MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 93706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_003911	GCCA	2	8	634051	634058	25 %	0 %	25 %	50 %	56698726
14002	NC_003911	GC	3	6	634095	634100	0 %	0 %	50 %	50 %	56698726
14003	NC_003911	CTG	2	6	634102	634107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14004	NC_003911	GGT	2	6	634131	634136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56698726
14005	NC_003911	GGC	3	9	634137	634145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56698726
14006	NC_003911	GCG	2	6	634217	634222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56698726
14007	NC_003911	CGGG	2	8	634242	634249	0 %	0 %	75 %	25 %	56698726
14008	NC_003911	TGC	2	6	634319	634324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14009	NC_003911	GCT	2	6	634332	634337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14010	NC_003911	GCA	2	6	634380	634385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14011	NC_003911	CTG	2	6	634426	634431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14012	NC_003911	GCC	2	6	634472	634477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56698726
14013	NC_003911	TGC	2	6	634487	634492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14014	NC_003911	GC	3	6	634542	634547	0 %	0 %	50 %	50 %	56698726
14015	NC_003911	TGCC	2	8	634569	634576	0 %	25 %	25 %	50 %	56698726
14016	NC_003911	GGC	2	6	634581	634586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56698726
14017	NC_003911	CAC	2	6	634611	634616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56698726
14018	NC_003911	CGC	2	6	634651	634656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56698726
14019	NC_003911	CGG	2	6	634709	634714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56698726
14020	NC_003911	CTG	2	6	634744	634749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698726
14021	NC_003911	CAT	2	6	634812	634817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56698726
14022	NC_003911	GCAAC	2	10	634856	634865	40 %	0 %	20 %	40 %	56698726
14023	NC_003911	TGG	2	6	634895	634900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56698726
14024	NC_003911	TGA	2	6	634995	635000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695527
14025	NC_003911	GGCCC	2	10	635070	635079	0 %	0 %	40 %	60 %	56695527
14026	NC_003911	GC	4	8	635147	635154	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
14027	NC_003911	CCG	2	6	635325	635330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695527
14028	NC_003911	TGCCGC	2	12	635340	635351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56695527
14029	NC_003911	GCG	2	6	635402	635407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695527
14030	NC_003911	TGC	2	6	635542	635547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695527
14031	NC_003911	GC	3	6	635557	635562	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
14032	NC_003911	GGC	2	6	635620	635625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695527
14033	NC_003911	TGC	2	6	635754	635759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695527
14034	NC_003911	GGC	2	6	635836	635841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695527
14035	NC_003911	GC	3	6	635874	635879	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
14036	NC_003911	CGC	5	15	635914	635928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695527
14037	NC_003911	GC	4	8	635949	635956	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
14038	NC_003911	CGG	2	6	636002	636007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_003911	A	6	6	636013	636018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_003911	GCG	2	6	636024	636029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_003911	ACC	2	6	636156	636161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_003911	TC	3	6	636171	636176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14043	NC_003911	CAG	2	6	636182	636187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_003911	CCCA	2	8	636237	636244	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14045	NC_003911	TC	3	6	636379	636384	0 %	50 %	0 %	50 %	56695528
14046	NC_003911	CGC	2	6	636485	636490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695528
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14048	NC_003911	TTG	2	6	636543	636548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695528
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14050	NC_003911	GCT	2	6	636585	636590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695528
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14052	NC_003911	CTG	2	6	636664	636669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695528
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14055	NC_003911	G	6	6	636812	636817	0 %	0 %	100 %	0 %	56695528
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14063	NC_003911	GCACC	2	10	637126	637135	20 %	0 %	20 %	60 %	56695528
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14066	NC_003911	AG	3	6	637225	637230	50 %	0 %	50 %	0 %	56695528
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14069	NC_003911	GC	4	8	637460	637467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_003911	CGT	2	6	637478	637483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14072	NC_003911	CTGGCG	2	12	637633	637644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56695529
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14075	NC_003911	CGGAG	2	10	637767	637776	20 %	0 %	60 %	20 %	56695529
14076	NC_003911	CCAC	2	8	637808	637815	25 %	0 %	0 %	75 %	56695529
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14086	NC_003911	CAC	2	6	638182	638187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695529
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14088	NC_003911	GTTCG	2	10	638416	638425	0 %	40 %	40 %	20 %	56695529
14089	NC_003911	GAT	2	6	638463	638468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695529
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14092	NC_003911	GC	3	6	638694	638699	0 %	0 %	50 %	50 %	56695529
14093	NC_003911	CGCC	2	8	638772	638779	0 %	0 %	25 %	75 %	56695530
14094	NC_003911	GA	3	6	638834	638839	50 %	0 %	50 %	0 %	56695530
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14099	NC_003911	CTG	2	6	639212	639217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695530
