MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_003911	GCT	2	6	680453	680458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15003	NC_003911	CAG	2	6	680469	680474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15004	NC_003911	GCC	2	6	680508	680513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15005	NC_003911	GTG	2	6	680517	680522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695561
15006	NC_003911	CCG	2	6	680746	680751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15007	NC_003911	GAC	2	6	680787	680792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15008	NC_003911	CGG	2	6	680815	680820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695561
15009	NC_003911	ATG	2	6	680859	680864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695561
15010	NC_003911	GAA	2	6	680969	680974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695561
15011	NC_003911	CAT	2	6	681038	681043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695561
15012	NC_003911	CTG	2	6	681111	681116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15013	NC_003911	CGC	2	6	681117	681122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15014	NC_003911	AAG	2	6	681132	681137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695561
15015	NC_003911	AGG	2	6	681142	681147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695561
15016	NC_003911	AAG	2	6	681207	681212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695561
15017	NC_003911	CAA	2	6	681260	681265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695561
15018	NC_003911	CGC	3	9	681272	681280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15019	NC_003911	GGT	2	6	681287	681292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695561
15020	NC_003911	ACC	2	6	681322	681327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695561
15021	NC_003911	GCC	2	6	681431	681436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15022	NC_003911	GC	3	6	681499	681504	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15023	NC_003911	TGG	2	6	681535	681540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695561
15024	NC_003911	GCC	2	6	681547	681552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15025	NC_003911	CCG	2	6	681564	681569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15026	NC_003911	CG	3	6	681583	681588	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15027	NC_003911	CGC	2	6	681590	681595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15028	NC_003911	GAG	2	6	681596	681601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695561
15029	NC_003911	GAG	2	6	681615	681620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695561
15030	NC_003911	CGCC	2	8	681647	681654	0 %	0 %	25 %	75 %	56695561
15031	NC_003911	GAT	2	6	681692	681697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695561
15032	NC_003911	GC	4	8	681699	681706	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15033	NC_003911	GAC	2	6	681837	681842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15034	NC_003911	CCG	2	6	681883	681888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
15035	NC_003911	CGA	2	6	681944	681949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15036	NC_003911	GC	3	6	682008	682013	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15037	NC_003911	CGT	2	6	682043	682048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15038	NC_003911	GCCG	2	8	682050	682057	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15039	NC_003911	GC	3	6	682074	682079	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15040	NC_003911	CTTTGC	2	12	682088	682099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56695561
15041	NC_003911	CCGAC	2	10	682108	682117	20 %	0 %	20 %	60 %	56695561
15042	NC_003911	GTG	2	6	682191	682196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695561
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15044	NC_003911	CGA	2	6	682210	682215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695561
15045	NC_003911	TCGG	2	8	682248	682255	0 %	25 %	50 %	25 %	56695561
15046	NC_003911	CCG	2	6	682258	682263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
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15049	NC_003911	GC	3	6	682368	682373	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15050	NC_003911	GCG	2	6	682377	682382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695561
15051	NC_003911	GC	3	6	682480	682485	0 %	0 %	50 %	50 %	56695561
15052	NC_003911	GTG	2	6	682503	682508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695561
15053	NC_003911	GGCCA	2	10	682557	682566	20 %	0 %	40 %	40 %	56695562
15054	NC_003911	GCG	2	6	682644	682649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695562
15055	NC_003911	CG	3	6	682739	682744	0 %	0 %	50 %	50 %	56695562
15056	NC_003911	TGG	2	6	682810	682815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695562
15057	NC_003911	GCA	2	6	682841	682846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695562
15058	NC_003911	GATGGC	2	12	682890	682901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56695562
15059	NC_003911	GGC	2	6	682908	682913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695562
15060	NC_003911	GCCA	2	8	682918	682925	25 %	0 %	25 %	50 %	56695562
15061	NC_003911	CAC	2	6	682974	682979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695562
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15063	NC_003911	CCA	4	12	683063	683074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695562
15064	NC_003911	TCGGA	2	10	683083	683092	20 %	20 %	40 %	20 %	56695562
15065	NC_003911	CAG	2	6	683103	683108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695562
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15067	NC_003911	CGC	2	6	683184	683189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695562
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15069	NC_003911	CAG	2	6	683230	683235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695562
15070	NC_003911	C	6	6	683242	683247	0 %	0 %	0 %	100 %	56695562
15071	NC_003911	CGC	2	6	683343	683348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695562
