	163536	163541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695073
3592	NC_003911	GC	3	6	163544	163549	0 %	0 %	50 %	50 %	56695073
3593	NC_003911	CAA	2	6	163577	163582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695073
3594	NC_003911	CCG	2	6	163586	163591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695073
3595	NC_003911	GC	3	6	163670	163675	0 %	0 %	50 %	50 %	56695073
3596	NC_003911	GTC	2	6	163754	163759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695073
3597	NC_003911	T	6	6	163838	163843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_003911	GCA	2	6	163854	163859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_003911	GA	3	6	163881	163886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_003911	CAT	2	6	163913	163918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_003911	G	6	6	163978	163983	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_003911	AAGG	2	8	164028	164035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_003911	GCT	2	6	164081	164086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_003911	GT	3	6	164111	164116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_003911	TGTC	2	8	164189	164196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_003911	CAA	2	6	164270	164275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_003911	TAA	2	6	164285	164290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_003911	CG	3	6	164592	164597	0 %	0 %	50 %	50 %	56695074
3609	NC_003911	CGCTGC	4	24	164606	164629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56695074
3610	NC_003911	CGG	2	6	164632	164637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695074
3611	NC_003911	GGC	2	6	164702	164707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695074
3612	NC_003911	GAGG	2	8	164793	164800	25 %	0 %	75 %	0 %	56695074
3613	NC_003911	TGG	2	6	164831	164836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695074
3614	NC_003911	ATGC	2	8	164862	164869	25 %	25 %	25 %	25 %	56695074
3615	NC_003911	CGG	2	6	164923	164928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695074
3616	NC_003911	GAT	2	6	164972	164977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695074
3617	NC_003911	TGG	2	6	165016	165021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695074
3618	NC_003911	ATG	2	6	165022	165027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695074
3619	NC_003911	TGG	2	6	165088	165093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695074
3620	NC_003911	ATC	2	6	165108	165113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695074
3621	NC_003911	CG	3	6	165126	165131	0 %	0 %	50 %	50 %	56695074
3622	NC_003911	TGG	3	9	165187	165195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695074
3623	NC_003911	CAC	2	6	165260	165265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695074
3624	NC_003911	CTTTGC	2	12	165362	165373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56695074
3625	NC_003911	GC	3	6	165434	165439	0 %	0 %	50 %	50 %	56695074
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3877	NC_003911	CG	3	6	177719	177724	0 %	0 %	50 %	50 %	56695083
3878	NC_003911	GCTGT	2	10	177733	177742	0 %	40 %	40 %	20 %	56695083
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3997	NC_003911	TCG	2	6	183803	183808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695087
3998	NC_003911	GAT	2	6	183823	183828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695087
3999	NC_003911	GGC	2	6	183844	183849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695087
4000	NC_003911	GC	3	6	183856	183861	0 %	0 %	50 %	50 %	56695087

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