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14102	NC_003911	CCCG	2	8	639478	639485	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14103	NC_003911	ACCT	3	12	639559	639570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14104	NC_003911	CAA	2	6	639650	639655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_003911	GAA	2	6	639698	639703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_003911	GGC	2	6	639714	639719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_003911	CAT	2	6	639771	639776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_003911	GC	3	6	639980	639985	0 %	0 %	50 %	50 %	56695531
14109	NC_003911	TGC	2	6	640113	640118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695531
14110	NC_003911	TC	3	6	640130	640135	0 %	50 %	0 %	50 %	56695531
14111	NC_003911	CTTG	2	8	640153	640160	0 %	50 %	25 %	25 %	56695531
14112	NC_003911	ATG	2	6	640170	640175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695531
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14122	NC_003911	CGCA	2	8	640765	640772	25 %	0 %	25 %	50 %	56695531
14123	NC_003911	CA	3	6	640781	640786	50 %	0 %	0 %	50 %	56695531
14124	NC_003911	GGA	2	6	640873	640878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695531
14125	NC_003911	GATCG	2	10	640919	640928	20 %	20 %	40 %	20 %	56695531
14126	NC_003911	GCA	2	6	640933	640938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695531
14127	NC_003911	GAA	2	6	640946	640951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695531
14128	NC_003911	CTG	2	6	640961	640966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695531
14129	NC_003911	TGG	2	6	641152	641157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695531
14130	NC_003911	CGA	2	6	641169	641174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695531
14131	NC_003911	GC	4	8	641229	641236	0 %	0 %	50 %	50 %	56695531
14132	NC_003911	GCG	2	6	641250	641255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695531
14133	NC_003911	AGC	2	6	641272	641277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695531
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14135	NC_003911	TCCCA	2	10	641330	641339	20 %	20 %	0 %	60 %	56695531
14136	NC_003911	TGC	2	6	641451	641456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14137	NC_003911	GCG	2	6	641493	641498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14138	NC_003911	TGC	2	6	641566	641571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14139	NC_003911	AG	3	6	641590	641595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_003911	TGTA	2	8	641601	641608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14141	NC_003911	GCT	2	6	641612	641617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14142	NC_003911	ACGC	2	8	641709	641716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14143	NC_003911	GAC	2	6	641746	641751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14144	NC_003911	TGC	2	6	641795	641800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14145	NC_003911	TC	4	8	641855	641862	0 %	50 %	0 %	50 %	56695532
14146	NC_003911	TTG	2	6	641915	641920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695532
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14150	NC_003911	ATG	2	6	642230	642235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695532
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14155	NC_003911	TGA	2	6	642352	642357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695532
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14163	NC_003911	GC	3	6	642702	642707	0 %	0 %	50 %	50 %	56695532
14164	NC_003911	CGA	2	6	642819	642824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695532
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14193	NC_003911	TGC	2	6	644477	644482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14232	NC_003911	CTT	2	6	646302	646307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_003911	AAT	2	6	646311	646316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_003911	CAA	2	6	646321	646326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14235	NC_003911	GCC	2	6	646366	646371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14236	NC_003911	ACGC	2	8	646443	646450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14237	NC_003911	GCC	2	6	646478	646483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14238	NC_003911	GCAG	2	8	646580	646587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14239	NC_003911	TCCT	2	8	646588	646595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14240	NC_003911	CGT	2	6	646611	646616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14241	NC_003911	A	6	6	646620	646625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14242	NC_003911	CG	3	6	646645	646650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14243	NC_003911	GC	3	6	646699	646704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14244	NC_003911	ATC	2	6	646822	646827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14245	NC_003911	CGCA	2	8	646830	646837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14246	NC_003911	CCA	2	6	646856	646861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14247	NC_003911	CTGT	2	8	646872	646879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14248	NC_003911	GA	3	6	646885	646890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_003911	CAGA	2	8	646901	646908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14250	NC_003911	CGC	2	6	646946	646951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14251	NC_003911	CAC	2	6	646955	646960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14252	NC_003911	TCGTCC	2	12	646985	646996	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14253	NC_003911	TGC	2	6	647025	647030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14254	NC_003911	GGGA	2	8	647031	647038	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_003911	GCTGC	2	10	647060	647069	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14256	NC_003911	CGG	3	9	647111	647119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14257	NC_003911	GCC	2	6	647149	647154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14258	NC_003911	CTT	2	6	647191	647196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14259	NC_003911	TGT	2	6	647412	647417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_003911	GCT	2	6	647434	647439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14261	NC_003911	GAT	2	6	647486	647491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_003911	GGC	2	6	647513	647518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14263	NC_003911	CT	3	6	647527	647532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14264	