MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_003911	GCG	2	6	810213	810218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695679
18004	NC_003911	CGCTGG	2	12	810250	810261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56695679
18005	NC_003911	CTG	2	6	810270	810275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695679
18006	NC_003911	GGC	2	6	810278	810283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695679
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18008	NC_003911	TGC	2	6	810364	810369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695679
18009	NC_003911	CTG	2	6	810396	810401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695679
18010	NC_003911	GCCC	2	8	810402	810409	0 %	0 %	25 %	75 %	56695679
18011	NC_003911	CG	3	6	810517	810522	0 %	0 %	50 %	50 %	56695679
18012	NC_003911	GC	3	6	810523	810528	0 %	0 %	50 %	50 %	56695679
18013	NC_003911	CGG	2	6	810540	810545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695679
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18015	NC_003911	GCGA	2	8	810567	810574	25 %	0 %	50 %	25 %	56695679
18016	NC_003911	GCA	2	6	810578	810583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695679
18017	NC_003911	CG	3	6	810612	810617	0 %	0 %	50 %	50 %	56695679
18018	NC_003911	GCGG	2	8	810618	810625	0 %	0 %	75 %	25 %	56695679
18019	NC_003911	GCC	2	6	810633	810638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695679
18020	NC_003911	GCC	2	6	810746	810751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695680
18021	NC_003911	GGC	2	6	810778	810783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695680
18022	NC_003911	TGG	2	6	810827	810832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695680
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18025	NC_003911	CG	3	6	810957	810962	0 %	0 %	50 %	50 %	56695680
18026	NC_003911	ATC	2	6	810988	810993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695680
18027	NC_003911	CGC	2	6	811008	811013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695680
18028	NC_003911	CGG	2	6	811037	811042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695680
18029	NC_003911	GCC	3	9	811045	811053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695680
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18032	NC_003911	CAC	2	6	811179	811184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695680
18033	NC_003911	CTG	2	6	811222	811227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695680
18034	NC_003911	GGCG	2	8	811231	811238	0 %	0 %	75 %	25 %	56695680
18035	NC_003911	TGC	2	6	811289	811294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695680
18036	NC_003911	GCCTC	2	10	811313	811322	0 %	20 %	20 %	60 %	56695680
18037	NC_003911	GGT	2	6	811323	811328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695680
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18044	NC_003911	ACC	2	6	811609	811614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695680
18045	NC_003911	TCGG	2	8	811660	811667	0 %	25 %	50 %	25 %	56695680
18046	NC_003911	CGG	3	9	811713	811721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695680
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18056	NC_003911	CCAG	2	8	812099	812106	25 %	0 %	25 %	50 %	56695680
18057	NC_003911	CGC	2	6	812130	812135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695680
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18063	NC_003911	CGC	2	6	812303	812308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18065	NC_003911	GGC	2	6	812393	812398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18080	NC_003911	ATC	2	6	812924	812929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695681
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18090	NC_003911	CAG	2	6	813568	813573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695682
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18101	NC_003911	GCG	2	6	814096	814101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695682
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18103	NC_003911	ACCA	2	8	814175	814182	50 %	0 %	0 %	50 %	56695683
18104	NC_003911	GA	3	6	814187	814192	50 %	0 %	50 %	0 %	56695683
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18123	NC_003911	CTG	2	6	814967	814972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695683
18124	NC_003911	TGC	2	6	815013	815018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695683
18125	NC_003911	ATC	2	6	815069	815074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695683
18126	NC_003911	GC	3	6	815078	815083	0 %	0 %	50 %	50 %	56695683
18127	NC_003911	CCG	2	6	815180	815185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695684
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18132	NC_003911	TCG	2	6	815330	815335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695684
18133	NC_003911	TGGC	2	8	815337	815344	0 %	25 %	50 %	25 %	56695684
18134	NC_003911	CGC	4	12	815457	815468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695684
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18138	NC_003911	CCG	2	6	815556	815561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695684
18139	NC_003911	CG	3	6	815578	815583	0 %	0 %	50 %	50 %	56695684
18140	NC_003911	GCG	2	6	815627	815632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695684
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18143	NC_003911	CCG	2	6	815669	815674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695684
18144	NC_003911	GCGG	2	8	815875	815882	0 %	0 %	75 %	25 %	56695684
18145	NC_003911	ACG	2	6	815930	815935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695684
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18147	NC_003911	CTTC	2	8	815949	815956	0 %	50 %	0 %	50 %	56695684
18148	NC_003911	TCG	2	6	815972	815977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695684
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18154	NC_003911	ACAGCT	2	12	816241	816252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56695685
18155	NC_003911	GTCG	2	8	816293	816300	0 %	25 %	50 %	25 %	56695685
18156	NC_003911	GTC	2	6	816399	816404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695685
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18181	NC_003911	GACCC	2	10	817426	817435	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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18187	NC_003911	TCG	2	6	817885	817890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695686
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18189	NC_003911	GAT	2	6	817946	817951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695686
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18198	NC_003911	GATC	2	8	818371	818378	25 %	25 %	25 %	25 %	56695687
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18200	NC_003911	CTG	2	6	818396	818401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695687
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18215	NC_003911	CGG	2	6	819086	819091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695688
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18220	NC_003911	GCG	2	6	819323	819328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695688
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18229	NC_003911	CAC	2	6	819684	819689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695689
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18231	NC_003911	TTG	2	6	819748	819753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695689
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18233	NC_003911	CGT	2	6	819861	819866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695689
18234	NC_003911	GC	3	6	819885	819890	0 %	0 %	50 %	50 %	56695689
18235	NC_003911	CGG	3	9	820013	820021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695689
18236	NC_003911	GC	3	6	820031	820036	0 %	0 %	50 %	50 %	56695689
18237	NC_003911	CCA	2	6	820040	820045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695689
18238	NC_003911	CGG	2	6	820173	820178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18239	NC_003911	AGA	2	6	820193	820198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18240	NC_003911	G	6	6	820291	820296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18241	NC_003911	CTT	2	6	820301	820306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18242	NC_003911	TCT	3	9	820317	820325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18243	NC_003911	CCG	2	6	820340	820345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18245	NC_003911	TGA	2	6	820573	820578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695690
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18492	NC_003911	CAG	2	6	830319	830324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695698
18493	NC_003911	GCA	2	6	830390	830395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695698
18494	NC_003911	GCG	2	6	830411	830416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695698
18495	NC_003911	GC	3	6	830424	830429	0 %	0 %	50 %	50 %	56695698
18496	NC_003911	GGC	2	6	830544	830549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695698
18497	NC_003911	CGA	2	6	830553	830558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695698
18498	NC_003911	CAC	2	6	830562	830567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695698
18499	NC_003911	GCC	2	6	830570	830575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695698
18500	NC_003911	GCC	2	6	830616	830621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695698

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