15072	NC_003911	CGT	2	6	683373	683378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695562
15073	NC_003911	GCC	2	6	683397	683402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695562
15074	NC_003911	GCG	2	6	683420	683425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695562
15075	NC_003911	TCA	2	6	683426	683431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695562
15076	NC_003911	TCCG	2	8	683452	683459	0 %	25 %	25 %	50 %	56695563
15077	NC_003911	ATCGG	2	10	683499	683508	20 %	20 %	40 %	20 %	56695563
15078	NC_003911	GGGTC	2	10	683512	683521	0 %	20 %	60 %	20 %	56695563
15079	NC_003911	TCGA	2	8	683559	683566	25 %	25 %	25 %	25 %	56695563
15080	NC_003911	CCAT	2	8	683577	683584	25 %	25 %	0 %	50 %	56695563
15081	NC_003911	GGC	2	6	683597	683602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695563
15082	NC_003911	CTC	2	6	683645	683650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695563
15083	NC_003911	CCG	2	6	683689	683694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695563
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15085	NC_003911	GGCA	2	8	683779	683786	25 %	0 %	50 %	25 %	56695563
15086	NC_003911	C	6	6	683836	683841	0 %	0 %	0 %	100 %	56695563
15087	NC_003911	TGG	2	6	683850	683855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695563
15088	NC_003911	TGC	2	6	683928	683933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695563
15089	NC_003911	GGT	2	6	683944	683949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695563
15090	NC_003911	GGTATG	2	12	684020	684031	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56695563
15091	NC_003911	CGG	2	6	684043	684048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695563
15092	NC_003911	GC	3	6	684109	684114	0 %	0 %	50 %	50 %	56695563
15093	NC_003911	TAA	2	6	684120	684125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56695563
15094	NC_003911	CGA	2	6	684238	684243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695563
15095	NC_003911	TCC	2	6	684300	684305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695563
15096	NC_003911	CAT	2	6	684323	684328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695563
15097	NC_003911	GGCG	2	8	684349	684356	0 %	0 %	75 %	25 %	56695563
15098	NC_003911	GGT	2	6	684371	684376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695563
15099	NC_003911	CGCC	2	8	684379	684386	0 %	0 %	25 %	75 %	56695563
15100	NC_003911	CGCA	2	8	684387	684394	25 %	0 %	25 %	50 %	56695563
15101	NC_003911	TCG	2	6	684423	684428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695563
15102	NC_003911	TCA	2	6	684556	684561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695563
15103	NC_003911	GC	3	6	684577	684582	0 %	0 %	50 %	50 %	56695563
15104	NC_003911	GGT	2	6	684635	684640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695563
15105	NC_003911	CGG	2	6	684672	684677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695563
15106	NC_003911	GCC	2	6	684708	684713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695563
15107	NC_003911	GCCTCG	2	12	684741	684752	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56695563
15108	NC_003911	CCA	2	6	684763	684768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695563
15109	NC_003911	ACC	2	6	684826	684831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695563
15110	NC_003911	TGA	2	6	685033	685038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695563
15111	NC_003911	GCA	2	6	685047	685052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695563
15112	NC_003911	GAT	2	6	685055	685060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695563
15113	NC_003911	CCCT	2	8	685077	685084	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15114	NC_003911	CTTT	2	8	685109	685116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15115	NC_003911	A	6	6	685122	685127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_003911	GGC	2	6	685209	685214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695564
15117	NC_003911	GCC	2	6	685240	685245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695564
15118	NC_003911	CCG	2	6	685277	685282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695564
15119	NC_003911	CAC	2	6	685350	685355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695564
15120	NC_003911	CCG	2	6	685386	685391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695564
15121	NC_003911	CCG	2	6	685481	685486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695564
15122	NC_003911	GCC	2	6	685500	685505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695564
15123	NC_003911	GC	3	6	685512	685517	0 %	0 %	50 %	50 %	56695564
15124	NC_003911	GCT	2	6	685551	685556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695564
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15126	NC_003911	GCC	2	6	685671	685676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695564
15127	NC_003911	CGA	2	6	685695	685700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695564
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15140	NC_003911	T	6	6	686156	686161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_003911	ACCA	2	8	686202	686209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15142	NC_003911	GGA	2	6	686210	686215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15235	NC_003911	GACC	2	8	690718	690725	25 %	0 %	25 %	50 %	56695569
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15239	NC_003911	GTCGA	2	10	690930	690939	20 %	20 %	40 %	20 %	56695569
15240	NC_003911	CCG	2	6	690991	690996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695569
15241	NC_003911	CG	3	6	691098	691103	0 %	0 %	50 %	50 %	56695569
15242	NC_003911	CGA	2	6	691123	691128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695569
15243	NC_003911	TCA	2	6	691177	691182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695569
15244	NC_003911	GCATCG	2	12	691206	691217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56695569
15245	NC_003911	ATC	2	6	691247	691252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695569
15246	NC_003911	CGA	2	6	691255	691260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695569
15247	NC_003911	CGG	2	6	691313	691318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695569