NC_003911	TCCG	2	8	647624	647631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14265	NC_003911	CGCA	2	8	647864	647871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14266	NC_003911	ATG	2	6	647932	647937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14267	NC_003911	ATC	2	6	648048	648053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14268	NC_003911	CTC	2	6	648059	648064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14269	NC_003911	CATC	2	8	648065	648072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14270	NC_003911	GATT	2	8	648077	648084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14271	NC_003911	GAT	2	6	648137	648142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14272	NC_003911	TGACC	2	10	648157	648166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14273	NC_003911	ACGC	2	8	648278	648285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14274	NC_003911	CGA	2	6	648327	648332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14275	NC_003911	CAGG	2	8	648347	648354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14276	NC_003911	ATG	2	6	648392	648397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14277	NC_003911	ATC	2	6	648399	648404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14279	NC_003911	CCA	2	6	648419	648424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14280	NC_003911	GTGA	2	8	648489	648496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14281	NC_003911	GGC	2	6	648619	648624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695534
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14285	NC_003911	GT	3	6	649050	649055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14286	NC_003911	TGT	2	6	649096	649101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14287	NC_003911	CAT	2	6	649173	649178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14290	NC_003911	CTG	2	6	649214	649219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14291	NC_003911	AGCGC	2	10	649239	649248	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14292	NC_003911	GC	3	6	649308	649313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14293	NC_003911	GAT	2	6	649506	649511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14294	NC_003911	GGT	2	6	649529	649534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14295	NC_003911	GCC	2	6	649614	649619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14298	NC_003911	CTAG	2	8	649803	649810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14299	NC_003911	TGGCCA	2	12	649851	649862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14320	NC_003911	GCC	2	6	651173	651178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14327	NC_003911	CGG	2	6	651402	651407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14328	NC_003911	TCT	2	6	651499	651504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14330	NC_003911	ATG	2	6	651677	651682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14342	NC_003911	CT	3	6	652200	652205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14346	NC_003911	CTT	2	6	652268	652273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14347	NC_003911	AG	3	6	652334	652339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14348	NC_003911	CCTC	2	8	652346	652353	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14349	NC_003911	TCG	2	6	652378	652383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695536
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14363	NC_003911	CTGC	2	8	652909	652916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14364	NC_003911	CT	3	6	652966	652971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14365	NC_003911	GC	3	6	652991	652996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14366	NC_003911	GGT	2	6	653074	653079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695537
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14369	NC_003911	CTG	2	6	653216	653221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695537
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14371	NC_003911	CGGGG	2	10	653260	653269	0 %	0 %	80 %	20 %	56695537
14372	NC_003911	GC	3	6	653294	653299	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
14373	NC_003911	CGA	2	6	653341	653346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695537
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14376	NC_003911	GGGC	2	8	653458	653465	0 %	0 %	75 %	25 %	56695537
14377	NC_003911	CGG	2	6	653470	653475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695537
14378	NC_003911	GC	3	6	653527	653532	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
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14380	NC_003911	TGG	2	6	653612	653617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695537
14381	NC_003911	GAT	2	6	653632	653637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695537
14382	NC_003911	CG	3	6	653638	653643	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
14383	NC_003911	TGA	2	6	653694	653699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695537
14384	NC_003911	CG	3	6	653701	653706	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
14385	NC_003911	TGA	2	6	653718	653723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695537
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14444	NC_003911	CGCC	2	8	656420	656427	0 %	0 %	25 %	75 %	56695539
14445	NC_003911	TTC	2	6	656557	656562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695539
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14466	NC_003911	GC	3	6	657438	657443	0 %	0 %	50 %	50 %	56695539
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14471	NC_003911	GTC	2	6	657778	657783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695540
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14489	NC_003911	CG	3	6	658620	658625	0 %	0 %	50 %	50 %	56695540
14490	NC_003911	TGGC	2	8	658828	658835	0 %	25 %	50 %	25 %	56695540
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14495	NC_003911	ACC	2	6	658966	658971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695540
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14497	NC_003911	CAC	2	6	659023	659028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695540
14498	NC_003911	GCC	2	6	659051	659056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695540
14499	NC_003911	CGCC	2	8	659069	659076	0 %	0 %	25 %	75 %	56695540
14500	NC_003911	GC	3	6	659099	659104	0 %	0 %	50 %	50 %	56695540

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