MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_003911	CG	3	6	659181	659186	0 %	0 %	50 %	50 %	56695540
14502	NC_003911	CCG	2	6	659193	659198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695540
14503	NC_003911	GGC	2	6	659200	659205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695540
14504	NC_003911	TGG	2	6	659206	659211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695540
14505	NC_003911	CAA	2	6	659334	659339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695540
14506	NC_003911	CAC	2	6	659391	659396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695540
14507	NC_003911	AAC	2	6	659431	659436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695540
14508	NC_003911	CCG	2	6	659450	659455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695540
14509	NC_003911	GGC	2	6	659493	659498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695540
14510	NC_003911	GGA	2	6	659511	659516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695540
14511	NC_003911	CAC	2	6	659544	659549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695540
14512	NC_003911	CG	3	6	659585	659590	0 %	0 %	50 %	50 %	56695540
14513	NC_003911	CAA	2	6	659640	659645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695540
14514	NC_003911	GCTGG	2	10	659727	659736	0 %	20 %	60 %	20 %	56695540
14515	NC_003911	CTG	3	9	659779	659787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695540
14516	NC_003911	GCGCCC	2	12	659822	659833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695540
14517	NC_003911	CG	3	6	659863	659868	0 %	0 %	50 %	50 %	56695540
14518	NC_003911	TGC	2	6	659989	659994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695540
14519	NC_003911	CTG	2	6	659998	660003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695540
14520	NC_003911	GC	4	8	660062	660069	0 %	0 %	50 %	50 %	56695540
14521	NC_003911	GGC	2	6	660088	660093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695540
14522	NC_003911	GA	3	6	660278	660283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_003911	GCC	2	6	660317	660322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695541
14524	NC_003911	GCT	2	6	660338	660343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695541
14525	NC_003911	GAA	2	6	660377	660382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695541
14526	NC_003911	GGC	2	6	660383	660388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695541
14527	NC_003911	GACCA	2	10	660416	660425	40 %	0 %	20 %	40 %	56695541
14528	NC_003911	GCC	2	6	660491	660496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695541
14529	NC_003911	GC	3	6	660516	660521	0 %	0 %	50 %	50 %	56695541
14530	NC_003911	TCG	2	6	660528	660533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695541
14531	NC_003911	CGG	2	6	660547	660552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695541
14532	NC_003911	GC	3	6	660559	660564	0 %	0 %	50 %	50 %	56695541
14533	NC_003911	CGC	2	6	660598	660603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695541
14534	NC_003911	CGA	2	6	660610	660615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695541
14535	NC_003911	CGG	2	6	660619	660624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695541
14536	NC_003911	GC	3	6	660679	660684	0 %	0 %	50 %	50 %	56695541
14537	NC_003911	GCG	2	6	660696	660701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695541
14538	NC_003911	AGG	2	6	660726	660731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695541
14539	NC_003911	CGC	2	6	660812	660817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695541
14540	NC_003911	CCCG	2	8	660828	660835	0 %	0 %	25 %	75 %	56695541
14541	NC_003911	CG	3	6	660881	660886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14542	NC_003911	GCGCG	2	10	660889	660898	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14543	NC_003911	AG	3	6	660906	660911	50 %	0 %	50 %	0 %	56695542
14544	NC_003911	GCC	2	6	660914	660919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695542
14545	NC_003911	CTG	2	6	660934	660939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695542
14546	NC_003911	CAG	2	6	660967	660972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695542
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14548	NC_003911	GC	3	6	660990	660995	0 %	0 %	50 %	50 %	56695542
14549	NC_003911	CGG	2	6	661061	661066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695543
14550	NC_003911	CG	3	6	661094	661099	0 %	0 %	50 %	50 %	56695543
14551	NC_003911	GAA	2	6	661125	661130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695543
14552	NC_003911	CG	3	6	661195	661200	0 %	0 %	50 %	50 %	56695543
14553	NC_003911	TCC	2	6	661201	661206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695543
14554	NC_003911	CG	4	8	661232	661239	0 %	0 %	50 %	50 %	56695543
14555	NC_003911	CGC	2	6	661247	661252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695543
14556	NC_003911	GTA	2	6	661266	661271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695543
14557	NC_003911	ATG	2	6	661290	661295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695543
14558	NC_003911	TCA	2	6	661334	661339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695543
14559	NC_003911	CGC	2	6	661341	661346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695543
14560	NC_003911	CCA	2	6	661406	661411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695543
14561	NC_003911	AGCG	2	8	661507	661514	25 %	0 %	50 %	25 %	56695543
14562	NC_003911	GCG	2	6	661543	661548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695543
14563	NC_003911	GC	3	6	661644	661649	0 %	0 %	50 %	50 %	56695543
14564	NC_003911	TTG	2	6	661655	661660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695543
14565	NC_003911	GCC	2	6	661796	661801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695544
14566	NC_003911	GAC	2	6	661825	661830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695544
14567	NC_003911	GCGGGG	2	12	661885	661896	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	56695544
14568	NC_003911	GCG	2	6	661913	661918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695544
14569	NC_003911	TGC	2	6	661950	661955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695544
14570	NC_003911	GC	3	6	662000	662005	0 %	0 %	50 %	50 %	56695544