15248	NC_003911	TCA	2	6	691350	691355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695569
15249	NC_003911	TCG	2	6	691419	691424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695569
15250	NC_003911	CAA	2	6	691450	691455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695569
15251	NC_003911	CGG	2	6	691473	691478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695569
15252	NC_003911	GCT	2	6	691480	691485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695569
15253	NC_003911	CT	3	6	691484	691489	0 %	50 %	0 %	50 %	56695569
15254	NC_003911	GC	3	6	691511	691516	0 %	0 %	50 %	50 %	56695569
15255	NC_003911	GCC	2	6	691573	691578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695569
15256	NC_003911	TGG	2	6	691683	691688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695569
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15258	NC_003911	TCG	2	6	691762	691767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695570
15259	NC_003911	CGC	3	9	691778	691786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695570
15260	NC_003911	CCG	2	6	691833	691838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695570
15261	NC_003911	CTG	2	6	691860	691865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695570
15262	NC_003911	TTC	2	6	691920	691925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695570
15263	NC_003911	GTG	2	6	691955	691960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15264	NC_003911	GACA	2	8	692035	692042	50 %	0 %	25 %	25 %	56695571
15265	NC_003911	ATC	2	6	692051	692056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695571
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15268	NC_003911	GCGG	2	8	692201	692208	0 %	0 %	75 %	25 %	56695571
15269	NC_003911	GCG	2	6	692252	692257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695571
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15271	NC_003911	CGG	2	6	692385	692390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695571
15272	NC_003911	GGCG	2	8	692392	692399	0 %	0 %	75 %	25 %	56695571
15273	NC_003911	GTG	2	6	692416	692421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695571
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15288	NC_003911	TGC	2	6	692862	692867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15290	NC_003911	CG	4	8	692899	692906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15291	NC_003911	AAC	2	6	692908	692913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15292	NC_003911	CGCCC	2	10	692954	692963	0 %	0 %	20 %	80 %	56695572
15293	NC_003911	TGC	2	6	693029	693034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695572
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15297	NC_003911	TGACC	2	10	693210	693219	20 %	20 %	20 %	40 %	56695572
15298	NC_003911	GC	3	6	693229	693234	0 %	0 %	50 %	50 %	56695572
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15300	NC_003911	CCCGG	2	10	693313	693322	0 %	0 %	40 %	60 %	56695572
15301	NC_003911	ATGCG	2	10	693345	693354	20 %	20 %	40 %	20 %	56695572
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15304	NC_003911	AAC	2	6	693463	693468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695572
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15311	NC_003911	CTG	2	6	693787	693792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695572
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15322	NC_003911	GC	4	8	694366	694373	0 %	0 %	50 %	50 %	56695572
15323	NC_003911	TGG	2	6	694379	694384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695572
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15326	NC_003911	GC	3	6	694460	694465	0 %	0 %	50 %	50 %	56695573
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15361	NC_003911	GGC	2	6	695686	695691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695574
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15366	NC_003911	GAT	2	6	695846	695851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695574
15367	NC_003911	CGG	4	12	695859	695870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695574
15368	NC_003911	CCA	2	6	695907	695912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695574
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15467	NC_003911	CGGG	2	8	699826	699833	0 %	0 %	75 %	25 %	56695576
15468	NC_003911	CAG	2	6	699836	699841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695576
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15473	NC_003911	CGGCC	2	10	700009	700018	0 %	0 %	40 %	60 %	56695576
15474	NC_003911	GAG	2	6	700020	700025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695576
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15477	NC_003911	GCGG	2	8	700159	700166	0 %	0 %	75 %	25 %	56695576
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15479	NC_003911	GC	4	8	700229	700236	0 %	0 %	50 %	50 %	56695576
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15482	NC_003911	GCA	2	6	700411	700416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695576
15483	NC_003911	CGG	2	6	700434	700439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695576
15484	NC_003911	GCG	2	6	700444	700449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695576
15485	NC_003911	CG	3	6	700448	700453	0 %	0 %	50 %	50 %	56695576
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15487	NC_003911	GCG	2	6	700533	700538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695576
15488	NC_003911	GCC	2	6	700557	700562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695576
15489	NC_003911	ATG	2	6	700595	700600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695576
15490	NC_003911	GGC	2	6	700646	700651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695576
15491	NC_003911	CG	3	6	700658	700663	0 %	0 %	50 %	50 %	56695576
15492	NC_003911	AGC	2	6	700689	700694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695576
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15496	NC_003911	GC	3	6	700814	700819	0 %	0 %	50 %	50 %	56695576
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15500	NC_003911	GAC	2	6	701036	701041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695577

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