14571	NC_003911	GCT	2	6	662047	662052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695544
14572	NC_003911	CTGG	2	8	662068	662075	0 %	25 %	50 %	25 %	56695544
14573	NC_003911	GCG	2	6	662085	662090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695544
14574	NC_003911	TGC	2	6	662091	662096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695544
14575	NC_003911	CAGC	2	8	662185	662192	25 %	0 %	25 %	50 %	56695544
14576	NC_003911	GGT	2	6	662203	662208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695544
14577	NC_003911	TGG	2	6	662235	662240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695544
14578	NC_003911	GCA	2	6	662323	662328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695544
14579	NC_003911	GCC	2	6	662335	662340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695544
14580	NC_003911	GCG	2	6	662398	662403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695544
14581	NC_003911	GGGT	2	8	662409	662416	0 %	25 %	75 %	0 %	56695544
14582	NC_003911	CGA	2	6	662484	662489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695544
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14584	NC_003911	GGC	2	6	662548	662553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695544
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14587	NC_003911	CCTT	2	8	662816	662823	0 %	50 %	0 %	50 %	56695546
14588	NC_003911	GC	3	6	662838	662843	0 %	0 %	50 %	50 %	56695546
14589	NC_003911	GCGG	2	8	662851	662858	0 %	0 %	75 %	25 %	56695546
14590	NC_003911	CG	3	6	662893	662898	0 %	0 %	50 %	50 %	56695546
14591	NC_003911	GTT	2	6	663030	663035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695545
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14593	NC_003911	GAT	2	6	663090	663095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695545
14594	NC_003911	TCG	2	6	663157	663162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695545
14595	NC_003911	CGCC	2	8	663179	663186	0 %	0 %	25 %	75 %	56695545
14596	NC_003911	GCC	2	6	663212	663217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695545
14597	NC_003911	GCG	2	6	663235	663240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695545
14598	NC_003911	GGA	2	6	663284	663289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695545
14599	NC_003911	ACC	2	6	663301	663306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695545
14600	NC_003911	GCG	2	6	663411	663416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695545
14601	NC_003911	TCGG	2	8	663430	663437	0 %	25 %	50 %	25 %	56695545
14602	NC_003911	CG	3	6	663460	663465	0 %	0 %	50 %	50 %	56695545
14603	NC_003911	GC	3	6	663509	663514	0 %	0 %	50 %	50 %	56695545
14604	NC_003911	CCG	2	6	663572	663577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695545
14605	NC_003911	CCA	2	6	663584	663589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695545
14606	NC_003911	TGCG	2	8	663590	663597	0 %	25 %	50 %	25 %	56695545
14607	NC_003911	GCG	2	6	663632	663637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695545
14608	NC_003911	CCA	2	6	663673	663678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695547
14609	NC_003911	GGCGC	2	10	663696	663705	0 %	0 %	60 %	40 %	56695547
14610	NC_003911	CA	3	6	663718	663723	50 %	0 %	0 %	50 %	56695547
14611	NC_003911	GCC	2	6	663761	663766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695547
14612	NC_003911	CAGCAC	2	12	663812	663823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56695547
14613	NC_003911	GCCC	2	8	663848	663855	0 %	0 %	25 %	75 %	56695547
14614	NC_003911	ATCC	2	8	663863	663870	25 %	25 %	0 %	50 %	56695547
14615	NC_003911	CCT	2	6	663877	663882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695547
14616	NC_003911	GC	3	6	663902	663907	0 %	0 %	50 %	50 %	56695547
14617	NC_003911	CGG	2	6	663970	663975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695547
14618	NC_003911	GCCA	2	8	664042	664049	25 %	0 %	25 %	50 %	56695547
14619	NC_003911	GC	3	6	664079	664084	0 %	0 %	50 %	50 %	56695547
14620	NC_003911	GCG	2	6	664091	664096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695547
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14622	NC_003911	CGC	2	6	664261	664266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695547
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14624	NC_003911	ACC	2	6	664350	664355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695547
14625	NC_003911	CGA	2	6	664423	664428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695547
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14628	NC_003911	GCC	2	6	664496	664501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695547
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14637	NC_003911	GCC	2	6	664877	664882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695548
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14662	NC_003911	ACAT	2	8	665790	665797	50 %	25 %	0 %	25 %	56695549
14663	NC_003911	CTG	2	6	665894	665899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695549
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14696	NC_003911	GTGA	2	8	667458	667465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14697	NC_003911	CGG	2	6	667495	667500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695551
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14742	NC_003911	CGCC	2	8	669630	669637	0 %	0 %	25 %	75 %	56695554
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14992	NC_003911	CAT	2	6	679958	679963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695561
14993	NC_003911	TCG	2	6	679996	680001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695561
14994	NC_003911	TCA	2	6	680008	680013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695561
14995	NC_003911	CGGGG	2	10	680047	680056	0 %	0 %	80 %	20 %	56695561
14996	NC_003911	GCT	2	6	680123	680128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695561
14997	NC_003911	ATC	2	6	680256	680261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695561
14998	NC_003911	GCC	2	6	680286	680291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695561
14999	NC_003911	CGGG	2	8	680303	680310	0 %	0 %	75 %	25 %	56695561
15000	NC_003911	GAT	2	6	680351	680356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695561

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